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PROBLEMAS DE ELECTROFORESIS / M3 / FISICA PROBLEMAS DE ELECTROFORESIS 1.- Responda V o F, justificando su respuesta: a. La movilidad electroforética depende del pH del buffer de corrida, del campo eléctrico aplicado y de la temperatura. b. El aumento de la viscosidad del medio de corrida provoca un aumento en la distancia recorrida por un anfolito pero no modifica la movilidad del mismo. c. A pH constante, la movilidad electroforética disminuye cuando aumenta la fuerza iónica del buffer, pero el pI de la sustancia no se modifica. d. Cuando se realiza una electroforesis colocando una única tira en la cuba y Vab = 250 v, un aminoácido se desplaza 6 centímetros. Si en vez de una sola tira se hubiesen colocado dos tiras idénticas a la primera en dicha cuba, el aminoácido se hubiera desplazado 12 cm en las mismas condiciones. RESPUESTA: a) F; b) F; c) V; d) F 2.- Una macromolécula puede encontrarse en dos estados isoméricos. En el estado A adquiere forma esférica y en el B de prolato –forma de huevo-. Suponiendo que los grupos ionizables se encuentran en la superficie molecular en ambos estados: a. Compare sus movilidades a un determinado pH b. ¿Coinciden los pI de ambos estados isoméricos? c. Grafique –en un mismo par de ejes- movilidad en función de pH para ambas conformaciones moleculares. d. Grafique –en un mismo par de ejes- movilidad en función de pH para la conformación A si se usan dos series de buffers de distinta fuerza iónica tales que f i 2> fi 1. RESPUESTA: a) A > B; b) sí 3.- Se desea determinar el punto isoeléctrico de una proteína. Los datos experimentales obtenidos en las distintas corridas son: pH intensidad (mA) tiempo (minutos) distancia recorrida por la proteína (cm) 2.0 4.0 6.0 8.0 10.0 4.0 4.0 7.0 3.0 3.0 20 25 40 25 30 - 7.0 - 4.0 - 1.0 2.0 5.0 distancia recorrida por el dextrano (cm) 0.0 0.0 - 0.5 - 1.0 - 2.0 Longitud de cada tira = 20.0 cm. Resistencia de cada tira = 10 5 . Cátedra de Física-FFYB-UBA [1] PROBLEMAS DE ELECTROFORESIS / M3 / FISICA a. Determine el campo eléctrico aplicado en cada corrida. b. Calcule las movilidades de la proteína a cada pH. c. Calcule pI de la proteína. RESPUESTA: a) y b) pH Campo El. movilidad 2 20 -1.75 V/cm 10 m2 min-1 V-1 -6 4 20 -0.80 6 35 -0.04 8 15 0.80 10 15 1.56 c) PI = 6.07 4.- Se realizan corridas electroforéticas a distintos pH, de 3 de las siguientes sustancias: Sustancia A B C D E F pI 2.0 4.5 6.0 8.5 10.0 11.0 Si los esquemas correspondientes a las corridas realizadas son los siguientes: + 1 * 2 * 3 * - + pH = 5.0 2 * 1 * 2 + * - 3 * pH = 9.0 1 * 3 * - pH = 10.5 Determine a qué sustancias podrían corresponder las muestras 1, 2 y 3 (Desprecie el flujo electroendosmótico) RESPUESTA: muestra 1 sustancia D; muestra 2 sustancia A y muestra 3 sustancia F 5.- Se efectúa una electroforesis sobre papel de 3 sustancias -A, B y C-. El pI de A es 8.0 y C es un polianfolito con tres grupos carboxilo y un grupo amino en su estructura. En el esquema se han omitido los polos aplicados en los extremos de la tira. B * C * A * pH = 9.0 Cátedra de Física-FFYB-UBA [2] PROBLEMAS DE ELECTROFORESIS / M3 / FISICA Considerando que el tamaño molecular de las tres sustancias es aproximadamente el mismo: a. ¿Qué polo corresponde al extremo izquierdo? b. La sustancia A, a pH 9.0, ¿tiene carga neta positiva o negativa? Explique su migración hacia el cátodo. c. ¿Corresponde B a una especie química sin grupos ionizables? d. Estime el pI de B. Para responder, ¿es importante que el PM de las tres sustancias sea aproximadamente el mismo? RESPUESTA: a) positivo; b) negativa; efecto electroendosmótico; c) no; d) PI < 8; sí Cátedra de Física-FFYB-UBA [3]