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La revista Science publica un trabajo de investigación sobre el
genoma de un hongo en el que han participado dos profesores de la
UPNA
La investigación ha determinado la secuencia genómica de este organismo con
el objetivo conocer qué estrategias utiliza para degradar la lignina de la madera
La revista Science ha publicado un estudio sobre la secuenciación del genoma
del hongo Serpula lacrymans en el que han participado los profesores de la
Universidad Pública de Navarra Gerardo Pisabarro de Lucas y José Antonio Oguiza
Tomé, catedrático y titular de Microbiología, respectivamente. La investigación,
financiada en su mayor parte por el Departamento de Energía de Estados Unidos a
través del Joint Genome Institute (JGI) de California, ha sido realizada por un
consorcio internacional y tiene como objetivo conocer qué estrategias utiliza este
hongo para degradar la lignina de la madera. La eliminación de este componente de
los árboles es necesaria para la extracción de la celulosa, elemento con el que se
obtiene alcohol que se pretende utilizar para producir biocombustibles.
El Grupo de Investigación de Genética y Microbiología de la UPNA, dirigido por
la catedrática de Producción Vegetal Lucía Ramírez y al que pertenecen los dos
profesores citados, lidera dos proyectos en este mismo campo con el JGI de California
y participa en otros cuatro. El trabajo publicado por Science, revista científica
estadounidense con mayor impacto en el mundo, ha sido liderado por una universidad
del Reino Unido y ha contado con la participación de investigadores de EEUU,
Alemania, Inglaterra, Noruega, Francia, Suecia o España.
La investigación ha determinado la secuencia completa del genoma del S.
lacrymans, lo que ha permitido conocer cuáles son los mecanismos y herramientas
que utiliza este hongo para degradar la lignina, una especie de funda de plástico que
protege la celulosa de la madera. La secuenciación del genoma permite a los
investigadores conocer qué armas utiliza este hongo para degradar la lignina y cuáles
son los genes que emplean en este proceso. “Lo que buscamos con este estudio es
que este hongo ataque la lignina en nuestro propio beneficio de forma controlada”,
asegura Gerardo Pisabarro.
Utilización de la celulosa como biocombustible
La eliminación de la lignina para hacer accesible la celulosa de la madera se
puede hacer a través de tratamientos químicos, que son muy costosos y
contaminantes, o mediante tratamientos biológicos con hongos como el S. lacrymans.
La celulosa tiene varias utilidades, bien como componente de la madera de los
muebles o, una vez tratada, para hacer papel o tejidos de fibras naturales. En los
últimos años y, principalmente, debido a la búsqueda de alternativas a los
combustibles fósiles, se está estudiando la utilización de su glucosa para
transformarla en alcohol y producir biocombustibles.
Este proyecto está muy relacionado con otro que coordina Gerardo Pisabarro
con el Joint Genome Institute y que pretende comparar la expresión de los genomas
de 12 hongos para conocer qué estrategias utilizan para degradar la lignina de la
madera. El Grupo de Investigación de Genética y Microbiología está sometiendo a
Universidad Pública de Navarra. Servicio de Comunicación. Teléfono: 948 16 9007.
[email protected] . Web: http://www.unavarra.es
Correo electrónico:
estos hongos a las mismas condiciones para ver qué genes se expresan según la
situación en la que se encuentren. Esta técnica se conoce como transcriptómica
comparada y permite cuantificar y comparar el nivel de expresión de los genes de un
organismo. Este esfuerzo de determinación genómica comparada es muy importante
para conocer no sólo el funcionamiento de los hongos, sino también para avanzar en
el conocimiento del funcionamiento de otros organismos complejos y del desarrollo de
enfermedades. La pregunta científica que se pretende responder no es qué son
capaces de hacer los organismos (lo que se responde conociendo sus genes, en un
análisis genómico), sino cómo son capaces de hacerlo (lo que se responde
estudiando cómo utilizan sus genes mediante un estudio transcriptómico).
Por último, cabe también destacar que el equipo que conforma el Grupo de
Investigación de Genética y Microbiología ya lideró el proyecto de secuenciación del
genoma de la seta ostra, Pleurotus ostreatus, que es un organismo modelo para
procesos de degradación de madera con fines industriales.
Pamplona-Iruña, 28 de julio de 2011
Nota 1: Si desea ampliar esta información, puede ponerse en contacto con
Gerardo Pisabarro de Lucas en el teléfono 948 16 91 07 o a través del correo
electrónico [email protected]
Nota 2: Si desea una fotografía para completar la información, puede
descargarla en el sitio web de la Universidad Pública de Navarra
(http://www1.unavarra.es/actualidad/noticias).
Pie de foto: De izquierda a derecha: José A. Oguiza, Antonio G. Pisabarro,
Lucía Ramírez, José Luis Lavín, Gúmer Pérez y Manuel Alfaro, todos miembros
del Grupo de Investigación de Genética y Microbiología.
Universidad Pública de Navarra. Servicio de Comunicación. Teléfono: 948 16 9007.
[email protected] . Web: http://www.unavarra.es
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