Download Catálogo de Servicios ValGenetics 201 2017 Especialistas en Vida

Catálogo de Servicios ValGenetics
201
2017
Especialistas en Vida Vegetal
ValGenetics, laboratorio autorizado por la Conselleria de Agricultura, Medio
Ambiente, Cambio Climático y Desarrollo Rural (Generalitat Valenciana)
para el análisis de patógenos presentes, emergentes y de cuarentena,
apostando por la calidad ofrece:
 Servicios y análisis genéticos exclusivos y únicos amoldados al
mercado agrícola y biotecnológico de plantas.
 Equipo de técnicos e investigadores con gran experiencia científica.
 Desarrollos propios en I+D+i.
 Servicio de peritaje y asesoramiento técnico.
 Tratamiento eficaz y eficiente de las muestras.
 Trato personalizado y confidencial.
 Presupuesto adaptado.
2
Catálogo de Servicios ValGenetics 2017
Ciencia al servicio de la Agricultura
ValGenetics está desarrollando tecnología de aplicación agraria
constantemente. En nuestras instalaciones, situadas en el Parc
Científic de la Universitat de València, realizamos:

Análisis fitopatológicos mediante técnicas moleculares e inmunológicas.

Identificación de microorganismos mediante taxonomía molecular.

Análisis por secuenciación masiva de la microbiota en suelo, planta o agua.

Ensayos de poder patógeno.

Estudios de evaluación in vitro de fungicidas y bactericidas.

Secuenciación masiva y estudios bioinformáticos.

Análisis genéticos dirigidos a la diferenciación e identificación varietal.

Mejora de cultivos con la obtención de nuevas variedades.

Cultivo in vitro de plantas. Rejuvenecimiento y micropropagación.

Saneamiento de plantas madre siguiendo los esquemas de certificación
normalizados.

Pruebas de germinación de semillas.

Estudios de ploidía. Obtención de plantas triploides.

Ensayos de enraizamiento de plantas.

Transformación genética.

Desarrollo de productos, tecnología y proyectos I+D+i a la carta.
Catálogo de Servicios ValGenetics 2017
3
ÁREA FITOPATOLOGÍA
1.1. Servicio de diagnóstico fitopatológico
ValGenetics dispone de una amplia gama de plataformas diagnósticas. Aplicando los
protocolos de la normativa española o comunitaria (OEPP/EPPO), basados en métodos
moleculares (PCR, PCR a tiempo real, Bio-PCR, Multiplex-PCR) o inmunológicos (ELISA,
inmunoimpresión-ELISA, inmunofluorescencia) y siguiendo las normativas de calidad ISO
9001 y 17025, se pueden detectar e identificar los siguientes virus, viroides, bacterias,
fitoplasmas, hongos y oomycetes:
Vid
Solanáceas
Olivo
Ornamentales
Mango
Kiwi
Leguminosas
Hortícolas de hoja
Higos
Frutos rojos
Frutos secos
Frutales de pepita
Fresa
Espárrago
Cucurbitáceas
Cítricos
Cereales
Brassicas
Apiáceas
Frutales de hueso
Virus y viroides
Aliáceas
Alcachofas
Cultivo afectado
Alfalfa mosaic virus
Apple chlorotic leaf spot
virus
Apple mosaic virus
Arabis mosaic virus
Cherry leaf roll virus
Chrysanthemum stunt
viroid
Citrus bark cracking viroid
Citrus bent leaf viroid
Citrus dwarfing viroid
Citrus exocortis viroid
Citrus leaf blotch virus
Citrus psoriasis virus
Citrus tristeza virus
Citrus variegation virus
Citrus vein enation woodygall virus
Cucumber green mottle
mosaic virus
Cucumber leaf spot virus
Cucumber mosaic virus
Cucumber vein yellowing
virus
Cucurbit yellow stunting
disorder virus
Aliáceas (ajo, cebolla, chalote, puerro); Apiáceas (apio, eneldo, hinojo, perejil, zanahoria); Brassicas (col, col de bruselas, coliflor,
repollo); Cereales (cebada, centeno, maíz, trigo); Cucurbitáceas (calabaza, melón, pepino, sandía); Frutales de hueso (aguacate,
albaricoque, cereza, ciruelo, melocotón); Frutales de pepita (manzana, membrillo, pera); Frutos rojos (arándano, frambueso,
grosella); Hortícolas de hoja (acelgas, espinacas, lechuga, albahaca); Leguminosas (guisante, judía, lenteja); Solanáceas
(berenjena, patata, pimiento, tomate).
4
Catálogo de Servicios ValGenetics 2017
Vid
Solanáceas
Olivo
Ornamentales
Mango
Leguminosas
Kiwi
Hortícolas de hoja
Higos
Frutos secos
Frutos rojos
Frutales de pepita
Frutales de hueso
Fresa
Espárrago
Cítricos
Cucurbitáceas
Virus y viroides
Cereales
Apiáceas
Brassicas
Aliáceas
Alcachofas
Cultivo afectado
Grapevine fanleaf virus
Grapevine fleck virus
Grapevine leafroll
associated virus I
Grapevine leafroll
associated virus III
Grapevine virus A
Grapevine virus B
Hop stunt viroid
Iris yellow spot virus
Leek yellow stripe virus
Lettuce mosaic virus
Lettuce yellow mosaic
virus
Melon necrotic spot virus
Moroccan watermelon
mosaic virus
Onion yellow dwarf virus
Papaya ringspot virus
Peach latent viroid
Pepino mosaic virus
Pepper mild mottle virus
Pepper vein yellow virus
Plum pox virus
Potato spindle tuber
viroid
Potato Y virus
Prune dwarf virus
Prunus necrotic ringspot
virus
Raspberry bushy dwarf
virus
Raspberry ringspot virus
Shallot latent virus
Squash mosaic virus
Strawberry latent
ringspot virus
Strawberry mild yellow
edge virus
Tobacco mosaic virus
Aliáceas (ajo, cebolla, chalote, puerro); Apiáceas (apio, eneldo, hinojo, perejil, zanahoria); Brassicas (col, col de bruselas, coliflor,
repollo); Cereales (cebada, centeno, maíz, trigo); Cucurbitáceas (calabaza, melón, pepino, sandía); Frutales de hueso (aguacate,
albaricoque, cereza, ciruelo, melocotón); Frutales de pepita (manzana, membrillo, pera); Frutos rojos (arándano, frambueso,
grosella); Hortícolas de hoja (acelgas, espinacas, lechuga, albahaca); Leguminosas (guisante, judía, lenteja); Solanáceas
(berenjena, patata, pimiento, tomate).
Catálogo de Servicios ValGenetics 2017
5
Tobacco rattle virus
Tobacco ringspot virus
Tomato apex necrosis virus
Tomato black ring virus
Tomato bunchy top virus
Tomato chlorosis virus
Tomato leaf curl New Delhi virus
Tomato mosaic virus
Tomato ringspot virus
Tomato spotted wilt virus
Tomato torrado spp
Tomato yellow leaf curl virus
Watermelon mosaic virus
Zucchini yellow mosaic virus
Bacterias y fitoplasmas
Acidovorax citrulli
Agrobacterium rubi
Agrobacterium tumefaciens
Agrobacterium vitis
Aster yellows MLO
Candidatus liberibacter spp.
Candidatus liberibacter
solanacearum
Clavibacter michiganensis
subsp. michiganensis
Erwinia amylovora
Fitoplasma spp.
Pseudomonas spp.
Pseudomonas savastanoi
pv. nerii
Pseudomonas savastanoi
pv. savastanoi
Pseudomonas syringae
pv. actinidiae
Pseudomonas syringae
pv. aesculi
Ralstonia solanacearum
Rhodococcus fascians
Aliáceas (ajo, cebolla, chalote, puerro); Apiáceas (apio, eneldo, hinojo, perejil, zanahoria); Brassicas (col, col de bruselas, coliflor,
repollo); Cereales (cebada, centeno, maíz, trigo); Cucurbitáceas (calabaza, melón, pepino, sandía); Frutales de hueso (aguacate,
albaricoque, cereza, ciruelo, melocotón); Frutales de pepita (manzana, membrillo, pera); Frutos rojos (arándano, frambueso,
grosella); Hortícolas de hoja (acelgas, espinacas, lechuga, albahaca); Leguminosas (guisante, judía, lenteja); Solanáceas
(berenjena, patata, pimiento, tomate).
6
Catálogo de Servicios ValGenetics 2017
Vid
Solanáceas
Ornamentales
Olivo
Mango
Kiwi
Leguminosas
Higos
Hortícolas de hoja
Frutos rojos
Frutos secos
Frutales de hueso
Frutales de pepita
Fresa
Espárrago
Cítricos
Cereales
Brassicas
Aliáceas
Cucurbitáceas
Virus y viroides
Apiáceas
Alcachofas
Cultivo afectado
Bacterias y fitoplasmas
Vid
Solanáceas
Ornamentales
Olivo
Mango
Cucurbitáceas
Espárrago
Fresa
Frutales de hueso
Frutales de pepita
Frutos rojos
Frutos secos
Higos
Hortícolas de hoja
Kiwi
Leguminosas
Aliáceas
Apiáceas
Brassicas
Cereales
Cítricos
Alcachofas
Cultivo afectado
Spiroplasma citri (Stubborn)
Xanthomonas spp.
Xanthomonas arboricola
pv. pruni
Xanthomonas campestris
pv. campestris
Xanthomonas campestris
pv. vesicatoria
Xanthomonas citri subsp.citri
Xylella fastidiosa
Xylophilus ampelinus
Hongos y oomycetes
Alternaria spp.
Colletotrichum spp.
Didymella bryoniae
Eutypa lata
Fusarium graminearum
Fusarium oxysporum
Hongos de madera en vid
Hongos productores de
micotoxinas
Macrophomina phaseolina
Monilinia fructigena
Phytophthora spp.
Verticillium dahliae
Rhizoctonia solani
Rosellinia necatrix
Stemphylium vesicarium
Aliáceas (ajo, cebolla, chalote, puerro); Apiáceas (apio, eneldo, hinojo, perejil, zanahoria); Brassicas (col, col de bruselas, coliflor,
repollo); Cereales (cebada, centeno, maíz, trigo); Cucurbitáceas (calabaza, melón, pepino, sandía); Frutales de hueso (aguacate,
albaricoque, cereza, ciruelo, melocotón); Frutales de pepita (manzana, membrillo, pera); Frutos rojos (arándano, frambueso,
grosella); Hortícolas de hoja (acelgas, espinacas, lechuga, albahaca); Leguminosas (guisante, judía, lenteja); Solanáceas
(berenjena, patata, pimiento, tomate).
Las tarifas varían dependiendo del número de muestras, patógeno analizado y la técnica de
diagnóstico. Para consultar nuestros precios, tipos de análisis y bioensayos o la detección de
patógenos no detallados en este catálogo, contáctenos en los teléfonos +34 663855771 o +34
960059146 o vía email a [email protected]
Catálogo de Servicios ValGenetics 2017
7
1.2. Desarrollo de metodologías de detección de patógenos vegetales
Ofrecemos puesta a punto de metodologías de detección de patógenos (PCR, PCR a tiempo
real, BIO-PCR, Multiplex PCR, High Resolution Melting (HRM), inmunoimpresión-ELISA…)
ajustadas a las necesidades de las empresas agroalimentarias o biotecnológicas.
1.3. Servicio de evaluación in vitro de fungicidas y bactericidas
Realizamos la determinación in vitro del potencial de substancias químicas, extractos
vegetales o microorganismos antagonistas para el control de hongos y bacterias.
1.4. Ensayos de patogenicidad y test de resistencia a patógenos
Desarrollamos estudios de patogenicidad o de resistencia a hongos, bacterias y virus en
planta en condiciones controladas. Las plantas o semillas inoculadas se cultivan en sustratos
estériles para posteriormente analizar la aparición de síntomas y el contenido de patógenos
mediante técnicas moleculares.
8
Catálogo de Servicios ValGenetics 2017
1.5. Detección de células viables de microorganismos
Disponemos de tecnologías que permiten la detección de células viables de microorganismos
patógenos y no patógenos mediante técnicas de ADN, lo que aúna la especificidad y
sensibilidad de las técnicas basadas en la detección de ADN con la funcionalidad de detectar
solamente ADN que procede de células vivas.
1.6. Diagnóstico absoluto mediante taxonomía molecular
Aplicamos la taxonomía molecular (análisis bioinformático de la secuencia del gen del ARNr
16S para bacterias o del gen ARNr 18S (ITS) para hongos) mediante la secuenciación masiva
de todos los microorganismos componentes de una muestra. Estos estudios se aplican a la
certificación de la ausencia de patógenos en plantas madre, estudios de la composición de la
microbiota o análisis de la variación de la microbiota cuando se aplican biocidas o
fertilizantes.
1.7. Diagnóstico específico de variantes de una especie viral o microbiana
Realizamos el genotipado de cepas, razas o variantes genéticos de una misma especie viral o
microbiana, diagnosticando diferencialmente la variante patogénica mediante análisis
genéticos altamente específicos.
Catálogo de Servicios ValGenetics 2017
9
ÁREA GENÉTICA
Genética Vegetal
2.1. Identificación y diferenciación varietal
Obtenemos marcadores moleculares específicos para especies y variedades de plantas y los
empleamos para detectar polimorfismos a nivel de ADN, permitiendo la identificación
varietal de forma precisa y la determinación de pureza varietal en semillas.
2.2. Asistencia en proyectos de mejora vegetal
Ofrecemos asesoramiento y desarrollo de marcadores moleculares proporcionando un
servicio completo de genotipado de las nuevas variedades de plantas. La huella digital de
ADN permite la protección de los derechos del obtentor.
2.3. Obtención de nuevas variedades mediante irradiación de tejidos
vegetales
El uso de radiaciones ionizantes aumenta la variabilidad, lo que puede estimular rasgos
agronómicos de interés en programas de mejora genética para la obtención de nuevas
variedades vegetales. Implementamos el proyecto de mejora vegetal completo.
10
Catálogo de Servicios ValGenetics 2017
Genética Microbiana
3.1. Identificación de hongos, bacterias y virus por taxonomía molecular
La identificación del patógeno se lleva a cabo mediante la secuenciación tipo Sanger o tipo
metagenómica de un fragmento de ADN o ARN. Igualmente, se realizan análisis genómicos
de microorganismos empleando la secuenciación masiva (Plataforma MiSeq® o NextSeq ® de
Illumina).
3.2. Caracterización de comunidades microbianas de muestras complejas
Todos los microorganismos presentes en muestras de suelo, agua o cultivos vegetales
enfermos se pueden identificar de forma conjunta en un único análisis mediante la
secuenciación masiva de todo el ADN presente en la muestra y posterior análisis
bioinformático. De este modo se pueden determinar las especies de microorganismos
patológicos y beneficiosos, así como la concentración de los mismos en la muestra.
Catálogo de Servicios ValGenetics 2017
11
ÁREA BIOTECNOLOGÍA VEGETAL
4.1. Saneamiento y propagación
El saneamiento in vitro de plantas madre de variedades vegetales seleccionadas permite la
recuperación y posterior propagación de plantas sanas, libres de patógenos (virus, bacterias,
hongos), los cuales causan una reducción del vigor y de la producción del cultivo.
Cultivo
Adelfa
(Nerium oleander)
Chufa
(Cyperus esculentus
Cítricos
(Citrus)
Dracaena
(Dracaena, Cordyline)
Fresa
(Fragaria sp.)
Frambuesa
(Rubus idaeus)
Granado
(Punica granatum)
Kiwi
(Actinidia deliciosa)
Planta crasa
(Crassulaceae,
Portulacaceae…)
Vid
(Vitis vinifera)
Zarzamora
(Rubus sp.)
Servicio1
Saneamiento
Propagación
√
√
√
√
√
√
√
√
√
√
√
√
√
√
√
√
√
√
√
√
√
√
Plazo de entrega
De 6 meses a 1 año
(consultar en cada caso
concreto)
1 Se
enumeran los cultivos ya ensayados en nuestro laboratorio pero ofrecemos la posibilidad de realizar el
servicio en cualquier cultivo.
12
Catálogo de Servicios ValGenetics 2017
4.2. Ensayos de viabilidad in vitro
En ciertos casos, es conveniente plantear ensayos iniciales in vitro para establecer la
viabilidad de proyectos más amplios con determinadas especies vegetales. Esto permite
acotar las condiciones de cultivo y alcanzar con mayor facilidad el objetivo planteado por el
cliente.
4.3. Pruebas de germinación
Analizamos la calidad de los lotes de semillas mediante pruebas de germinación ex vitro o in
vitro, para determinar el vigor, la pureza y la calidad de la semilla de cada lote, según
normativa ISTA.
4.4. Rescate de embriones
En el caso de semillas con bajas posibilidades de germinación ex vitro o para la recuperación
de todos los embriones de semillas poliembriónicas, realizamos el rescate y germinación de
embriones individualizados in vitro.
4.5. Ensayos de microinjerto
Mediante ensayos in vitro de microinjerto podemos comprobar la compatibilidad en el
injerto patrón-variedad y además acelerar o incluso abaratar la obtención de planta.
Catálogo de Servicios ValGenetics 2017
13
4.6. Ensayos de enraizamiento
En determinados genotipos puede resultar necesario realizar una propagación de planta por
enraizamiento in vitro, por ser inviable la propagación vegetativa o la propagación por
semilla.
4.7. Análisis de la viabilidad del polen
Podemos evaluar el porcentaje de viabilidad del polen mediantes distintas técnicas. Además,
esta metodología se puede aplicar en programas de mejora genética dirigida a obtención de
frutas sin semilla, ya que la generación de semillas se puede valorar analizando el polen
antes de que la variedad fructifique, acelerando el proceso de análisis en invernadero.
4.8. Análisis de ploidía
La determinación precoz de la ploidía mediante citometría de flujo permite identificar, en
programas de mejora de plantas, los individuos con diferente grado de ploidía.
4.9. Transformación genética
La transformación genética de plantas consiste en la transferencia de genes foráneos al
genoma de una especie vegetal determinada. Esta técnica es útil para el estudio funcional de
genes específicos o para la producción estable de metabolitos o proteínas en planta.
ValGenetics dispone de la autorización oficial para el uso confinado de OMG, que le permite
implementar la mejora genética de plantas.
14
Catálogo de Servicios ValGenetics 2017
ÁREA PROYECTOS I+D+i
5. Servicios I+D+i a la carta
Acometemos proyectos de investigación y desarrollo empleando o combinando las
técnicas disponibles en nuestros servicios de diagnóstico fitopatológico, taxonomía
molecular, genética, biotecnología y cultivo de tejidos de plantas. Implementamos
proyectos aplicados a la carta, exclusivos y adaptados a las necesidades de los clientes,
con resultados rápidos y fiables a precios competitivos.
El equipo científico de ValGenetics cuenta con más de 25 años de experiencia científica en
el campo de la biotecnología de plantas, genética y el diagnóstico y control de los
patógenos vegetales. Además, disponemos de un grupo interdisciplinar de asesores
científicos internacionales.
Nuestros laboratorios disponen de medios técnicos para el manejo de metodologías de
investigación científica, desde las clásicas de análisis del material genético y cultivo de
tejidos de plantas hasta las más punteras de genómica (secuenciación masiva),
transcriptómica y proteómica, además de la expresión de sustancias de interés en plantas o
edición de genomas.
Así ofrecemos:

Implementar proyectos adaptados a la problemática agraria planteada y
adaptados a las necesidades del cliente.

Posibilidad de cubrir todos los aspectos del control de patógenos y plagas desde el
diagnóstico del patógeno a la obtención de plantas madres sanas o la protección
del obtentor de nuevas variedades de planta.
Catálogo de Servicios ValGenetics 2017
15
Especialistas en Vida Vegetal
VALGENETICS S.L.
Agustín Escardino, 9, Parc Científic UV, Edificio 3 CUE
46980 Paterna (Valencia). Tel: +34 663855771 /+34 960059146
[email protected]
www.valgenetics.com
Laboratorio autorizado por el Servicio de Sanidad Vegetal de la Conselleria de
Agricultura, Medio Ambiente, Cambio Climático y Desarrollo Rural (Generalitat
Valenciana) para las actividades amparadas por el RD 58/2005.
ValGenetics dispone de la autorización oficial de la Conselleria de Agricultura Medio
Ambiente, Cambio Climático y Desarrollo Rural para el uso confinado de OMG
expedida por el Comité Valenciano de Control de OMG.
16
Catálogo de Servicios ValGenetics 2017