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Departamento de Fisioloxía Vexetal Facultade de Bioloxía Actividades glicosidasas sobre el xiloglucano de la pared celular de Arabidopsis thaliana Natalia Iglesias Méndez Santiago de Compostela, 2008 UNIVERSIDADE DE SANTIAGO DE COMPOSTELA FACULTADE DE BIOLOXÍA DEPARTAMENTO DE FISIOLOXÍA VEXETAL Actividades glicosidasas sobre el xiloglucano de la pared celular de Arabidopsis thaliana Memoria que presenta para optar al grado de Doctora en Biología NATALIA IGLESIAS MÉNDEZ Santiago de Compostela, 2008 Los doctores D. Ignacio Zarra Cameselle, catedrático de Fisiología Vegetal de la Universidad de Santiago de Compostela, y Dña. Gloria Revilla López, profesora titular del Departamento de Fisiología Vegetal de la Universidad de Santiago de Compostela CERTIFICAN QUE: D. Natalia Iglesias Méndez realizó bajo nuestra dirección, en el Departamento de Fisiología Vegetal de la Facultad de Biología (Universidad de Santiago de Compostela), el trabajo titulado “Actividades glicosidasas sobre el xiloglucano de la pared celular de Arabidopsis thaliana”, que presenta para optar al grado de Doctora en Biología. El Director La Directora Fdo: Ignacio Zarra Cameselle Fdo: Gloria Revilla López La Doctoranda Fdo: Natalia Iglesias Méndez Capítulo I: Introducción general I.1. Introducción general………………………………………………………………………….1 I.2. Objetivos……………………………………………………………………………………..28 Capítulo II: β-glucosidasas de Arabidopsis thaliana II.1. Introducción………………………………………………………………………………...31 II.2. Materiales y métodos……………………………………………………………………….33 II.2.1. Material vegetal……………………………………………………………..........33 II.2.2. Análisis filogenético……………………………………………………………...35 II.2.3. Extracción de RNA total…………………………………………………...…….35 II.2.4. Síntesis de cDNA…………………………………………………………………36 II.2.5. PCR semi-cuantitativa en tiempo real…………………………………………..36 II.2.6. Obtención del extracto apoplástico……………………………………………...38 II.2.7. Preparación de XXXG……………………………………………..……………..38 II.2.8. Actividad apoplástica frente a XXXG……………………………………………38 II.2.9. Siembra de mutantes……………………………………………………………..39 II.2.10. Análisis de paredes celulares de hojas………………………………………….39 II.2.11. Análisis de oligosacáridos de xiloglucano: MALDI-TOF MS………………….40 II.2.12. Análisis de componentes principales…………………………………………..40 II.3. Resultados y discusión……………………………………………………………………...41 II.3.1. β-glucosidasas de la familia 3 de las glicosil hidrolasas en Arabidopsis thaliana…………………………………………………………………………………………...41 II.3.2. PCR semi-cuantitativa en tiempo real…………………………………………..43 II.3.3. Actividad apoplástica frente a XXXG……………………………………………45 II.3.4. Análisis de mutantes knockout mediante MALDI-TOF MS…………………...47 II.3.5. Análisis de componentes principales………………………………………........49 Capítulo III: Estudio de mutantes knockout de las β-glucosidasas de Arabidopsis thaliana III.1. Introducción………………………………………………………………………………..55 III.2. Materiales y métodos………………………………………………………………………57 III.2.1. Material biológico utilizado…………………………………………………….57 III.2.2. Actividad β-glucosidasa frente a xiloglucano…………………………………..57 III.2.3. Extracción de DNA……………………………………………………………...58 III.2.4. Análisis de los mutantes mediante PCR………………………………………..58 III.2.5. Niveles de transcritos…………………………………………………………...60 III.2.6. Análisis fenotípico de los mutantes seleccionados…………………………..…60 III.2.7. Amplificación de la región promotora de los genes de interés………………..61 III.2.8. Clonación en el vector pCambia 1381z T-DNA………………………………..61 III.2.9. Transformación de Agrobacterium tumefaciens por electroporación…...........63 III.2.10. Transformación de Arabidopsis thaliana…………………………………...…64 III.2.11. Selección y cultivo de plantas………………………………………………....64 III.2.12. Tinción y fijado de las muestras………………………………………….........64 III.2.13. Fijación e inclusión de muestras para microscopía…………………………...65 III.3. Resultados y discusión……………………………………………………………………..66 III.3.1. Actividad de los mutantes knockout frente al sustrato XXXG………………...66 III.3.2. Análisis del mutante Atbglc1 4D mediante PCR…………………………........69 III.3.3. Expresión del gen AtBGLC2 en el mutante Atbglc1 4D……………………….71 III.3.4. Análisis fenotípico de los mutantes del gen AtBGLC1………………………...72 III.3.5. Análisis de expresión de los genes AtBGLC1 y AtBGLC2……………………..75 III.3.6. Fenotipo histológico del mutante Atbglc1 4D……………………………........77 Capítulo IV: β-galactosidasas de Arabidopsis thaliana IV.1. Introducción………………………………………………………………………….........85 IV.2.Materiales y métodos………………………………………………………………….........88 IV.2.1. Árbol filogenético de las β-galactosidasas……………………………………...88 IV.2.2. Material vegetal……………………………………………………………........88 IV.2.3. PCR semi-cuantitativa en tiempo real…………………………………….........91 IV.2.4. Obtención del extracto apoplástico…………………………………………….92 IV.2.5. Preparación de sustratos: XLLG y XLFG……………………………………….92 IV.2.6. Análisis de paredes celulares de hojas………………………………………….93 IV.2.7. Análisis de oligosacáridos mediante MALDI-TOF…………………………….94 IV.2.8. Análisis de componentes principales…………………………………………...94 IV.2.9. Análisis de la actividad β-galactosidasa de los mutantes…………………........94 IV.2.10. Análisis fenotípico de los mutantes seleccionados……………………………95 IV.2.11. Análisis bioinformático de expresión de las diferentes β- galactosidasas…………………………………………………………………………….96 IV.3. Resultados y discusión……………………………………………………………………..97 IV.3.1. β-galactosidasas de la familia 35 de las glicosil hidrolasas de Arabidopsis thaliana…………………………………………………………………………...……...97 IV.3.2. Análisis bioinformático de expresión de las β-galactosidasas de Arabidopsis thaliana……………………………………………………………………………..........98 IV.3.3. PCR semi-cuantitativa en tiempo real…………………………………...........101 IV.3.4. Análisis de los mutantes knockout de β-galactosidasas mediante MALDI-TOF ………………………………………………………………………………….103 IV.3.5. Análisis de componentes principales………………………………………….105 IV.3.6. Análisis mediante MALDI-TOF de la actividad β-galactosidasa……………..106 IV.3.7. Análisis fenotípico de los mutantes seleccionados……………………………111 Capítulo V: Discusión general………………………………………………………………….119 Capítulo VI: Conclusiones……………………………………………………………..……….126 Bibliografía……………………………………………………………………………………...131 General ral Capítulo I: Introducción Gene Capítulo I: Introducción General I.1. Introducción general las células adyacentes se unen, esta extensión Pared Celular Vegetal coordinada es necesaria. En principio el Las células de las plantas están rodeadas por mecanismo de extensión de la pared está una resistente, flexible y polimérica pared que determinado genéticamente, pero además, debe determina su forma (Bacic y col., 1988) y su ser capaz de responder a cambios ambientales, tamaño. Les permite soportar una alta presión para que la planta pueda adaptarse a las para que puedan desarrollarse y les confiere condiciones variables de su entorno. importantes propiedades mecánicas, La pared celular es la principal estructura contribuyendo a mantener la integridad de la implicada en procesos de crecimiento celular planta completa. De hecho, las propiedades en plantas, puesto que en ella se llevan a cabo físicas de los distintos tejidos vegetales están los procesos de incorporación y reorganización determinadas la de nuevos materiales, y está formada por una composición y estructura de sus paredes serie de capas. La primera que se forma es la celulares. lámina media, constituida por polisacáridos en gran medida por Aunque inicialmente se consideró la pared pécticos y responsable de la unión entre las celular como una estructura rígida e inerte, con células. Posteriormente entre la lámina media posterioridad se comprobó que puede estar y la membrana plasmática se deposita la pared implicada en gran cantidad de procesos celular primaria, que se forma en los estados dinámicos. La presión osmótica aporta rigidez a juveniles y posee capacidad de extensión, las células mediante la tensión que crea sobre la incrementando pared. Cada célula está adherida a la adyacente durante el crecimiento celular (Hayashi, 1989). mediante que En algunos tipos celulares especializados se normalmente evitan que las células se separen deposita una tercera capa por debajo de la bajo presiones elevadas. Las paredes celulares pared celular primaria que es la pared celular son capaces de llevar a cabo modificaciones secundaria, más rígida y que ya no posee controladas que permitan a la célula crecer de capacidad de crecimiento (Brett y Waldron, forma polarizada. Debido a que las paredes de 1996) (Fig. I.1). polisacáridos pécticos rápidamente su superficie 1 Capítulo I: Introducción General Figura I.1. Disposición de la pared celular primaria, lámina media y pared celular secundaria. Adaptado de http://www.biologia.edu.ar Ambos tipos de pared difieren además en su composición, ya que la pared celular que la pared aporta fuerza, extensibilidad y capacidad de modulación a la célula. primaria está compuesta mayoritariamente por celulosa, hemicelulosas, pectinas y en menor Pared Celular Primaria proporción proteínas y bajos niveles de lignina, La pared celular primaria de dicotiledóneas en cambio, la pared celular secundaria presenta tipo I, como Arabidopsis thaliana, se define diferente composición dependiendo del tejido como una estructura polimérica y altamente al que pertenezca, y en general presenta altos organizada formada por una red tridimensional niveles de lignina, que le aporta rigidez. Por lo de microfibrillas de celulosa embebidas en una tanto, para estudiar el crecimiento de las matriz compleja y altamente hidratada de células vegetales debemos centrarnos en la polisacáridos pared celular primaria, debido a su capacidad proteínas (estructurales y enzimáticas), y de extenderse bajo la acción de la presión de fenoles. En algunos tipos celulares turgencia permitiendo el incremento del especializados también están presentes volumen celular. Se puede afirmar entonces sustancias como la lignina, cutina, suberina o (hemicelulosas sílice (Fry, 2004) (Fig. I.2). 2 y pectinas), Capítulo I: Introducción General Figura I.2. Estructura de la pared celular primaria, se muestra la unión entre las cadenas de XyG (rojo) y las microfibrillas de celulosa (lila), además de la red de pectinas (amarillo) y de proteínas fibrilares (negro) y solubles (circulares). En general, que puentes de calcio entre las cadenas de aproximadamente el 90% del peso seco de las homogalacturonano (Jarvis, 1984) o puentes paredes celulares primarias correspondería a los difenil entre arabinogalactanos. polisacáridos se considera (celulosa, y Entre las funciones de la pared primaria en pectinas) mientras que el 10% restante las células vegetales, está la de conferir correspondería a las proteínas (estructurales y protección mecánica a la célula, regulando al enzimáticas). Las microfibrillas de celulosa está mismo tiempo su forma y su volumen (Bacic y interconectadas de polisacáridos col., 1988). Constituye un soporte físico, hemicelulósicos como el xiloglucano (XyG) o el aportándole a la célula cierto grado de rigidez arabinoxilano red (Taiz, 1984). Actúa como defensa frente al Gibeaut, ataque de patógenos y como barrera reguladora a través dando celulosa/hemicelulosa 1993). Existe polisacáridos hemicelulosas otra pécticos lugar (Carpita red a una y formada por (homogalacturonano, de procesos de transporte (Goldberg, 1985). Puede actuar además como lugar de ramnogalacturonano I y ramnogalacturonano almacenamiento de reservas (Reid, 1984), o II y arabinogalactanos), que contribuyen a la como fuente de moléculas con actividad rigidez de la pared mediante enlaces por biológica (Ryan, 1990). 3 Capítulo I: Introducción General Celulosa lineales (Delmer, 1999), con un diámetro de La celulosa es el componente mayoritario entre 5 y 15 nm (Mccann y col., 1990b). No se de las paredes celulares de las plantas conoce con exactitud la longitud de las superiores, se estructura en forma de cadenas microfibrillas de celulosa, puesto que es lineales no ramificadas constituidas por restos variable, de glucosa unidos mediante enlaces β(1-4), con contienen más de 14000 unidades de glucosa, una rotación de 180° entre un resto y el lo que correspondería a una microfibrilla de siguiente, estabilizados mediante puentes de aproximadamente 7 μm (Fig. I.3). pero algunos glucanos simples hidrógeno intramoleculares. Estas cadenas La biosíntesis de celulosa tiene lugar en la lineales de glucosa se disponen paralelamente superficie externa de la membrana plasmática, unidas entre si mediante puentes de hidrógeno catalizada por un complejo multienzimático dando lugar a microfibrillas, cada una de las que consta de 6 subunidades en forma de roseta cuales tiene aproximadamente 36 cadenas (Fig. I.4). Figura I.3. Estructura de las microfibrillas de celulosa, formadas por restos de glucosa, que forman parte de pared celular. Adaptado de http://www.ualr.edu 4 Capítulo I: Introducción General Figura I.4. Las microfibrillas de celulosa son sintetizadas por complejos enzimáticos situados en la membrana plasmática. Estos complejos están formados por moléculas de celulosa sintasa que se disponen formando rosetas embebidas en la membrana. Las microfibrillas se van alargando por el extremo por el que están unidas a las rosetas. Las rosetas a su vez, se mueven por la membrana guiadas por microtúbulos que se encuentran en la cara interior de esta. Cada subunidad estaría formada a su vez su unión con los microtúbulos para que puedan por seis celulosa sintasas, capaces de utilizar ser guiados a lo largo de la membrana (Lloyd y UDP-glucosa como sustrato y unirlo al extremo Chan, 1989). Cada una de las proteínas CesA no reductor de la cadena de β-glucano (Brown que constituye una roseta sintetizaría las 6 y Saxena, 2000). Con 36 subunidades, cada cadenas de glucano simultáneamente, de roseta podría producir 36 cadenas de celulosa manera, que a partir de cada roseta se simultáneamente, que se organizarían a la formarían las 36 cadenas mencionadas (Brown salida de la roseta para dar lugar a la y Saxena, 2000). Es posible que hemicelulosas microfibrilla. A finales de los 90 fueron como identificados los genes de la celulosa sintasa microfibrillas (CesA) (Pear y col., 1996), en Arabidopsis provocando regiones desordenadas (Hayashi, thaliana. La familia CesA cuenta con 10 genes, 1989). que se expresan en distintos tejidos y tipos recientes iniciaría la cadena de glucano es un celulares. Estas están esterol-glucósido que funcionaría como aceptor embebidas en plasmática inicial para la elongación de la cadena. Los formando las agrupaciones hexagonales que esteroles son componentes lipídicos de las dan lugar a las denominadas rosetas (Kimura y membranas celulares vegetales y los esterol-β- col., 1999). Los complejos celulosa sintasa glucósidos son comúnmente sintetizados en las deben contener otras proteínas que favorezcan membranas plasmáticas, donde las proteínas proteínas la CesA membrana el La XyG sean atrapadas durante molécula que su en las formación, según estudios 5 Capítulo I: Introducción General CesA pueden usar un esterol-glucósido y irregular. Por lo tanto la localización de las uridina 5’-difosfato-Glc para formar glucanos microfibrillas no es al azar sino funcional, ya cortos unidos a esterol (Peng y col., 2002). Esta que un alineamiento perpendicular de las teoría se ve apoyada por el hecho de que mismas es propicio para un crecimiento defectos en la síntesis de esterol provocan una longitudinal de la célula (Carpita y Gibeaut, reducción en el contenido de celulosa de la 1993). Es probable que la disposición de las pared (Schrick y col., 2004). microfibrillas sea producto de la interacción de Para que la síntesis de celulosa se lleve a los microtúbulos con el complejo de la celulosa cabo de forma correcta es imprescindible una sintasa, ya que los microtúbulos suelen actividad de edición, que realiza una endo-1,4- encontrarse dispuestos perpendicularmente a β-glucanasa denominada las zonas de elongación celular, de forma que KORRIGAN (Zuo y col., 2000). Aunque su serían los responsables de guiar a las celulosa función no se conoce con exactitud, se ha sintasas propuesto que es necesaria para la correcta moléculas de celulosa. Esto explicaría que las terminación de la cadena una vez sintetizada, microfibrillas se dispongan en la misma liberando un oligo precursor unido a la dirección que los microtúbulos, es decir, membrana lipídica (Gillmor y col., 2002). Los perpendicular al eje de crecimiento (Delmer, mutantes kor tienen defectos en la citoquinesis 1999). de membrana a medida que estas sintetizan y elongación celular y a pesar de que sintetizan β(1-4)glucano este no cristaliza de forma Hemicelulosas correcta en la microfibrilla. Pese a esto, la Las hemicelulosas son polisacáridos proteína no está asociada a las rosetas (Zuo y formados por una cadena lineal relativamente col., 2000) y los mutantes kor tienen niveles larga sobre la que aparecen distintas cadenas normales de esterol-glucósido (Robert y col., laterales relativamente cortas. Pueden unirse a 2004). las microfibrillas de celulosa mediante puentes Las microfibrillas de celulosa se disponen de hidrógeno. Entre las hemicelulosas de forma diferente dependiendo del tipo presentes en la pared celular, están los xilanos celular, así, en células de tallos y raíces que son (como el arabinoxilano), el xiloglucano, y el alargadas, glucano mixto que está presente sólo en presentan una disposición perpendicular al eje de crecimiento y paralela entre si, sin embargo en células isodiamétricas las microfibrillas 6 se disponen de forma gramíneas. Capítulo I: Introducción General El Xiloglucano tienen cuatro glucosas, aunque en algunas El Xiloglucano (XyG) es la hemicelulosa especies aparecen oligosacáridos con dos o más abundante en las paredes celulares cuatro glucosas (Hoffman y col., 2005). primarias de dicotiledóneas como Arabidopsis Algunos de los residuos de xilosa unen a su vez thaliana. galactosa, y estos a su vez, pueden tener unida Está formado por glucosas unidas mediante fucosa (Hayashi y col., 1980; Hayashi y un enlace β(1-4) formando una cadena lineal Maclachlan, 1984; O´Neill y Selvendran, 1983; con una longitud de entre 300 y 3000 unidades Nishitani y Masuda, 1982, 1983). de glucosa (Fry, 1989). La mayoría de los restos En la nomenclatura abreviada de los de glucosa están unidos a restos de xilosa oligosacáridos se utiliza una letra para cada mediante enlace α(1-6), lo que impide la glucosa de eje principal, que indica la cadena formación de microfibrillas. Estas cadenas lateral que lleva unida (Fry y col., 1993). Por laterales convenio, general no aparecen aparecen tres aleatoriamente, restos de en glucosa sustituidos y el cuarto resto sin sustituir la nomenclatura de los oligosacáridos empieza siempre por el extremo no reductor (Tabla I.1). (Vincken y col., 1997) (Fig. I.5). De este modo la actividad de las endo-β-(14)glucanasas da lugar a la formación de oligosacáridos de xiloglucano que normalmente XXXG Glucosa Galactosa Xilosa Fucosa XXFG XLFG XXG Figura I.5. Estructura de la molécula de xiloglucano, se muestran los oligosacáridos más comunes resultado de la actividad hidrolítica de las β(1→4)-glucanasas. En la parte inferior aparecen los oligosacáridos más abundantes que se obtienen tras la digestión del xiloglucano de guisante con endoglucanasa, con su correspondiente nomenclatura abreviada. 7 Capítulo I: Introducción General Nomenclatura Cadena lateral G Ninguna X α-D-xilosil L β-D-galactosil-(1-2)-α-D-xilosil F α-L-fucosil-(1-2)-β-D-galactosil-(1-2)-α-D-xilosil S α-L-arabinosil-(1-2)-α-D-xilosil T α-L-arabinosil-(1-3)-α-L-arabinosil-(1-2)-α-D-xilosil J α-L-galactosil-(1-2)-β-D-galactosil-(1-2)-α-D-xilosil Tabla I.1. Nomenclatura abreviada de la estructura de los oligosacáridos de xiloglucano. La estructura y distribución molecular de Estas cadenas laterales determinan la estructura las cadenas laterales varía en distintos tejidos y del xiloglucano y las distintas funciones plantas. La estructura química y distribución de biológicas que presenta. las cadenas laterales ha sido rigurosamente establecida de los mayoría de polisacáridos de la pared, tiene que son lugar en el aparato de Golgi (Zhang y obtenidos mediante digestión del polímero con Staehelin, 1992), desde donde se liberan a la endoglucanasa. Por ejemplo, en el caso del pared mediante vesículas de secreción. Parece guisante, tras la degradación del xiloglucano que el primer paso en la síntesis de xiloglucano polimérico, que es la formación del esqueleto glucosa-xilosa, mayoritariamente se obtienen son XXXG y que da como resultado la estructura básica XXFG, que se van alternando a lo largo de la XXXG. En la actualidad han sido identificadas molécula (Hayashi y Maclachlan, 1984). Un la mayor parte de las glicosil-transferasas análisis más detallado permitió descubrir implicadas en la biosíntesis de xiloglucano (Fig. cantidades menores de: XXLG, XLFG, XXG, I.6). oligosacáridos mediante de los análisis La síntesis de xiloglucano como la de la xiloglucano oligosacáridos XG, GXFG y GXXG (Guillén y col., 1995). 8 Capítulo I: Introducción General Figura I.6. Se indican los puntos de actuación de algunas de las enzimas implicadas en la síntesis de xiloglucano, que añaden monosacáridos activados a las nuevas cadenas en síntesis. Adaptado de http://www.prl.msu.edu/cellwallnet.shtml Las glicosil-transferasas mecanismo central de constituyen el la biosíntesis de formarían el eje β-glicano de las hemicelulosas como XyG, xilano o mananos entre otros. polisacáridos (Scheible y Pauly, 2004). Estas Además de las sintasas que ensamblan el eje glicosil-transferasas están codificadas por genes de los polisacáridos matriciales se requieren denominados CSL (Cellulose synthase like otras genes) que se denominan según la homología ramificaciones de su secuencia con los genes CESA. Los genes algunas de ellas han sido identificadas (Scheible CSL encontrados en Arabidopsis y arroz, han y Pauly, 2004). glicosiltransferasas laterales a para añadir estos glicanos, sido subdivididos en ocho grupos basados en su En el proceso de síntesis de xiloglucano secuencia génica. Las proteínas CSL contienen interviene un complejo multienzimático que patrones de secuencia característicos de las β- coordina las actividades glicosiltransferasa y glicosiltransferasas, consideradas xilosiltransferasa. El siguiente paso de la buenas candidatas para las sintasas localizadas síntesis sería la unión de residuos de fucosa y en el aparato de Golgi. Estas proteínas galactosa, que deben estar activados para que son incorporarse al eje XXXG (Faik y col., 1997a). 9 Capítulo I: Introducción General Dicha activación consiste en la unión a la hasta la cebolla (monocotiledóneas) sugiere su glucosa, galactosa y xilosa de una molécula de importancia en la función del xiloglucano. Sin UDP (Uridina 5’ difosfato), mientras que en el embargo, plantas de Arabidopsis thaliana caso de la fucosa la activación se lleva a cabo correspondientes al mutante mur2, que carecen mediante la unión de una molécula de GDP de actividad AtFUT1, responsable de la (Guanina 5’ difosfato). Estos precursores son transferencia de fucosa al xiloglucano, crecen transportados desde el citosol al aparato de de forma normal en condiciones de laboratorio Golgi (Perrin y col., 2003). mediante 2000), desde transportadores donde serán (Gibeaut, liberados al El xiloglucano, además de presentar apoplasto. Han sido identificadas algunas de las diferentes cadenas laterales, en algunos de sus enzimas implicadas en estas reacciones, una residuos aparece O-acetilación. Estos grupos fucosil-transferasa (Faik y col., 1997b; Perrin y acetilo están presentes en el C2, C3 y C6 de los col., 1999) y una galactosil-transferasa (Madson residuos de galactosa y pueden contener uno o y col., 2003) identificada a partir del mutante dos grupos acetilo (York y col., 1993). Se han de Arabidopsis mur3. Además, el eje principal descrito grupos acetilo en el C6 de algunas de glucano que constituye el xiloglucano, está glucosas (York y col., 1996). Tanto los grupos sustituido por restos de xilosa en un patrón acetilo unidos a los residuos de glucosa como regular. Dichas xilosas son agregadas al menos las cadenas laterales limitan los posibles lugares por una, y probablemente por dos o tres de hidrólisis del polímero. De ahí que el XyG enzimas, de denominadas xilosil-transferasas lugar a diferente tras composición tratamiento de (Cavalier y Keegstra, 2006). Se han aislado siete oligosacáridos con genes candidatos a codificar las enzimas que endocelulasa dependiendo de los lugares de catalizan dicha actividad, de los cuales uno en acetilación. Arabidopsis (AtXT1) se confirmó que codifica La acetilación de los residuos de galactosa para una proteína con actividad xilosil- aparece considerablemente reducida en los transferasa (Faik y col., 2002). La proteína mutantes deficientes en fucosa AtFUT1, mur1 codificada por el gen AtXT2, presenta la misma y mur2, que sintetizan poco o nada de fucosa. especificidad de aceptor que AtXT1 y además Esto sugiere que la fucosilación del xiloglucano genera los mismos productos in vitro. La es presencia de cadenas fucosiladas en un amplio acetiltransferasa en Arabidopsis (Perrin y col., rango 2003). de especies, desde el pino (gimnospermas) o leguminosas (dicotiledóneas) 10 necesaria para al menos una O- Capítulo I: Introducción General Pectinas Son los polisacáridos más solubles de la (Somerville y col., 2004). Las pectinas podrían estar relacionadas con el cese del crecimiento pared celular y pueden ser extraídos con agua de la pared debido un incremento de la caliente o agentes quelantes de calcio. Al igual rigidez, que frenaría el crecimiento, mediante que las hemicelulosas, las pectinas también la dimerización de los ácidos hidroxicinámicos forman un grupo heterogéneo de polisacáridos. que forman parte de su estructura (Zarra y col., Constituyen aproximadamente el 30% del peso 1999). La característica principal de las pectinas seco de la pared de dicotiledóneas y están es que contienen azúcares ácidos como el ácido implicadas en las uniones intercelulares ya que glucurónico y el ácido galacturónico, y es están presentes en la lámina media y en la precisamente esta acidez, la que permite la pared celular primaria, podrían tener además formación de complejos debido a la unión un papel en el control de la porosidad celular mediante puentes de calcio (Fig. I.7). Figura I.7. Dominios principales de pectinas y estructura básica. Algunas pectinas tienen una estructura disacárido (1-2)α-L-Rha(1-4)α-D-GalU, donde primaria sencilla, como el homogalacturonano los restos de Rha funcionan como anclaje de (HG), que es un polímero lineal formado por largas cadenas laterales de arabinanos y/o restos de ácido galacturónico (GalU) unidos por arabinogalactanos. El tamaño de esta pectina un enlace α(1-4). El ramnogalacturonano I (RG en los entrenudos de guisante durante el I), es una pectina formada por la repetición del crecimiento está entre 500 y 2000 kDa (Talbott 11 Capítulo I: Introducción General y Ray, 1992). La tercera pectina importante es con estructura alterada (Somerville y col., el ramnogalacturonano II (RGII). Es un 2004). Quasimodo, un mutante de T-DNA de polisacárido pequeño pero de estructura muy Arabidopsis, tiene inactivado el gen de una compleja formada por GalU, Rha, Ara, Gal y posible glucuronosil-transferasa de pectinas pequeñas poco (Bouton y col., 2002). Las paredes celulares de frecuentes como apiosa o ácido acérico. El este mutante presentan adherencia celular arabinogalactano presenta reducida y una reducción del 25% en los ramificaciones en C3 y C6 de Gal y en C3 y C5 niveles de ácido galacturónico comparado con de Ara (Ridley y col., 2001). Las cadenas el tipo salvaje. Sin embargo, en estas plantas, el laterales contienen un alto número de residuos resto de los azúcares pécticos no aparecen en distintos unidos mediante diversos enlaces pero menor cantidad, por eso los autores suponen aun así el RGII tiene una estructura altamente que esta actividad glucuronosil-transferasa es conservada y puede formar dímeros mediante específica del homogalacturonano pero no un puente borato, con dos enlaces éster afecta al RG II. cantidades del de azúcares RGII (Fleischer y col., 1999). Recientemente se ha sugerido que el RGI sería el componente al que Proteínas Estructurales se unirían otras pectinas tales como el HG o el La pared celular primaria contiene una RGII unidas covalentemente como cadenas cantidad mayor de proteínas que la pared laterales. celular secundaria. Se pueden distinguir La síntesis de pectinas al igual que la de básicamente dos tipos de proteínas de pared, las otros polisacáridos de la pared se lleva a cabo estructurales y las enzimáticas. Las proteínas en el aparato de Golgi. Las proteínas que estructurales más conocidas están relacionadas intervienen en la síntesis presentan en su con el cese de la extensión de la pared y en su mayoría segmentos transmembrana o forman gran complejos con otras proteínas implicadas en inusual, la hidroxiprolina y se caracterizan por este proceso, por este motivo su purificación se la presencia de secuencias repetitivas. Las más complica. Al no haber mutantes específicos, conocidas son las glicoproteínas ricas en resulta difícil el estudio de la biosíntesis y de su hidroxiprolina (HRGPs) o extensinas, en las papel in vivo. Por esta razón, los genes que la secuencia repetitiva es Ser-(HO-Hyp)4, implicados en la síntesis de pectinas que de forma que un 40% de sus aminoácidos conocemos se han identificado a partir de corresponde a hidroxiprolina y el resto serían mutantes de la pared que presentan pectinas mayoritariamente serina y lisina. Los residuos 12 mayoría contienen un aminoácido Capítulo I: Introducción General de hidroxiprolina pueden a pueden atravesar la lámina media que separa oligosacáridos de arabinosa, que formarían la células vegetales adyacentes (Stafstrom y parte glicídica, mientras que los residuos de Staehelin, 1988). serina serían puntos de unión para residuos de Otro tipo de proteínas estructurales son las galactosa. abundantes proteínas ricas en glicina (GRPs) y en prolina residuos de tirosina, los cuales parecen estar (PRPs). Las proteínas ricas en glicina presentan implicados repeticiones Además en isoditirosina contienen la formación enlaces tipo (Gly-X)n, donde responsables de la insolubilización de las puede ser alanina o serina, y su función está HRGPs en la pared (Lamport y Epstein, 1983). relacionada con el sistema vascular y la El estudio de las extensinas ha demostrado que curación de heridas. Las proteínas ricas en cada una de ellas es sintetizada en uno o pocos prolina presentan repeticiones Pro-Pro-X-Y- tipos celulares en la planta. Lys, donde X e Y pueden ser valina, tirosina, está histidina y ácido glutámico. Parecen estar del implicadas en procesos de lignificación (Ye y crecimiento de la pared celular (Lamport y col., 1991) y se expresan en determinados tipos Kieliszewski, 1994), la expresión de las celulares o solamente en un tipo celular en expansinas no sólo está regulada por el cierto estado de desarrollo. claramente de propuestos del frecuentemente X es glicina, aunque también función son de como La que unirse implicada las en extensinas el cese desarrollo sino también por el ataque de Las arabinogalactanoproteínas (AGPs) son patógenos. Se considera que las HRGPs son un proteínas solubles y glicosiladas (Fincher y col., componente importante el mecanismo de 1983; Showalter, 1993). Se han encontrado defensa, ya que su expresión no sólo se produce múltiples formas de las AGPs en tejidos cuando cesa el crecimiento sino también tras vegetales, en la pared o asociadas a la una infección de las células epidérmicas o membrana plasmática y presentan patrones de corticales, son expresión diferentes dependiendo del tipo de componentes de un mecanismo de resistencia célula y tejido (Pennell y col., 1989; Serpe y (Keller, 1993). Nothnagel, 1995). Presentan un dominio lo que demuestra que Las extensinas se localizan distribuidas central rico en hidroxiprolina (Hyp) y una uniformemente en la pared primaria y están secuencia de anclaje a la membrana plasmática ausentes en la lámina media. Esto pone en en el extremo C-terminal. También presentan evidencia que estas proteínas son producidas una especial unión a las pectinas, por ello se por cada célula de forma independiente y no piensa que podrían estar implicadas en la 13 Capítulo I: Introducción General adhesión celular, sin embargo no son un las componente estructural importante en la modificar distintos sustratos en la pared, como célula. Las AGPs intervendrían también en las peroxidasas o las fosfatasas. La función otras crecimiento, precisa de muchas enzimas de la pared aun está nutrición, así como en otros procesos de por determinar, pero sin duda intervienen en desarrollo (Pennell y Roberts, 1990). numerosos procesos, desde la modificación de funciones tales como quitinasas o las β(1-3)glucanasas, o la pared hasta el transporte de metabolitos o la Enzimas de la Pared Celular señalización celular. Toda esta diversidad de Además de las proteínas estructurales, en la enzimas apoya el hecho de que la pared es un pared celular destacan las proteínas con compartimento metabólico muy activo en la actividad enzimática que catalizan al menos célula, y el flujo de materiales a través de la cuatro tipos de reacciones, transglicosilación, membrana hidrólisis, desesterificación y reacciones redox actividad de las enzimas de la pared. plasmática puede modular la (Fry, 1995). Casi todas estas enzimas son Todas las enzimas han de estar reguladas ya proteínas glicosiladas que intervienen en el que de lo contrario, la elevada actividad metabolismo de la pared celular (Fry, 1988) glicanasa podría llevar a cabo la degradación de aunque su función puede ser muy diferente. componentes de la pared celular provocando su Estas enzimas pueden ser solubles en el desintegración. El mecanismo que regula estas apoplasto o bien estar unidas a la pared celular. actividades enzimáticas de la pared celular, no Se caracterizan por presentar mayor estabilidad se conoce con exactitud, lo que si es que las enzimas citoplásmicas y por actuar indiscutible sobre sustratos simples como el O2, H2O2 o H2O regulación. es la necesidad de dicha (Fry, 1995). Son numerosas las enzimas que pueden encontrarse asociadas a la pared celular (Cassab Ensamblaje y Estructura de la Pared Celular Después de su secreción al espacio y Varner, 1988; Fry, 1995). Algunas pueden extracelular, los polímeros que constituyen la modificar los polisacáridos de la pared celular, pared se ensamblan de forma cohesiva, para dar por ejemplo, las endoglucanasas, xilosidasas, lugar a la estructura final característica de la pectinasas, pectin-metil-esterasas o xiloglucano pared. Una vez sintetizados dichos polímeros endotransglicosilasas. Otras pueden actuar en tienden a agregarse para dar lugar a estructuras la pared como potenciales defensas frente a organizadas (Roland y col., 1977; Lapasin y patógenos fúngicos o bacterianos, es el caso de Pricl, 1995). De hecho, cuando la celulosa es 14 Capítulo I: Introducción General regenerada in vitro forma fibras muchas que sean específicas para la unión de espontáneamente. Además, cuando se disuelve polímeros de la la fracción hemicelulósica de la pared y potenciales posteriormente se precipita, se agrega formando xiloglucano endotransglicosilasas (XETs), las redes ordenadas y concéntricas similares a las esterasas o las oxidasas entre otras. La XET (Fry de las paredes originales (Roland y col., 1977). y col., 1992; Nishitani y Tominaga, 1992), Las pectinas, por el contrario forman redes cataliza la ruptura de cadenas de xiloglucano isotrópicas mucho más dispersas. Aunque el (entre un resto de glucosa no sustituido y el xiloglucano, en general, está fuertemente unido siguiente) y la unión del nuevo extremo a la pared, una vez solubilizado no forma reductor formado al extremo no reductor de fácilmente agregados de nuevo, y los complejos una cadena de formados con la celulosa in vitro son menos Originalmente se estables que los que se forman en la pared transglicosilasa podría relajar la pared de forma celular in vivo (Hayashi, 1989; Hayashi y col., limitada y controlada, aunque los experimentos 1994). Los complejos xiloglucano-celulosa, de in vitro no pudieron detectar la relajación de la los que se hablará con detalle posteriormente, pared por acción de la XET (McQueen-Mason y reconstituidos in vitro, contienen sólo un 7% col., 1993). Un papel alternativo de la XET del xiloglucano encontrado en los complejos puede ser el integrar nuevos XyGs sintetizados nativos (Hayashi y col., 1987), esto implica que en la pared (Nishitani y Tominaga, 1991; se requieren determinadas condiciones físicas Okazawa y col., 1993). Los XyGs sintetizados para formar la estructura que presenta la pared son más pequeños que los que constituyen la in vivo. Una interpretación posible es que el pared (Talbott y Ray, 1992). Por otro lado, la xiloglucano se entrelaza con las microfibrillas composición de XyG de diferentes tamaños de celulosa durante su síntesis (Hayashi y col., varía a lo largo de diferentes segmentos del tallo 1994). Los enlaces que forma el xiloglucano con de guisante, y puede cambiar de forma rápida y la celulosa no son mecánicamente fuertes, sino reversible en respuesta a la auxina, cortes o que son enlaces débiles, fáciles de romper, cambios de turgencia (Nishitani y Masuda, permitiendo el crecimiento de la pared, y a su 1981; Nishitani y Masuda, 1983; Talbott y Ray, vez numerosos, aportando resistencia mecánica 1992). Sería la XET la que provocaría estos global a la pared. cambios en la composición de oligosacáridos de para pared. esta Las función xiloglucano propuso candidatas son las aceptora. que esta En el ensamblaje de la pared también hay XyG, ya que rompería cadenas de XyG para dar enzimas implicadas, aunque no se conocen lugar a fragmentos de diferentes tamaños. En 15 Capítulo I: Introducción General solución, la XET parece cortar al azar en inducción a la extensión de la pared por diferentes localizaciones a lo largo de la cadena incorporación de nuevos polímeros secretados. principal del XyG, aunque probablemente las A microscopía electrónica la estructura condiciones de la pared celular, como la dominante que se observa en la pared celular conformación del propio XyG o el ambiente primaria es una trama de microfibrillas de electrostático de la pared modulan la acción de celulosa, que presentan un diámetro de unos 3 esta enzima para formar fragmentos más nm y que se extienden sobre las células, grandes o más pequeños de XyG. Por lo tanto manteniéndose unidas mediante hemicelulosas, esta enzima tendría capacidad para alterar la tales como el xiloglucano, pectinas y proteínas, matriz que constituye la pared, y además podría a modo de gel, puesto que el agua representa un realizar tres funciones diferentes. La más alto porcentaje en el contenido global de dicha importante sería la que tiene que ver con la matriz (Carpita y Gibeaut, 1993). Estaría biosíntesis y modulación de la pared, ya que formada esta no puede perder grosor, y por ello será independientes: necesario incorporar nuevo material a la pared matriz en expansión. Entonces, las cadenas de XyG de estructurales(Carpita y Gibeaut, 1993). nueva síntesis son liberadas al apoplasto, procedentes del aparato de Golgi, La por de tres redes red xiloglucano-celulosa, pectinas mayoría de relativamente y los glicoproteínas polímeros que y constituyen la pared durante el crecimiento no entrelazadas a las cadenas ya existentes gracias a están unidos covalentemente, y la integridad de estas enzimas, manteniendo así la integridad de la pared se mantiene mediante una gran la pared celular (Nishitani, 1997). cantidad de uniones no covalentes entre estos La deposición de nuevo material en la pared polímeros. Esto implica que la integridad y es claramente necesaria para mantener la fuerza propiedades mecánicas de la pared estarían e determinadas por tres factores: el tamaño de los integridad de la misma durante el crecimiento. Aunque in vitro se ha podido polímeros separar la extensión de la pared de la deposición entrecruzamiento (Rayle y col., 1970) parece que ambos son interacción entre ellos. Cambios en estos tres inseparables in vivo. Por ello se cree que la factores, deposición de nuevo material en la pared extensibilidad de la célula aunque estaría permitiría deslizarse entre si a los componentes implicada también alguna actividad enzimática de la pared ya existentes, aunque no existen (Fry, 1998). evidencias 16 demostradas para explicar la de en la pared, de teoría, los el grado polímeros podrían y alterar de la la Capítulo I: Introducción General El modelo de pared primaria más aceptado Los estudios sobre la composición de (Carpita y Gibeaut, 1993) considera que la red azúcares de paredes de distintos tejidos de xiloglucano-celulosa es la principal responsable Arabidopsis han demostrado que cada tejido de las propiedades mecánicas de la pared, presenta distinta composición polisacarídica. siendo el xiloglucano el componente que Estudios inmunológicos utilizando anticuerpos soportaría la mayor parte de la tensión. Como monoclonales ya de epitopos de los polisacáridos proporcionan xiloglucano se unen a las microfibrillas de ejemplos de la diferenciación espacial y celulosa mediante puentes de hidrógeno, de temporal de los polisacáridos de la pared. Estos forma que una cadena de xiloglucano se une a y otros estudios demuestran que la composición varias microfibrillas, que una de la pared está altamente controlada en los microfibrilla estaría unida a su vez a numerosas distintos tipos celulares en relación con el cadenas de xiloglucano. crecimiento y el desarrollo. Los estudios Como se ha comentado previamente, las inmunológicos han demostrado además que microfibrillas de celulosa se sintetizan en la diversos membrana plasmática y son insolubles, porque uniformemente dentro de la pared. El RGII, por las cadenas laterales de glucanos unidas ejemplo, aparece en mayor proporción cerca de mediante puentes de hidrógeno o fuerzas de la membrana plasmática, mientras que el HG Van der Walls dan lugar a estructuras aparece mayoritariamente en la lámina media cristalinas formadas por cadenas laterales, donde mientras son adyacentes. Estas diferencias en composición y secretados en forma soluble, para que puedan estructura en las paredes de distintas células, difundir a lo largo de la pared hasta su destino podría indicar diferencias en las necesidades de final. Algunos polímeros son insolubles cuando elasticidad de dichas células, la movilidad de se extraen de la pared, por ello se piensa que distintos tipos de moléculas en las paredes podrían ser modificados tras la secreción, por celulares o la respuesta a patógenos. se ha mencionado, que los las cadenas al tiempo demás polímeros que polímeros contactan reconocen no las están paredes diferentes distribuidos de células eliminación de los componentes estructurales que favorecían dicha secreción (Somerville y La Red XiloglucanoXiloglucano-Celulosa col., 2004). Se ha propuesto que algunos Como se ha mencionado en el apartado polímeros darían lugar a polisacáridos de mayor anterior, la pared celular primaria está formada tamaño (y menos solubles) tras la liberación a la por tres redes relativamente independientes: pared. red de pectinas, glicoproteínas estructurales, y 17 Capítulo I: Introducción General la red xiloglucano-celulosa (Carpita y Gibeaut, primaria, 1993). la conformación plana que facilita la unión del interrelación entre esta última red y la matriz xiloglucano a la celulosa (Levy y col., 1991). De de pectinas, pero aproximadamente una tercera hecho, Levy y colaboradores (1991) utilizando parte del xiloglucano estaría covalentemente programas unido a pectinas (Thompson y Fry, 2000). predicciones conformacionales, describieron Aunque la celulosa y el xiloglucano se una velocidad de unión del xiloglucano sintetizan diferentes fucosilado a la celulosa superior con respecto al localizaciones, hay una estrecha interacción que no lo está, demostrando posteriormente sus No se y conoce con ensamblan exactitud en informáticos adopte para una obtener teorías en ensayos in vitro (Levy y col., 1997). xiloglucano previene la formación de complejos Sin embargo, nuevos trabajos informáticos han más grandes de celulosa (Mccann y col., 1990a; visto estas predicciones como no reales, y no Acebes y col., 1993), y además hay muy han encontrado a nivel teórico cambios en la pequeñas cantidades de celulosa libres (Hayashi adsorción de la celulosa por parte de los oligos y Maclachlan, 1984). La red xiloglucano- fucosilados con respecto a los no fucosilados celulosa parece ser el factor más importante que (Hanus y Mazeau, 2004). Por otro lado, se ha controla la extensión de la pared celular, de tal demostrado que la presencia de residuos de modo que posee la capacidad de regular el galactosa limita la unión del xiloglucano a la crecimiento celular. Parece que el xiloglucano celulosa, e in vitro, la modificación del tendría un papel estructural importante en la xiloglucano por acción de una β-galactosidasa determinación las incrementa la unión del xiloglucano a la microfibrillas de celulosa y la formación de la celulosa (Reid y col., 1988), aunque además del red (Hanus y Mazeau, 2006). El xiloglucano se tamaño, la configuración de las cadenas une a celulosa mediante puentes de hidrógeno, laterales y se ha demostrado que se necesita una cadena importante en la adsorción del xiloglucano a la de xiloglucano de al menos 5 residuos glicosil celulosa. Cuando el xiloglucano excede la consecutivos para que pueda unirse. Esta unión capacidad de unión de la celulosa, se produce estaría afectada además, por el grado de una adsorción preferencial de las moléculas más ramificación de la molécula, de forma que el grandes, ya que su unión es más favorable en tipo de cadena lateral que presenta determina términos de entropía. ambos polisacáridos de la orientación vivo. que El entre in favorece de también puede jugar un papel una unión más o menos fuerte. La presencia de La red xiloglucano-celulosa es, por lo tanto, fucosa en el xiloglucano de la pared celular esencial para comprender los procesos de 18 Capítulo I: Introducción General extensión, pero hay que tener en cuenta otros al extremo no reductor recién formado en dicha componentes de la pared (Cosgrove, 1987). Se cadena. ha observado que la celulosa no parece sufrir extremo al extremo no reductor de una cadena grandes modificaciones durante el crecimiento preexistente, (Fry, 1988), por lo que es en la red en la que se oligosacárido de xiloglucano. La unidad mínima producen los cambios. El xiloglucano participa aceptora es el oligosacárido XXG. Se puede en el mantenimiento de la estructura de la establecer pared celular, de modo que un menor grado de transglicosilaciones polimerización integradora, mediante la cual se incorporan Lorences y (Lorences col., y 1989) Zarra, 1987; implicaría una nuevas Posteriormente recién por lo cadenas transfieren sintetizada tanto, de o dos (Nishitani, dicho a tipos 1998), xiloglucano un de una recién disminución en el número de puentes de sintetizadas a las cadenas preexistentes, y otra hidrógeno que le unen a la celulosa, facilitando reestructuradora, que da lugar a la modificación su desplazamiento bajo la presión de turgencia de las cadenas de xiloglucano ya existentes, de y por lo tanto el crecimiento. forma que se utilizaría dichas cadenas, con función tanto donadora como aceptora. Esta Enzimas que actúan sobre la red XiloglucanoXiloglucano- característica de las XTHs es fundamental en el Celulosa proceso de extensión de la pared, ya que Sobre la red Xiloglucano-Celulosa actúan permite la relajación de la misma sin provocar enzimas incluidas dentro de tres grupos su fundamentales: pueden XTHs (Xiloglucano endotransglicosilasas/ hidrolasas) (Rose y col., desestabilización actuar, endoglucanasas, completa. Las XTHs como por lo tanto, XEH, ya que rompen 2002a), xiloglucano de una cadena donadora, o como pertenecientes a la familia 16 de las transglicosilasas, XET, ya que vuelven a unir ese glicosil hidrolasas (Henrissat, 1991). extremo reductor al extremo no reductor de Celulasas o endo-β-(1-4)glucanasas (del otra molécula de xiloglucano. No obstante, sería Campillo, 1999) pertenecientes a la esta última actividad la que daría lugar a la familia 9 de las glicosil hidrolasas pérdida de rigidez de la pared, al romper las (Henrissat, 1991) cadenas de xiloglucano, unirlas de nuevo dando Expansinas (Cosgrove, 2000) Cuando actúan como lugar a moléculas más largas y permitiendo la xiloglucano separación de las moléculas de celulosa endotransglicosilasas, las XTHs, rompen las (Thompson y Fry, 2001). Si se une la cadena de cadenas de xiloglucano y se mantienen unidas xiloglucano aceptora a un oligo soluble, 19 Capítulo I: Introducción General entonces se produce la rotura de la cadena (Fig I.8). Figura I.8. Actividad endotransglicosilasa de la XTH, que corta y une cadenas de xiloglucano, permitiendo la expansión de la pared celular, debido a la posibilidad de separación de las microfibrillas de celulosa. (a) cadenas de xiloglucano (b) la XTH corta la cadena de xiloglucano dando lugar a un extremo reductor (c) la XTH une dicho extremo con el extremo no reductor de otra cadena de xiloglucano. En relación a la capacidad de usar un Se estudió la preferencia de las XTHs por oligosacárido como aceptor, se podría decir que diferentes moléculas aceptoras, y parece que esto permitiría una mayor extensión de la existe una amplia gama de isoenzimas en pared, ya que al unirse las cadenas portadas por función de dichas preferencias (Rose y col., la XTHs impedirían que estas se uniesen a las 2002b). Esto podría significar que el tipo de cadenas el oligosacárido o el tipo de xiloglucano presente espacio entre las microfibrillas. De esta forma, en la pared en un determinado momento del la concentración de oligosacáridos suficiente desarrollo sería determinante en la consecución para competir con las cadenas preexistentes del estado requerido. En cuanto a la relación de podría influir de manera importante en los estas mecanismos de extensión de la pared celular. encontró una buena correlación entre los 20 preexistentes aumentando así isoenzimas con el crecimiento, se Capítulo I: Introducción General niveles de actividad de las XTHs y la tasa de entre glucosas no sustituidas. Se supone, en crecimiento (Potter y Fry, 1993; Catala y col., principio, que estas enzimas actúan sobre 1997; Takano y col., 1999). Pero curiosamente, moléculas de celulosa, aunque en plantas no se al añadir XTHs a paredes aisladas no se han encontrado celulasas activas frente a consiguió la extensión esperada (McQueen- celulosa cristalizada. Además tampoco se han Mason y col., 1993). Pese a que las expansinas encontrado dominios de unión a celulosa han sido propuestas para llevar a cabo la (Brumell y col., 1994). En cambio, sí se ha extensión de la pared celular, las XTHs estarían encontrado también implicadas en dicha función. La solubles de celulosa. Existe una correlación expresión de algunos genes de XTHs se han entre correlacionado a menudo con el crecimiento, xiloglucano y la actividad de las endoglucanasas además una expresión baja de los genes (Ohmiya y col., 2000). Junto con esta liberación AtXTH18 y AtXTH27 da lugar a cambios se produce la solubilización de las cadenas de fenotípicos. Estas observaciones apoyan la idea xiloglucano, lo cual facilitaría la extensión de la de que las XTHs están implicadas en la pared. la actividad liberación frente de a derivados oligosacáridos de relajación de la pared celular (Van Sandt y col., Algunos investigadores se inclinan por 2007). El grupo I purificado de XTH, presenta pensar que el verdadero sustrato de las celulasas exclusivamente puede son las moléculas de xiloglucano. Sin embargo, estimular la extensión de paredes celulares tipo ensayos de actividad enzimática frente a esta I. No se puede generalizar dicha actividad para molécula muestran que dicha actividad sobre todas estar ella es escasa (Ohmiya y col., 1995) o nula especializadas funcionalmente al igual que pasa (O´Donoghue y Huber, 1992). También existen con las expansinas (Choi y col., 2006). La datos a favor de esta hipótesis, ya que se ha diversidad funcional es sugerida por los encontrado en guisante una endocelulasa activa patrones de expresión de varios genes de XTH, frente a xiloglucano y no frente a celulosa incluso en tejidos que no se expanden soluble (Matsumoto y col., 1995), aunque no se (Vissenberg y col., 2005; Becnel y col., 2006). sabe si pertenece a la familia de las celulasas. En Cada XTH debe ser analizada de forma numerosas ocasiones, sin embargo, se asume individual para revelar su papel exacto en la que el principal sustrato de las celulasas es el mecánica de la pared celular. xiloglucano, a pesar de que las enzimas tienen las actividad XTHs, ya XET, que y pueden Las endocelulasas o endo-β-(1-4)-glucanasas son enzimas que rompen los enlaces β(1-4) más actividad frente a carboximetil celulosa (Hayashi, 1989). 21 Capítulo I: Introducción General En cuanto a las expansinas, poco después vivas, donde inducen la extensión de la pared del descubrimiento de las XTHs, fueron celular (Link y Cosgrove, 1998; Fleming y col., purificadas estas proteínas capaces de provocar, 1999), lo que indicaría que el nivel de por sí solas, la extensión de paredes aisladas expansinas sometidas a tensión, en las que previamente se crecimiento (Fig. I.9). inactivaron por calor todas las enzimas nativas La acción combinada de las expansinas y las (McQueen-Mason y col., 1992). No se sabe XTHs, daría lugar a una relajación de la pared realmente como actúan estas proteínas, aunque que permitiría el crecimiento celular, así pues, en principio romperían puentes de hidrógeno la rotura de alguna cadena de xiloglucano por entre las microfibrillas de celulosa y las parte moléculas de xiloglucano. Al parecer sólo son distanciamiento capaces de romper estos enlaces cuando las produciéndose así la tensión necesaria para que moléculas de xiloglucano están en tensión y las expansinas rompan los puentes de hidrógeno sería esta tensión la que evitaría que volvieran a presentes entre las cadenas de xiloglucano y unirse dichas microfibrillas. mediante puentes de hidrógeno. de es las un factor XTHs, entre limitante propiciaría las del un microfibrillas, También se comprobó su actividad en células Figura I.9. Modo de actuación de las expansinas. (a) pueden separar las hemicelulosas y compuestos de la superficie de la celulosa (b) separar unas hemicelulosas de otras (c) bajo tensión mecánica la acción de las expansinas da lugar a un desplazamiento de los polímeros de la pared. 22 Capítulo I: Introducción General Enzimas que actúan sobre los oligosacáridos de incorporarían al interior celular (Baydoun y xiloglucano xiloglucano Fry, 1989). Estas exoglicosidasas presentan una En la pared celular existen varias enzimas actividad relacionada con cada uno de los capaces de modificar el xiloglucano y/o sus residuos monoméricos que liberan, de esta oligosacáridos (Fry, 1995). Estas exoglicosidasas, forma son capaces de degradar los oligosacáridos de galactosidasas, α-xilosidasas y β-glucosidasas xiloglucano (Fig. I.10). hasta sus monómeros tendríamos, α-fucosidasas, β- correspondientes, debido a que estos no se A B glucosa xilosa C galactosa D fucosa Figura I.10. Actividad secuencial de las distintas glicosil hidrolasas sobre el oligosacárido XXFG, A: αfucosidasa, B: β-galactosidasa, C: α-xilosidasa, D: β-glucosidasa La primera α-fucosidasa se purificó en implicadas en la eliminación de residuos β- plantas de guisante (Farkas y col., 1991) y es galactosil no sustituidos, presentes en los activa frente al oligosacárido XXFG (Augur y oligosacáridos o en la propia molécula de col., 1993). También se purificó una α- xiloglucano. Dicha actividad rompería los fucosidasa de repollo con actividad tanto frente enlaces α(1-2) presentes entre los restos β- a oligosacáridos como frente al xiloglucano galactosil y α-xilosil. Esta enzima intervendría polimérico. En Arabidopsis thaliana se clonó el en la degradación de oligosacáridos como gen correspondiente (AtFXG1) (de la Torre y XLFG. Este es uno de los oligosacáridos más col., frecuentes, 2002), que hidroliza oligosacáridos fucosilados. Existen numerosos datos sobre la actividad producto de la degradación mediante endoglucanasas de las cadenas de xiloglucano. En los cotiledones de Tropaeolum β-galactosidasa en extractos de plantas. Algunas majus, β-galactosidasas de plantas parecen ser activas galactosidasa capaz de actuar sobre los residuos se identificó una actividad frente al xiloglucano. Se supone que estarían 23 β- Capítulo I: Introducción General de galactosa del xiloglucano (Edwards y col., 1988). La actuación de estas enzimas, puede ser muy importante en la regulación del control del En epicótilos de guisante se purificó una α- crecimiento de la pared celular, dado que xilosidasa activa frente a oligosacáridos de pueden modificar la cantidad y tipo de xiloglucano (O´Neill y col., 1989), que elimina oligosacáridos presentes en el apoplasto, que es restos de xilosa unidos al resto de glucosa más determinante en la expansión de la pared. La α- alejado del extremo no reductor. También se xilosidasa, por ejemplo, eliminando el resto de purificó otra α-xilosidasa en Tropaeolum majus xilosa más alejado del extremo reductor de la (Fanutti y col., 1991) y más recientemente en molécula de xiloglucano podría hacerla incapaz Brassica oleacea (Sampedro y col., 2001). A de actuar como aceptor de la XTH. La molécula nivel génico, el gen AtXYL1, de Arabidopsis de xiloglucano o el oligosacárido, podrían ser thaliana, codifica la proteína AtXYL1 con activados posteriormente como blanco de la actividad α-xilosidasa (Sampedro y col., 2001), XTH mediante la actividad β-D-glucosidasa. La y en Pinus pinaster el gen PpXYL1 codifica la inactivación-activación proteína PpXYL1 con actividad α-xilosidasa cadenas de xiloglucano por parte de la α-D- (Sanchez y col., 2003). xilosidasa y la β-D-glucosidasa puede ser secuencial de las Finalmente, se aisló a partir de cotiledones bloqueada por una cadena lateral F o L. Para Tropaeolum majus, una β-glucosidasa eliminar este bloqueo se necesita la actividad de perteneciente a la familia 3 de las glicosil las otras dos enzimas α-L-fucosidasa y β-D- hidrolasas (GH3), con actividad frente a galactosidasa. Podría existir en la planta un oligosacáridos de xiloglucano que presentan mecanismo que regulase todas estas actividades una glucosa no sustituida en su extremo no exoglicosidasas, de forma que la planta pudiese reductor (Crombie y col., 1998). Cuando la modular la capacidad de las moléculas de glucosa contigua lleva unida una galactosa, esta xiloglucano como aceptoras de la XTH (Fry, enzima no puede actuar, por lo tanto es activa 1995). de frente al oligosacárido XXXG pero no frente a GLXG. Esto lleva a pensar que primero Oligosacáridos de xiloglucano: Control del actuarían el resto crecimiento crecimiento celular de las exoglicosidasas eliminando la ramificación del extremo no La degradación del xiloglucano ha sido reductor para que posteriormente actuasen las estudiada en detalle en semillas de Tropaeolum glucosidasas sobre los restos de β-glucosa. majus (capuchina), donde constituye el principal polisacárido de reserva. Presenta una 24 Capítulo I: Introducción General estructura similar al xiloglucano de las paredes estructura y grado de polimerización (Hayashi primarias y Maclachlan, 1984), ya que sobre ellos actúan de tejido vegetativo con la particularidad de que no está fucosilado. las Durante la monosacáridos pueden estimular el crecimiento movilización del xiloglucano, y se pudo de la pared, siempre que estén presentes en la comprobar que ésta ocurre en dos pasos. En concentración adecuada. En este proceso, primer lugar se hidrolizada en fragmentos podrían intervenir las XTHs, que los utilizarían grandes, como la germinación por tiene una endotransglicosilasa (XTH) lugar xiloglucano con exoglucanasas. aceptores de Algunos la de estos transglicosilación actividad (Lorences y Fry, 1993). Estos oligosacáridos hidrolítica, que rompe enlaces internos en los pueden competir con las cadenas de xiloglucano que participa el C1 de restos de glucosa no preexistentes o recién sintetizadas, permitiendo sustituidos, de modo que se generan nuevos una mayor separación de las microfibrillas de extremos reductores. Esta enzima es altamente celulosa, con el consiguiente debilitamiento de específica para el xiloglucano, siendo inactiva la pared, sin llegar a desestructurarse, pero frente a otros sustratos, tales como la celulosa permitiendo que actúe sobre ella la presión de abundante en la pared. Además combina la turgencia. Por otro lado la separación de las actividad endotransglicosilasa con la actividad microfibrillas de celulosa produciría una mayor glucanasa, y es similar a la enzima XTH que tensión actúa en tejidos vegetativos (Fanutti y col., propiciando la actuación de las expansinas. 1993). en las cadenas de xiloglucano, Como hemos visto con anterioridad, el El segundo paso de la degradación del xiloglucano presenta enlaces sobre los que xiloglucano como vimos anteriormente consiste puede actuar la endo-β-(1-4)-glucanasa, para en la hidrólisis total para dar lugar a dar lugar a oligosacáridos como XXFG, XXXG monosacáridos, y requiere la actividad de tres (Hayashi y col., 1984), XLXG, XXLG (Guillen y enzimas hidrolíticas la β-galactosidasa, la α- col., 1995), que podrían tener un papel xilosidasa y la β-glucosidasa. importante como reguladores del crecimiento. La presencia de Se ha comprobado que el oligosacárido XXFG, a debe una concentración 1nM, actúa como inhibidor principalmente a la degradación de las cadenas del efecto de la auxina 2,4-D, que estimula el de xiloglucano polimérico por parte de las crecimiento en condiciones normales (York y endoglucanasas presentes en la pared. Los col., 1984). Además, este oligosacárido inhibe oligosacáridos obtenidos presentan distinta también el estímulo de crecimiento producido xiloglucano en de el oligosacáridos apoplasto, se 25 Capítulo I: Introducción General mediante incubación en medio ácido (Lorences determinada y col., 1990), o en ácido giberélico (Warneck y estructurales (Davies y Henrissat, 1995). Debido Seitz, 1993). Esta capacidad inhibitoria parece a que la estructura en sí, viene determinada por estar relacionada con los restos de fucosa, ya la secuencia, la estereoquímica y el resultado de que se produce con oligosacáridos de fucosa, la reacción se conserva dentro de cualquier pero no con otros carentes de la misma. familia de glicosil hidrolasas. No se encontró Además, en concentraciones mayores (1μM), el hasta el momento, ninguna excepción a esta XXFG no sólo deja de inhibir el crecimiento en afirmación, desde que fue propuesta por respuesta a auxinas, sino que lo favorece. Withers y colaboradores (Gebler y col., 1992). por mínimas variaciones Una de las características más importantes Clasificación de las glicosil hidrolasas de la clasificación es que, pese a la similitud de Las glicosil hidrolasas (GH) y glicosil la secuencias, algunas familias son contienen enzimas con transferasas (GT) son enzimas que actúan sobre poliespecíficas, carbohidratos (Carbohydrate Active enZymes, diferente especificidad de sustrato o producto, CAZy) y que se clasifican en base a la similitud lo que es indicativo de una divergencia en su secuencia aminoacídica (Henrissat, 1991; evolutiva que propició la adquisición de nuevas Henrissat y Bairoch, 1993; Davies y Henrissat, funciones. Por ejemplo, las celulasas, aparecen 1995; Henrissat y Bairoch, 1996; Campbell y en las familias GH5-GH9, GH12, GH26, GH44, col., 1997; Henrissat y Davies, 1997; Coutinho y GH45, GH48 y GH61, con lo cual las Henrissat, 1999). Hasta octubre 2007 se han estructuras 3D que presentan son muy variadas, descrito 110 familias de glicosil hidrolasas y 90 por pertenecer a familias distintas. De las 110 familias de glicosil transferasas. familias de glicosil hidrolasas, se conocen las La clasificación de las familias basada en la estructuras 3D de muchas de ellas. similitud de la secuencia aminoacídica fue Las glicosil hidrolasas son las mejor extremadamente útil para la caracterización caracterizadas de todas las enzimas que actúan tridimensional de las enzimas incluidas en cada sobre carbohidratos. Llevan a cabo la hidrólisis familia (Henrissat y Davies, 1997), ya que se ácido-base de los enlaces glucosídicos que comprobó con posterioridad, que dentro de una pueden conducir a la inversión o retención de familia la configuración anomérica, dependiendo de la determinada, tridimensional se estructura Como familia de enzimas. Numerosas revisiones de su resultado del análisis funcional de las enzimas, estructura, función y mecanismos catalíticos, se observó que la especificidad de sustrato viene están disponibles (Sinnott, 1990; McCarter y 26 (3D) la conserva. Capítulo I: Introducción General Withers, 1994; Davies y Henrissat, 1995; biosintéticas Zechel y Withers, 2000). Las reacciones de transglicosilasas responsables de la hidrólisis y inversión emplean un solo mecanismo clásico creación de dislocación, mientras que la retención se hidrólisis del almidón es realizada por α y β- lleva a cabo por una vía doble que implica la amilasas y β-glucosidasas. En Arabidopsis, la formación e hidrólisis consecuente de un maquinaria intermediario covalente. Una característica degradación del almidón se encuentra entre las importante del mecanismo de retención, de familias GT5, GT35, GH13, GH14, GH31 y importante relevancia para la bioquímica de la GH77. La familia GH17, en cambio, está planta es que el intermediario de reacción, relacionada con mecanismos de defensa, en puede ser interceptado por nucleófilos en un concreto con la respuesta patógeno-huésped. proceso denominado transglicosilación. En Enzimas hidrolíticas, β-glucosidasas, tales como plantas, esta reacción puede desempeñar un la mirosinasa, se encuentran en la familia GH1. importante las Otro ejemplo, serían las enzimas que llevan a xiloglucanoendotransferasas que se relacionan cabo la glicosilación con función de defensa, con la familia GH16. Arabidopsis contiene un que están mayoritariamente en la familia GT1. total de más de 730 glicosil hidrolasas y glicosil Estas transferasas, que son muchas más de las que nucleótido contienen ningún otro eucariota estudiado adecuado. La multiplicidad de enzimas en GT1 hasta el momento. refleja la gran variedad de aceptores específicos. papel, como ocurre con (sintasas de puntos completa glicosil y de fosforilasas), ramificación. para transferasas correspondiente la síntesis reconocen y el y La y el aceptor Las enzimas incluidas en estas familias El número de enzimas incluidas en las desempeñan muy diversas funciones, por diferentes familias se ha ido incrementando a lo ejemplo, las plantas usan como material de largo del tiempo y probablemente continuará reserva aumentando. el almidón, una macromolécula compleja que se sintetiza por acción de enzimas 27 Capítulo I: Introducción General Objetivos El objetivo general de este trabajo es el 3. Estudio de ambas actividades estudio y caracterización de las β-glucosidasas y exoglicosidasas en el apoplasto de Arabidopsis β-galactosidasas apoplásticas de Arabidopsis thaliana y sobre oligosacáridos de xiloglucano, thaliana. Ambos tipos de enzimas están así como los posibles efectos fenotípicos de la implicadas en el metabolismo del xiloglucano, ausencia de dichas actividades. de forma que pueden jugar un papel importante en el crecimiento celular y por lo tanto en el 4. Caracterización estructural de diferentes desarrollo de la planta. Los principales objetivos mutantes knockout de las β-glucosidasas y β- de este trabajo se pueden resumir en los galactosidasas de interés. siguientes puntos: 5. Análisis de la actividad de diferentes 1. Caracterización de las β-glucosidasas, mutantes seleccionados, tanto de β-glucosidasas pertenecientes a la familia 3 de las glicosil como de β-galactosidasas, frente a diferentes hidrolasas, y β-galactosidasas, pertenecientes a oligosacáridos de xiloglucano. la familia 35 de las glicosil hidrolasas, de Arabidopsis thaliana que puedan Los puntos anteriores serán ampliamente estar desarrollados a lo largo de este trabajo a fin de implicadas en el metabolismo del xiloglucano caracterizar en detalle ambas actividades y y/o de sus oligosacáridos. determinar su papel en el metabolismo del xiloglucano. 2. Análisis de expresión de las posibles βglucosidasas y β-galactosidasas objeto de estudio, en diferentes regiones de la planta y en diferentes estados de desarrollo. 28 Capítulo II: β-glucosidasas de Arabidopsis thaliana Capítulo II: β-glucosidasas de Arabidopsis thaliana o xiloglucano endotransglicosilasas (Edwards y II.1. Introducción Es indiscutible col., 1986; Farkas y col., 1992; Fanutti y col., la importancia del 1993; De Silva y col., 1993; Fanutti y col., 1996; xiloglucano, ya que es el principal polisacárido Chanliaud y col., 2004), pueden liberar hemicelulósico de la pared celular primaria de oligosacáridos de xiloglucano, algunos de los plantas de tipo I, como Arabidopsis thaliana cuales tienen capacidad para modular el (Hayashi, 1989; Fry, 1989; Zablackis y col., crecimiento de la planta (Creelman y Mullet, 1995). Por un lado, es fundamental para el 1997). La formación de dichos oligos in vivo, mantenimiento de la arquitectura de la pared por hidrólisis del XyG preexistente, fue (Cosgrove, 2001), y por otro, es blanco de observada en cultivos de células en suspensión enzimas implicadas en la extensión de la pared (Fry, 1986; Baydoun y Fry, 1989; McDougall y celular. Mediante la rotura y reestructuración Fry, 1991). de sus cadenas permite la separación de las Hay varias exoglicosidasas capaces de microfibrillas de celulosa al mismo tiempo que actuar mantiene la estructura de la pared. El oligosacáridos en las paredes celulares de xiloglucano es un polímero constituido por una plantas (Fry, 1995) que son capaces de cadena lineal de β-(1→4)-D-glucano, en la que degradarlos la mayoría de los residuos de glucosa están correspondientes. Estas glicosidasas son las α- sustituidos con una α-(1→6)-D-xilosa que a su fucosidasas, β-galactosidasas, α-xilosidasas y β- vez puede estar sustituida con residuos de glucosidasas. Estas glicosidasas actuando sobre galactosa, que pueden llevar unido o no un los oligosacáridos del xiloglucano (XXFG, resto de fucosa. XLFG, XXXG, etc) por el orden mencionado sobre el hasta xiloglucano sus y/o sus monómeros Las cadenas de xiloglucano se unen a las con anterioridad darán lugar a la degradación microfibrillas de celulosa de la pared celular, de los mismos. En este capítulo estudiaremos mediante puentes de hidrógeno, para dar lugar las β-glucosidasas y su acción eliminando la a la red XyG-Celulosa (Bauer y col., 1973; glucosa no susbtituída del extremo no reductor Hayashi y Maclachlan, 1984). La naturaleza de los oligosacáridos del xiloglucano. dinámica de esta red es el factor más A partir de los cotiledones de Tropaeolum importante que controla el grado de extensión majus L. se purificó una β-glucosidasa capaz de de la pared. Las moléculas de xiloglucano, por hidrolizar acción específica de endo-β-(1→4)-glucanasas disacáridos de glucosa y ciertos oligosacáridos p-nitrofenil-β-D-glucopiranósido, 31 Capítulo II: β-glucosidasas de Arabidopsis thaliana de xiloglucano. Esta β-glucosidasa actúa frente glucosidasas en Arabidopsis thaliana, con el a oligos que presentan una glucosa no objeto de identificar cuál o cuáles de ellas sustituida en su extremo no reductor (Crombie podrían participar en la degradación del y col., 1998), como GXXG, GXLG. Sin xiloglucano. De estas, se han seleccionado las embargo, cuando la glucosa contigua lleva cuatro de mayor similitud a la identificada por unido un resto de galactosa, esta enzima no Crombie y col. que son las codificadas por los puede actuar, por lo tanto no es activa frente a genes At5g20950, At5g20940, At5g04885 y oligosacáridos tales como GLXG o GLLG. Esto At3g62710 que a partir de ahora pasamos a lleva a pensar que primero actuarían el resto de denominar AtBGLC1, AtBGLC2, AtBGLC3 y exoglicosidasas, que eliminarían la ramificación AtBGLC4 respectivamente. del extremo no reductor, para permitir la En este capítulo, estudiaremos las posibles actividad de las glucosidasas, que eliminarían variaciones finalmente el residuo de β-glucosa. En el caso glucosidasas en diferentes órganos de la planta de la β-glucosidasa de Tropaeolum, se obtuvo y en diferentes estados de desarrollo. Para un DNA completo de 1962 bp, que codifica un comprobar si su expresión es mayor en zonas polipéptido de 654 aminoácidos, incluyendo el en crecimiento activo, lo que sería indicativo extremo N-terminal y una región de señal de su implicación en el crecimiento de la hacia el apoplasto, el número de acceso de pared. Además se caracterizará la acción in dicha proteína es EC 3.2.1.21. Además, las vivo, en el fluido apoplástico de Arabidopsis búsquedas en la base de datos revelaron que thaliana, de las glucosidasas utilizando como presentaba homología con otras glucosidasas de sustrato específico XXXG y analizando los bacterias, plantas y levaduras. El estudio de la productos de degradación mediante MALDI- secuencia, permitió incluirla dentro de la TOF MS. Se estudiarán además mutantes familia 3 de las glicosil hidrolasas (GH3) de knockout de Arabidopsis para los cuatro genes acuerdo con la clasificación de Henrissat citados, mediante la degradación de sus paredes (Henrissat, 1991). con una endo-β-(1-4)-glucanasa y el análisis de En función de la similitud con la βglucosidasa de Tropaeolum majus, que ha sido clonada y cuya actividad frente a oligosacáridos de xiloglucano ha sido demostrada, hemos realizado 32 una búsqueda de posibles β- en la expresión de dichas los oligosacáridos producto de la degradación. Capítulo II: β-glucosidasas de Arabidopsis thaliana II.2. Materiales y Métodos Los mutantes correspondientes a los locus II.2.1. Material vegetal AtBGLC2 y AtBGLC3 se obtuvieron de Plantas de Arabidopsis thaliana (L.) Heynh Syngenta Arabidopsis Insertion Library (SAIL), ecotipo Columbia 0, se crecieron en cámara a y actualmente están disponibles en Arabidopsis 25°C con un fotoperíodo de 16:8 luz/oscuridad,