Download Smartcycler

Satisfaciendo la demanda
de diagnóstico molecular
en Microbiología Clínica
Marzo 2011
Smartcycler®:
Plataforma inteligente para sus necesidades
Flexible y expandible: El instrumento Smartcycler es el único sistema modular de PCR en tiempo real con
acceso aleatorio, que permite realizar hasta 96 tests diagnósticos (protocolos) diferentes al mismo tiempo. Cada
posición está calibrada térmica y ópticamente, lo que permite realizar el mismo protocolo en las posiciones
deseadas. El sistema Smartcycler es plug-and-play, y solo es necesaria una conexión USB para transformarlo
en un equipo modular de hasta 6 x 16 = 96 posiciones.
Rápido: Permite optimizar protocolos de PCR en un único ensayo, y puede entregar resultados en la mitad de
tiempo que otros instrumentos de formato placa de 96 posiciones, debido a la rapidez de los ciclos de
calentamiento y enfriamiento que permite la superficie plana de contacto de los irrompibles tubos plásticos
especiales que utiliza el sistema.
Gran flujo de trabajo: Un sistema modular de 2 equipos por sí solo puede procesar más volumen de trabajo
que cualquier otro instrumento de 96 posiciones. Facultativos y técnicos pueden incrementar la eficiencia del
diagnóstico en el laboratorio porque no es necesario agrupar muestras. Los resultados históricos pueden ser
consultados, impresos y validados en cualquier momento, aunque el equipo esté en uso. Se puede crear e
iniciar un ensayo nuevo mientras otros ensayos se están realizando.
Optimización de ensayos: El acceso aleatorio permite optimizar ensayos que generen tamaños de amplicon
diferentes, tiempos de ciclado y diseño de ensayo y disminuir los tiempos de obtención de los resultados.
Precisión del Instrumento
Capacidad multiplex
Amplificación multiplex y detección de N.meningitidis
(FAM), S.pneumoniae (Cy3), H. influenzae (TxR) y
Control interno (Cy5).
Curvas de crecimiento y segundas derivadas
para 32 posiciones (2 bloques). Los datos
pertenecen al ensayo #3 (tabla inferior).
Ensayo de N. gonorrhoeae a 5000 copias
La robustez de los elementos óptico
y térmicos generan resultados de
gran reproducibilidad
Los ensayos multiplex permiten la
detección de varias dianas presentes en
una única muestra. El uso de multiples
sondas permiten la detección de señal en 4
canales al mismo tiempo. Compatible con
varias químicas de detección (TaqMan,
Eclipse, Molecular beacons, Amplifluor,
Scorpions, y fluoróforos intercalantes).
Rango dinámico
Sensibilidad
Diluciones seriadas de 100pg a 10fg de DNA con
sonda TaqMan marcada con Cy5/BHQ2
DNA M13mp18RF, con amplificación y detección de
un amplicón de 71bp, utilizando como sonda
9
TxR/BHQ2. Detección de 10 a 10 moléculas con 4
réplicas para cada concentración.
El sistema Smartcycler permite la
detección de un rango muy amplio de
concentraciones. Es posible crear una
curva patrón, para conocer datos de
concentración bacteriana ó viral.
Los ensayos de sensibilidad se ven
afectados por múltiples factores,
incluyendo la preparación en el
diseño de primers y sondas o las
condiciones de optimización de la
PCR. La detección de una sola
copia es posible cuando el ensayo
está perfectamente optimizado.
En la foto, se ven 7 módulos SmartCycler controlados por 2 ordenadores, en un laboratorio de microbiología
clínica español, con capacidad de realizar en 1h30min, 112 test de PCR en tiempo real simultáneamente:
-
1 sistema con 4 módulos SmartCycler con capacidad de efectuar 4 x16 = 64 test de PCR en
tiempo real simultáneamente.
-
1 sistema con 3 módulos SmartCycler con capacidad de efectuar 3 x16 = 48 test de PCR en
tiempo real simultáneamente
El corazón del sistema Smartcycler®:
El módulo I-CORE®
4 canales de detección
Multiplexing: Hay 4 LEDs y 4 detectores
que optimizan la capacidad multiplex. Los
filtros de longitud de onda en cada uno de
los detectores impiden el riesgo de
fluorescencia cruzada. La señal óptica se
mide en un ángulo de 90º para minimizar
el riesgo de interferencias
Termociclado rápido: La placas
cerámicas permiten una transmisión de
calor muy rápida al tubo de reacción, y los
ventiladores disminuyen el tiempo de
enfriamiento, mejorando la velocidad de
las rampas de amplificación. A su vez, es
posible configurar diferentes velocidades
de calentamiento/enfriamiento para
optimizar ensayos.
El módulo I-CORE
El sistema óptico permite la medición
de la fluorescencia en 4 canales al
mismo tiempo. Los filtros ópticos y los
LEDs de alta intensidad optimizan la
separación espectral. La calibración
permite la detección de FAM y sondas
intercalantes en el canal 1, Cy3, TET y
Alexa532 en el canal 2, TexasRed en el
canal 3 y Cy5, Alexa647 en el canal 4.
SmartTubeTM:
El tubo Smartcycler (SmartTube) es un producto de
polipropileno diseñado para minimizar el riesgo de
contaminación por amplicones, maximizar la
transferencia de temperatura, y optimizar la
sensibilidad óptica. La ventana de reacción forma un
ángulo de 90º ideal para que la lectura de la
fluorescencia sea óptima. El diseño plano permite
transferir la temperatura muy rápidamente a la mezcla
de reacción, reduciendo el tiempo de amplificación.
- Tubos con volumen de reacción
de hasta 25 μl ó 100 μl
- Gran superficie de contacto
- Sistema de tubo cerrado
- Tubos de polipropileno irrompibles
- Angulo de lectura de fluorescencia
óptimo a 90º
Rápida respuesta térmica.
Menos tiempo requerido por ensayo
Rápida respuesta térmica.
Máxima sensibilidad
Disminución de las posibilidades
de contaminación.
Máxima seguridad
SmartCapTM:
RealTime PCR-Nested: Aumento de
sensibilidad
Simple. Sensible
El SmartCap es un tubo para el diseño de
PCR de gran sensibilidad (Nested), pero
que se lleva a cabo en un solo paso, sin
necesidad de abrir el tubo, disminuyendo
la posibilidad de contaminación
Cargar el primer reactivo en el SmartTube.
Colocar el SmartCap en la parte superior del
SmartTube
Cargar el reactivo fresco para la segunda
reacción en el SmartCap. Cerrar y realizar la
primera reacción
Imagen del SmartCap, antes de ser ensamblado en
el SmartTube
Sacar el tubo del equipo. Cerrar la tapa del
SmartCap y volver a introducir el tubo en el
equipo. Realizar la segunda PCR.
SISTEMA SMARTCYCLER:
PCR EN TIEMPO REAL DE SEGUNDA GENERACIÓN
PANEL DE TÉCNICAS
o
o
o
o
o
MENINGITIS BACTERIANAS Y ENCEFALITIS VÍRICAS
INFECCIÓN RESPIRATORIA BACTERIANA Y VÍRICA
PANEL INMUNODEPRIMIDOS Y CARGAS VIRALES EN TRANSPLANTES
PANEL ENFERMEDADES DE TRANSMISIÓN SEXUAL
INFECCIÓN GASTROINTESTINAL
o
o
o
o
o
o
o
INFECCIONES FÚNGICAS
INFECCIONES PARASITARIAS
INFECCIONES NOSOCOMIALES
NEW
INFECCIONES POR MICOBACTERIAS: MTB/ NTM
DETECCION RAPIDA DE RESISTENCIAS: BLEAS; MecA, VAN A, B, C
SEPSIS
FARMACO-GENETICA PARA ANTIVIRALES (Abacarvir-HIV y Ribavirina-HCV)
NEW
o REACTIVOS PARA OTRAS PLATAFORMAS
o SISTEMA MAGICPLEX (SEEGENE)
o SISTEMA ANYPLEX (SEEGENE)
MENINGITIS BACTERIANAS Y ENCEFALITIS VÍRICAS
MENINGITIS BACTERIANAS:
1. Meningococo / Neumococo
2. Listeria monocytogenes
3. Meningitis neonatal: S. agalactiae/ E. coli
ENCEFALITIS VÍRICAS:
1. Enterovirus
2. Tipado HSV 1/2
3. VZV
4. HHV6
5. HSV1, HSV2, VZV
6. CMV, EBV
7. HSV1, HSV2, VZV, CMV, EBV, HHV6
TOXOPLASMOSIS LCR:
Toxoplasma gondii
BORRELIOSIS (Enfermedad de Lyme):
Borrelia burgdorferi (CE)
OTRAS INFECCIONES
1. Brucelosis
2. Leptospira
3. WNV (West Nile Virus)
4. Rubeola
5. Parotiditis
6. Tropherima whipplei
NEUMONÍAS BACTERIANAS / VÍRICAS / FUNGICAS
7.
NEUMONÍAS BACTERIANAS COMUNITARIAS:
1. Bordetella pertussis / parapertussis
2. Neumolisina ultrasensible (Neumococo)
3. Mycoplasma / Chlamydia pneumoniae
4. Legionella spp. / L. pneumophila
5. Fiebre Q (Coxiella burnetii)
NEUMONÍAS BACTERIANAS NOSOCOMIALES:
1. Pseudomonas aeruginosa / Acinetobacter baumanii
2. Staphylococcus aureus / mecA
3. S. aureus / Panton-Valentine Leucocidina
MICOBACTERIAS
1. M. tuberculosis Complex / MNT (Micobacterias no tuberculosis)
2. M. tuberculosis Complex / Resistencias INH y RIF
3. Mycobacterium tuberculosis Complex
4. M. Avium
NEUMONIAS FUNGICAS: ASPERGILOSIS INVASIVA / PNEUMOCYSTIS
1. Aspergillus fumigatus
2.
Pneumocystis jiroveci
NEUMONÍAS VÍRICAS:
1. Bronquilitis: Virus Respiratorio Sincitial/ Metapneumovirus
2. Bocavirus / Adenovirus
3. Gripe A/B tipado
4. Subtipado Gripe A (H1,H3, H1N1)
5. Gripe A/ H1N1 (Pandémica 2009)
6. Gripe A/ H5N1 (Gripe Aviar)
7. Gripe A/B tipado
8. RSV (Virus Respiratorio Sincitial)
9. hMPV (Metapneumovirus humano)
10. Gripe A/B/ RSV
11. ParaInfluenza 1/2/3
12. Detección Multiplex todos Virus Respiratorios
PANEL INMUNODEPRIMIDOS - TRANSPLANTE
VIRUS CARGA VIRAL (SEGUIMIENTO CON KITS CUANTITATIVOS):
1. CMV CUANTITATIVO (CE)
2. EBV CUANTITATIVO (CE)
3. BKV CUANTITATIVO (CE)
4. HHV6 CUANTITATIVO (CE)
5.
Parvovirus B19 CUANTITATIVO (CE)
LESIONES INMUNODEPRIMIDO:
1. Detección simultánea de 6 Herpesvirus
2. Detección simultánea de 3 Herpesvirus (HSV1,2,VZV)
3. Detección simultánea de CMV y EBV
4. Detección y tipado de Herpes Simplex 1/2
5. Detección de VZV
6. Detección de HHV6
7. Detección de Adenovirus
8. Detección de Poliomavius JC/BK
9. Detección de Toxoplasma gondii
PANEL ETS
1. Anyplex CT/NG
2. Ulceras gentales 1 (T. pallidum / H. ducreyi)
2 Linfogranuloma Venereo
3. MagicPlex CT/NG/UU/MG/MH
INFECCIÓN GASTROINTESTINAL
INFECCIONES BACTERIANAS INTESTINALES:
1. Helicobacter pylori
2. VTEC stx1/2
3. Clostridium difficile
4. Clostridium perfringens
5. Campylobacter
6. Salmonella
7. Yersinia enterocolitica
8. Shigella flexneri
9. Tropheryma whipplei
INFECCIONES VÍRICAS:
1. Norovirus detección y tipado I/II
2. Diarreas víricas (Rota/Noro/Astro) en desarrollo
PARÁSITOS EN HECES:
1. Giardia lamblia
2. Cryptosporidium parvum
3. Entamoeba histolytica
PANEL PARÁSITOS SANGRE / TEJIDOS
1. Chagas (T. cruzii)
2. Plasmodium sp
3. Toxoplasma gondii
4. Leishmania sp
INFECCION NOSOCOMIAL: NEUMONIA NOSOCOMIAL y SEPSIS
NEUMONÍA HOSPITALARIA ó NAV (Neumonía asociada a ventilación mecánica)
1.
Kit PASM
(Pseudomonas, Acinetobacter, Staphylococcus aureus, MecA)
CONFIRMACION en 1h35 min. de HEMOCULTIVOS POSITIVOS ó CEPAS:
1.
Kit CTXE
(Detección BLEAS CTX-M grupo 1, grupo 2 y grupo 9 ; Detección E. coli )
2.
Kit PACI
(Detección Pseudomonas aeruginosa y Acinetobacter baumanii)
3.
Kit SAMA ó Kit SAPV
(Detección Staphylococcus aureus y gen MecA)
(Detección de Staphylococcus aureus y Leucocidina de Panton Valentine )
4.
Kit NEUM
(Kit detección Neumolisina ultrasensible - Streptococcus pneumoniae-)
5.
Kit identificación levaduras
(Kit identificación Candida albicans, Candida glabrata y Candida krusei)
SEPSIS, detección directa:
1.
Screening candidemia (Candida sp)
2.
Kit NEUM
(Kit detección Neumolisina ultrasensible - Streptococcus pneumoniae-)
3.
Sepsis Screening / Identificación
DETECCION RAPIDA DE RESISTENCIAS A BETALACTAMICOS
BLEAS, CARBAPENEMASAS Y AmpC PLASMIDICAS
Desde colonias (Confirmación rápida) o directamente desde muestras clínicas
o a partir de botellas de hemocultivo positivas
1.
Kit CTXE
(Detección BLEAS CTX-M grupo 1, grupo 2 y grupo 9)
2.
Kit KPCK
(Detección Klebsiella pneumoniae/ Carbapenemasa KPC)
3.
Kit IMVI
(Detección Metalo-betalactamasas IMP/VIM)
4.
Kit AMPC
(Detección betalactamasas AmpC plasmídicas:
CIT, DHA, ACC y EBC)
DETECCION RAPIDA DE RESISTENCIAS A VANCOMICINA
1.
AnyPlex Van A, Van B, Van C
2.
MagicPlex Van A, Van B, Van C
SISTEMA SMARTCYCLER + SEEPREP:
NUEVOS REACTIVOS
NEW
MAGICPLEX (Máxima Sensibilidad en Real Time PCR)
1. Magicplex STI1 Amplification (100)
2. Magicplex CT/NG Real Time Detection (50)
3. Magicplex MG/MH/UU Real Time Detection (50)
4. Magicplex FLU A and Subtyping (H1,H3, 2009H1) (100)
5. Magicplex MTB Amplification (50)
6. Magicplex MTB Detection (50)
7. Magicplex HepaTrio Amplification (100)
8. Magicplex HepaTrio (Hepatitis A, B y C) Detection (100 test)
9. Magicplex VanR Amplification (100)
10. Magicplex VanR (VanA, VanB, VanC) Detection (100)
ANYPLEX (Real Time PCR convencional)
1.
2.
3.
4.
5.
Anyplex FluA/NewH1N1 RT Detection (100 tests)
Anyplex FluA 3 Typing (H1, H3, 2009H1) RT Detection (100 tests)
Anyplex MTB/NTM RT Detection (100 tests)
Anyplex CT/NG RT Detection (50 tests)
Anyplex VAN R RT Detection (100 tests)
Kits Real Time para otras plataformas)
1. RealStar CMV PCR Kit cuantitativo
2. RealStar EBV PCR Kit cuantitativo
3. RealStar HSV PCR Kit cuantitativo
4. RealStar VZV PCR Kit cuantitativo
5. RealStar BKV PCR Kit cuantitativo
6. RealStar JCV PCR Kit cuantitativo
7. RealStar Chikungunya virus PCR Kit
8. RealStar RSV PCR Kit
9. RealStar Norovirus tipado I/II PCR Kit
10. RealStar Parvovirus B19 PCR Kit cuantitativo
11. RealStar Clostridium difficile toxina B PCR Kit
y todos los kits de: