Download clase Proteinas II IBMC 2017

Proteínas II
Organización de la clase
•
•
•
•
•
•
Estructuras 3iª y 4iª
Supra-estructuras
Plegamiento y desplegamiento
Distintas conformaciones. Priones
Modificaciones co/post-traduccionales
Enzimas
ESTRUCTURAS 1ias, 2ias, 3ias y 4ias
entre átomos de enlaces
peptídicos cercanos en la sec 1ia
entre grupos R lejanos
en la sec 1ia
entre distintos
polipéptidos
REPASO DE DIFERENTES TIPOS DE
UNIONES ENTRE aa
SIMILITUD en ESTRUCTURA 1ia SE REFLEJA EN SIMILITUD en ESTRUCTURA 3-D
Ejemplo de ASOCIACION entre
distintos polipéptidos:
COLAGENO
ejemplo de ESTRUCTURA 4ia
HEMOGLOBINA
ejemplo de ESTRUCTURA 4ia
HEMOGLOBINA mostrando grupo
Hemo
ejemplo de ESTRUCTURA 4ia
proteína captadora de luz en bacterias
fotosintéticas
formada por 4 polipéptidos asociados
1
2y3
4
ejemplo de SUPRAESTRUCTURA:
COLAGENO
las triples hélices se asocian entre sí formando multímeros
(microfibrilla)
microfibrilla
Ejemplo de supra-estructura:
COLAGENO
fibras
al M.E.
secretada por fibroblastos
proteína más abundante en el reino animal
30% de masa total de proteínas en mamíf.
7% del peso corporal. En piel: el 70%.
Esencial para la elasticidad y flexibilidad
de los tejidos
Supraestructuras. Ensamblaje hasta formar multímeros
ejemplos: cápsides de virus
Virus de plantas
Supraestructuras. Ensamblaje
hasta formar multímeros
• ejemplos: Virus de bacterias (fagos) y animales
Supraestructuras. Ensamblaje hasta formar
multímeros
Ej: nuclepcápside y cápside de Virus con membrana.
nucleo
Plegamiento o folding
ejemplo: Ribonucleasa
Christian Anfinsen
Premio Nobel 1972
Plegamiento o folding
Si a la proteína desnaturalizada
por 1) MSH 2) calor o urea se enfría
lentamente y/o se elimina la urea,
vuelve a adquirir actividad →
Dogma de Anfinsen
(1950-1960s):
La estructura 3-D nativa determinada
sólo por secuencia de aminoácidos
(estructura 1ia)
No es válido para todas las proteínas
Además: chaperonas
PRIONES (PRoteína-INfecciosos)
Enfermedad de las vacas locas
(Encefalopatía bovina espongiforme)
Scrapie en ovejas
Creutzfeldt–Jakob disease (CJD) en humanos
Stanley Prusiner
Premio Nobel 1997
puede cambiar de conformación
soluble
normal, no patógena
modelo del
polímero.
Explica la formación
de las fibras
observadas
→ agregados insolubles
patógena
MODIFICACIONES CO- Y POST-TRADUCCIONALES
son realizadas por ENZIMAS
ENZIMAS
historia del concepto
• En el siglo XIX, estudiando
la fermentación del azúcar en
alcohol por levaduras, Louis Pasteur llegó a la
conclusión de que era catalizada por una fuerza vital
contenida en las células de la levadura, que llamó
”fermentos” (pensó que sólo funcionaban dentro
organismos vivos)
• En 1897 Eduard Buchner demostró la capacidad
de extractos de levadura para fermentar azúcar, a
pesar de la ausencia de células enteras de levadura
Premio Nobel 1907
ENZIMAS
• Catalizadores biológicos
• Proteínas o RNA (ribozimas)
• No se gastan, se reciclan
llave-cerradura
modelo sencillo de acción de una enzima
Pueden necesitar ayuda de:
• Coenzimas: moléculas orgánicas transportadoras de átomos
o grupos químicos desde una enzima a otra (ej.: NADH [vitamina B3])
• Cofactores: forman parte de la enzima (ej: Mg2+)
en el camino de reacción, forman
intermediarios covalentes con el / los
sustrato/s (ES)
en función de su acción catalítica específica, las enzimas
se clasifican en 6 grandes grupos o clases:
ej: Láctico deshidrogenasa en fermentación
Clase 1: OXIDORREDUCTASAS en levaduras y músculo; NAD(H) o NADP
deshidrogenasas en respiración y fotosíntesis
Clase 2: TRANSFERASAS
ej: peptidil-transferasa (ribozima), metil-transferasas, acetil-transferasas,
DNA y RNA polimerasas, transaminasas
Clase 3: HIDROLASAS
ej: nucleasas, proteasas, lipasas, β-galactosidasa, en tracto digestivo
Clase 4: LIASAS
Clase 5: ISOMERASAS
Clase 6: LIGASAS
ej: DNA ligasa, aa-tRNA sintetasas (requieren ATP)
las enzimas bajan la Energía de
Activación y por eso aceleran
complejo ES
“Pathways” o caminos metabólicos
¿còmo se mide
la actividad enzimática?
Factores que influyen en a
actividad enzimática
activadores e inhibidores
ejemplo de subunidades
sensibles a activador
(regulatorias )
pKA