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Human Genetics Concepts and Applications Tenth Edition RICKI LEWIS 5 Biol 4355 - Genética Humana Beyond Capítulo 5– Extensiones del Mendelismo Laws Mendel’s UPR – Aguadilla JA Cardé, PhDPowerPoint Lecture Outlines Prepared by Johnny El-Rady, University of South Florida ® Copyright ©The McGraw-Hill Companies, Inc. Permission required for reproduction or display Objetivos - - Repasar las excepciones a las leyes de Mendel penetración alelos múltiples epistasia pleiotropía otros Repasar dos tipos de transmisión genética que no se comportan como herencias de sólo un gen Mitocondrial Ligamiento 2 Excepciones a Mendel • • • Rasgos Mendelianos: 2 formas distintas La Mayoría de los genes NO muestran herencia tan simple Razones Genotípicas persisten pero Razones Fenotípicas varían por influencias fuera del gene como por ejemplo: - Alelos múltiples - Otros genes nucleares - Genes no nucleares - Ligamiento - Ambiente – 3 Alelos letales - - Genotipo letal causa la muerte antes de que el individuo se reproduzca Una de las clases de la progenie desaparece Racional: una dosis doble de algún alelo dominante puede ser letal - Ejemplos: - Enanismo acondroplástico (FGF3) Homocigotos duran 12 meses - Perros calvos mejicanos - Braquidactilia; homocigoto recesivo 4 Alelos letales Figure 5.1 Figure 5.1b 5 Alelos Múltiples • • • • Normal: 2 alelos por rasgo por individuo Un gen puede tener mútiples alelos porque su sequencia puede cambiar muchas veces Diferentes combinaciones alélicas producirán variaciones fenotípicas - PKU – tiene cientos de alelos que resultan en 4 fenotipos (Nature V45N4) – Cromosoma 12 - CF – tiene sobre 1500 alelos 6 Polimorfismos - RFLP • • • • • • Esquema del gen codificante para hidroxilasa de fenilalanina H – sitios para Hind III Probe – Sonda radioactiva Versión mutante mas corta Deleción elimina segunda H Fragmento esperado de – – • • Pedigri: Recesivo autosomal Souther Blot – – – • 3.3 no esta 4.2 no esperado aparece Padres: Ambos; 4.2, 3,3 Varón 3.3 Hembra 4.2 Avigad, S., et. al., Nature, 344:168, 1990 7 Polimorfismos: Cystic Fibrosis 8 9 10 11 12 13 14 15 16 Dominancia Incompleta Fenotipo heterocigoto está entre los dos homocigotos Ej: hipercolesterolemia familiar (FH) (Cromosoma 19) - - heterocigoto para la mutación: con la mitad de número normal de receptores para LDL en el hígado (1:500) - homocigoto para la mutación: no tiene ningún receptor para LDL; PLT los niveles de LDL en suero es extremadamente alto (1:1,000,000) 17 LDL vs HDL LDL -Grandes -30% Prote / 50% grasas -Mas liviando (menos denso) -Transportador de grasas a celulas y tejidos HDL -Pequeños -50% Proteinas / 30% grasas -Mas pesado (denso) -Limpia y lleva grasas al hígado para metabolismo Importante es; -Bajar el LDL -Subir el HDL -Dentro de límites 18 Dominancia Incompleta (FH) Figure 5.2 19 20 Codominancia - Fenotipo heterocigoto: resulta de la expresión simultánea de ambos alelos Sistema ABO codifica para antígenos de superficie en el globulo rojo - IA alelo que produce antigeno A - IB alelo que produce antigeno B - i (IO) alelo que no produce antigenos Alelos IA y IB : codominantes entre si, y ambos son dominantes sobre i 21 Figure 5.3 22 Progenie de parentales A y B Figure 5.4 Figure 5.4 23 Epistasia - Un gen afecta la expresión de otro gen Ej: Fenotipo Bombay - El gen H es epistático al gen I - La proteína H coloca una molécula en la superficie celular - A esta se adhieren los antígenos A o B - Genotipo hh = no tienen proteina H, PLT los antigenos A o B no se adhieren a la célula - Todos los genotipos hh serán fenotipo O - Aunque el tipo de sangre podría ser A, B, AB u O 24 Epistasia 25 Si la H está presente: Geno AA – H Fenotipo A Geno Ao – H Fenotipo A Geno BB – H Fenotipo B Geno Bo – H Fenotipo B Geno AB – H Fenotipo AB Geno oo – H Fenotipo O Si la H NO esta presente: Geno AA – hh Fenotipo O Geno Ao – hh Fenotipo O Geno BB – hh Fenotipo O Geno Bo – hh Fenotipo O Geno AB – hh Fenotipo O Geno oo – hh Fenotipo O 26 Penetrancia y Expresividad Penetrancia: es expresión todo o nada de un gen (Polidactilia) - SI - NO - Genotipo con penetración incompleta: si algunos individuos con el genotipo no expresan el fenotipo Expresividad: grado de severidad o extensión del fenotipo - Fenotipo con expresión variable: si los signos/síntomas varían en intensidad entre las distintas personas - los que si: a que nivel? - Ej PoliD: 2 dedos vs 3 dedos 27 28 Expresividad Variable Sindrome de Waardenburg – del 13q 29 Pleiotropía • • Un gen controla varias funciones, o tiene mas de un efecto Ej: Porphyria variegata - Afecto varios miembros de familia real Europea – Rey George III - Las condiciones parecían de desórdenes distintos no relacionados 30 Pleiotropía Figure 5.5 Figure 5.5a Figure 5.5b Photo © North Wind Picture Archives 31 Las Porfirias • Condiciones que resultan de: – • Deficiencias de cualquiera de varias enzima necesarias para la sintesis de Heme Cada condicion ocurre por la acumulación de un intermediario bioquimico - Se podia excretar en la orina - Se acumula y causa sintomas - dientes rojos - fotosensitividad - vampiros 32 Genes Associated to Porphyrias - ALAD – 9q33.1 - ALAS2 – Xp11.21 - CPOX – 3q12 - FECH – 18q21.3 - HMBS – 11q23.3 - PPOX – 1q22 - UROD – 1p34 - UROS – 10q25.2 – 26.3 Figure 5.6 33 Sindrome De Marfan Pleiotropía • Fibrilina • Lente del ojo • Arterias (aorta) aneurimas • Costillas • Brazos y piernas dedos 34 Figure 5.7 Pleiotropía Marfan https://www.dnalc.org/view/15956-What-causes-Marfan-syndrome-.html 35 Heterogeneidad Genética • Diferentes genes pueden producir fenotipo identicos - Pérdida de audición – 132 formas autosomicas recesivas - Osteogénesis imperfecta – mínimo dos genes involucrados - Alzheimer – al menos 4 genes involucrados • Como?: Genes pueden codificar enzimas que catalizan la misma ruta bioqímica, o codifican diferentes proteínas parte de la misma ruta 36 Blindness Figure 5.8 –Genes for: Vit A Activation, cleaning, Energy, cones and rods activation 37 Fenocopia • Rasgo que aparenta ser heredado, pero es causado por el ambiente • Sítomas parecen heredados • Ocurre en familias • Ejemplos: • - Exposición a teratógenos - Talidomida: defectos en las extremidades parecido a focomelia (genetica) • - Infecciones - AIDS- se pasa de madre a hijo virus can be - CF Malanutrición 38 Proyecto Genoma Humano • Ha revelado que complicaciones no Mendelianas son mas comunes de lo esperado • Términos se solapan: Epistasia y Heterogeneidad - Ejemplo: Marfan syndrome - mutación en fibrilina - mutación TGFBeta Receptor - bloquea la actividad de fibirlina WT • Interacciones entre genes: subyacente a – Penetrancias – esta o no esta – Expresividad – esta; pero a que grado - Example: Huntington disease (Asignada, Pag 96) 39 Resumen Table 5.1 40 Mitocondria Orgánulo – provee energía (ATP) Contiene DNA circular (mtDNA) - 37 genes; NO intrones - NO crossing over - Muy poca reparación - Alta exposición a radicales libres PLT -Alta tasa de mutación; > que la de nuclear 41 Herencia Mitocondrial - Genes son transmitidos - Por la madre - A todos en la progenie Figure 5.9 42 Una célula típica: - Miles de mitoco - Cada una con muchas copias del “mini-cromosome” Figure 5.10 43 DNA Mitocondrial - Resúmen Table 5.4 44 Desórdenes Mitocondriales - Genes codifican para proteinas de traduccion y sintesis de ATP - Varias enfermedades resultan de mutaciones en el mtDNA Ejemplos: - Miopatías mitocondriales – - musculos débiles y flácidos Atropia optica de Leber – Visión Transferencia Ovoplasmica- previene la transmision de desórdenes mitocondriales por parte de la mujer 45 Heteroplasmía - La secuencia del mtDNA no es la misma en todas las copias del genoma PLT - La mitocondria tendrá distintos “alelos” del mismo gen - En cada mitosis las mitocondrias se distribuye al azar - Si un ovocito es heteroplásmico - Tendra algunas copias de mtDNA mutado que podrían transmitirse - Fenotipo: refleja la proporcion de mitocondrías mutantes 46 Heteroplasmía Figure 5.11 47 DNA Mitocondrial DNA Revela el Pasado mtDNA – herramiento forense poderosa : - asociar sospechosos a crimenes - identidad de bajas de guerra - apoyo a retos historicos - el hijo de Maria Antonieta y Luis XVI mtDNA- mas estable que el nuclear - varias copias por mitocondria y varias mitocondrias por células 48 Figure 5.12 49 Ligamiento Genes ligados: ubicados cerca en el mismo cromosoma No se sortean independiente durante meiosis - Mas bien se heredan juntos o sea se empacan juntos durante gametogénesis - PLT NO producen proporciones mendelianas típicas 50 Ligamiento Figure 5.13 Identifica los 4 tipos de gametos posibles: - PL - PL - pl - pl 51 Ligamiento Genes en Cromosomas separados, PLT: Genes en el Mismo Cromosomas PLT: Se segregan Se sortean independientes No se segregan No se Sortean Se heredan juntos 52 Figure 5.14 Recombinación Recombinación cromosomal ocurre en meiosis 1 en: Se crean nuevas combinaciones de alelos Cromosomas parentales: tienen la configuración original Cromosomas recombinantes: tienen la nueva combinacion de alelos 53 Entrecruzamiento Interfiere con Ligamiento Ligamiento; predice sólo gametos: PL y pl Crossing Over; provee para nuevas combinaciones y PLT nuevos Gametos: Pl y pL Figure 5.15 54 Configuración Alélica en Dihíbridos 1) cis = los 2 alelos iguales en cada cromosoma 1) Dos dominantes o dos recesivos 2) Trans = un alelo de cada tipo en cada cromosoma 1 uno dominante y uno recesivo Figure 5.16 55 Frecuencia de Recombinación Mapas de ligamiento: se construyen usando a correlación entre frecuencia de entrecruce y la distancia entre genes - A mayor distancia entre genes mayor la probabilidad de entrecruce Figure 5.17 56 Ligamiento vs No ligamiento Cual es la probabilidad de recombinantes si NO HAY ligamiento? - ½ parental - ½ recombinantes PLT si hay ligamiento; la frecuencia de recombinates mas alta que se puede aceptar es -50% (1/2) -La frecuencia de Par y Rec sera 50% -Mas de eso puede confundirse con Segregacion y sorteo! 57 Figure 5.18 Frecuencia de Recombinación Basada en el % de divisiones meioticas que dan como resultado recombinantes, o sea se rompe el ligamiento entre alelos parentales Esta frecuencia de recombinación entre dos genes es proporcional a la distancia entre ellos - Mapa de ligamiento: representación gráfica de la distancia entre genes, deducido de las frecuencias de recombinantes 58 Mapa de ligamiento Diagrama que indica la distancia relativa entre genes 1% recombinación = 1 unidad de mama = 1 centiMorgan (cM) Estas distanciias son aditivas Figure 5.20 59 Problemas de ligamiento Los genes de Nail-patella syndrome (N) y de tipos ABO blood (I) estan en el cromosoma 9 a 10 unidades de mapa Greg y Susan, cada uno, tienen Nail-patella Syndrome (NPS). Greg es tipo A y Susan es tipo B. Cual es la probabilidad de que sus hijos sean tipo O con rodillas y uñas normales 60 Figure 5.19 El esperm normal (ni) tiene que fecundar al oocito (ni) La regla de producto: : 0.45 x 0.05 = 0.0025 or 2.25% PLT la P de un genotipo nnii es: 2.25% 61 Marcadores Genéticos Secuencias de DNA que sirven como marcas cercanas a genes de interés Desde los 80 se usan para mapas de ligamiento Actualmente se usan para GWAS: - Genome-Wide Association Studies 62 Marcadores Genéticos 63 Marcadores Genéticos - Marcador Cromosomal - - - It's not that we knew exactly where to look we didn't have any idea what genes were responsible. But we should be able to use markers on chromosomes, we should be able to use bits of protein or bits of DNA to flag chromosomal segments. And if we could in a family - in a family with - in which many women had developed breast cancer and some indeed ovarian cancer. If we could show that there were some chromosomal bits that were inherited in common by the women who developed the breast cancer but those same particular ancestral bits were not inherited by the women who had remained breast cancer-free until old age, then we might have a clue that those were the chromosomal regions in which, in principal, there might lie a gene that was responsible for inherited predisposition to breast cancer in this family. Duffy Blood Type: Receptor en RBC que liga citoquinas durante inflamación. Tambien liga a Plasmodium vivax malaria Si no tienes Fya o Fyb resistente 64 Marcadores Genéticos - Cromosomal - RFLPs: técnica basada en las variaciones en secuencias homólogas de DNA. Se refiere a diferencias entre muestras de moléculas de DNA homologos obtenidas de distintos puntos de sitios de restricción. - Huntington Disease - Huntington 65 Marcadores Genéticos - Cromosomal - RFLPs - VNTRs : lugar en el genoma donde una secuencia corta de ncltds esta organizada como un “tandem repeat”. Presente en muchos cromosomas y muestra variaciones de longitud de un individuo a otro. 66 Marcadores Genéticos - Cromosomal - RFLPs - VNTRs - STRs: un microsatelite de 2 a 13 ncltds repetidos cientos de veces en línea en una hebra del DNA. El análisis de STR mide el numero exacto de unidades repetidas. Ej: Beckett Family 67 Marcadores Genéticos - Cromosomal RFLPs VNTRs STRs - SNPs: variación en la secuencia del DNA que occurre comunment en el 1% de la población. Individuos en la población difieren en un ncltd en alguna secuencia 68 Marcadores Genéticos - Cromosomal RFLPs VNTRs STRs SNPs - CNVs : el numero de copias de un gen particular varía de un individuo a otro. Observado como resultado del proyecto Genoma Humano; EJ AUTISMO 69