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CICLO DE KREBS BOLILLA 4: (primera parte) Ciclo de Krebs. Generalidades. Descarboxilación oxidativa: complejo de la piruvato deshidrogenasa. Regulación. Destino de la acetil-CoA. Reacciones del ciclo. Balance energético. Regulación del ciclo. Función anfibólica. Compartimentalización mitocondrial. Translocasas. Lanzadera aspartato-malato. ¿Cuál es el destino del Piruvato según las condiciones celulares? GLUCOSA VG 2 PIRUVATO O2 Anaerobiosis 2 Lactato 2 Etanol + 2 CO2 Fermentación Láctica (músculo en contracción vigorosa, eritrocitos, bacterias lácticas) Fermentación Alcohólica (levaduras) O2 Aerobiosis 2 Acetil-CoA + 2 CO2 CK 4 CO2+ 4 H2O Células animales (excepción eritrocitos), vegetales y muchos microorganismos. CICLO DE KREBS O DEL ÁCIDO CÍTRICO Vía central cuya función principal es recuperar energía a partir de varios combustibles metabólicos: hidratos de carbono, ácidos grasos y aminoácidos, que se degradan a acetil-CoA por oxidación. Función de abastecimiento de reactivos para distintas vías biosintéticas. Características generales Oxida grupos acetilos de distintas fuentes, se considera un eje del metabolismo celular. El oxalacetato que se consume en el primer paso, se regenera en el último: el ciclo actúa como un catalizador de varios pasos que puede oxidar un número ilimitado de grupos acetilos. En eucariotas, todas las enzimas del ciclo se localizan en la mitocondria. Características generales El efecto neto de la oxidación de un grupo acetilo por vuelta es de 2 CO2. La energía libre de la oxidación del grupo acetilo se conserva en las coenzimas NADH y FADH2, parte se recupera en GTP. Los intermediarios del ciclo del ácido cítrico son precursores de biosíntesis de otros compuestos. DESTINO DEL PIRUVATO EN AEROBIOSIS Ingresa a la mitocondria Mecanismo de transporte (simporter) interno que co-transporta un protón Dentro de la mitocondria se descarboxila a Acetil-CoA Interviene un complejo multienzimático DESCARBOXILACIÓN OXIDATIVA mitocondria • El acetil-CoA se forma por descarboxilación oxidativa del piruvato. • Requiere de la acción del complejo multienzimático: Piruvato deshidrogenasa (PDH), constituido por tres enzimas (E1, E2 y E3, Piruvato deshidrogenasa (descarboxilasa), Dihidrolipoil transacetilasa y Lipoil deshidrogenasa) y 5 coenzimas (TPP, ác. Lipoico, Coenzima A, FAD+ y NAD+). • Forman parte del complejo dos proteínas reguladoras: una fosfatasa y una quinasa. • Ejemplo de canalización de sustratos. El grupo acetilo esta unido al grupo sulfhidrilo del CoA por un enlace tioéster. La hidrólisis del enlace tioéster del acetil-CoA libera 31,5 kJ/mol y es, por lo tanto, un enlace rico en energía. ESTRUCTURA DEL PIROFOSFATO DE TIAMINA Coenzima que proviene de Vitamina B1 Rotura de enlaces adyacentes a grupos carbonilo y transfiere grupos aldehídos activos La parte funcional es el anillo tiazólico. ESTRUCTURA DEL ACIDO LIPOICO POSEE DOS GRUPOS TIOLES ESENCIALES EN LA FORMA REDUCIDA SE ENCUENTRAN COMO HS-Y EN LA OXIDADA COMO -S-SINTERVIENE EN REACCIONES DE OXIDO-REDUCCION ACTUA COMO PORTADOR DE HIDROGENOS Y COMO PORTADOR DE ACILOS. ESTRUCTURA DE LA COENZIMA A b-Mercaptoetilamina PRECURSORES Acido pantoténico 3´fosfoadenosinadifosfato PARTICIPA EN LA TRANSFERENCIA DE GRUPOS ACILO 1) Piruvato reacciona con TPP unido a la deshidrogenasa E1, se descarboxila y forma hidroxietil-TPP. 2) Se transfieren 2 electrones y el acetilo a la forma oxidada de lipoil-lisilo de la transacetilasa, formando acetiltioéster del lipoilo reducido. 3) Transesterificación: el grupo -SH del CoA sustituye al -SH de E2, se obtiene Acetil-CoA y lipoilo reducido. 4)E3 promueve la transferencia de 2 átomos de hidrógeno desde los grupos lipoilo reducidos de E2 al FAD de E3. 5) El FADH2 de E3 transfiere un ión hidruro al NAD+, formando NADH. Se restablece la forma oxidada de lipoil-lisilo de E2 Regulación PDH Alostérica: Covalente: E1 es inhibida por fosforilación en serina por una quinasa específica y activada por una fosfoproteína fosfatasa que elimina el grupo fosfato. La quinasa es activada alostéricamente por ATP. Control hormonal: INSULINA (tejido adiposo) activa la fosfatasa. REGULACIÓN COVALENTE DESTINO DEL ACETIL-CoA REACCIONES DEL CICLO DE KREBS mitocondria 1. Condensación 2. Isomerización por deshidrataciónhidratación ACONITASA: INHIBIDA POR FLUORACETATO REQUIERE Fe3+ 3.Descarboxilación oxidativa de isocitrato Cadena de transporte electrónico: 3ATP 4. Descarboxilación oxidativa de alfa-cetoglutarato Cadena de transporte electrónico: 3 ATP Alfa cetoglutarato deshidrogenasa: enzima semejante a la Piruvato deshidrogenasa. INHIBIDA POR ARSENITO 5. Formación de succinato: fosforilación a nivel de sustrato NUCLEÓSIDO DIFOSFATO QUINASA 6. Deshidrogenación de succinato Cadena de transporte electrónico: 2ATP Enzima unida a la membrana mitocondrial interna. INHIBIDA POR MALONATO 7. Hidratación de fumarato 8. Oxidación de malato NADH + H+ Cadena de transporte electrónico: 3 ATP Provenientes del acetil CoA REGULACIÓN Mecanismos • Disponibilidad de sustratos • Inhibición por productos acumulados • Retroinhibición alostérica BALANCE ENERGÉTICO 3ATP TOTAL: 12 ATP 2ATP 3ATP 3ATP FUNCIÓN ANFIBÓLICA ACIDOS GRASOS REACCIONES CATABÓLICAS REACCIONES ANAPLERÓTICAS • La principal reacción anaplerótica es la obtención de oxaloacetato desde piruvato por la PIRUVATO CARBOXILASA. (Hígado y Riñón) (+) Acetil CoA •PEP CARBOXIQUINASA (Músculo esquelético y cardíaco). Fosfoenolpiruvato + CO2 + GDP oxalacetato + GTP •ENZIMA MALICA Piruvato + HCO3- + NADPH + H+ L-malato + NADP+ + H2O Resumen Importancia metabólica: no hay descriptas deficiencias en las enzimas del ciclo. Proceso intramitocondrial, con canalización de sustrato. Función anfibólica: no sólo oxida acetilos provenientes de distintas fuentes, sus componentes son precursores de sustancias de gran importancia biológica. En el ciclo la producción neta de energía en forma de GTP (ATP) es de una molécula; la mayor parte de la energía se conserva en forma de NADH y FADH2, los que transferidos a la cadena respiratoria impulsarán la fosforilación de ATP (total 12 ATP). ¿Cuánta energía está contenida en un mol de glucosa que es degradada hasta CO2 y H2O en condiciones de aerobiosis? COMPARTIMENTALIZACIÓN CICLO DE KREBS: INTRAMITOCONDRIAL TODO INTERCAMBIO CON EL CITOSOL REQUIERE DE LA EXISTENCIA DE TRANSPORTADORES EN LA MEMBRANA INTERNA DE LA MITOCONDRIA Sistemas lanzadera Cadena de transporte electrónico Lanzadera del glicerofosfato -Músculo esquelético -Cerebro Sistemas lanzadera -Hígado Lanzadera del malato-aspartato - Corazón - Riñón SISTEMA DE LANZADERA DEL GLICEROFOSFATO CITOSOL NADH + H+ Membrana mit.externa P-dihidroxicetona NAD+ Glicerol 3 P Deshidrogenasa Membrana mit.interna MATRIZ MITOCONDRIAL FADH2 Glicerol 3 P Deshidrogenasa Glicerol 3 P FAD+ LANZADERA DE MALATO ASPARTATO glicolisis Complejo I BALANCE ENERGÉTICO DE LA OXIDACIÓN COMPLETA DE GLUCOSA 4-6 6 6 6 2 4 6 36-38 ATP Medio de cultivo (Glucosa) Vaselina Aerobiosis Louis Pasteur (1822-1895), químico francés cuyos descubrimientos tuvieron enorme importancia en diversos campos de las ciencias naturales. Anaerobiosis 24 hs 30ºC Glucosa Glucosa Efecto Pasteur GLUCOSA O2 SIN O2 36-38 ATP 2 ATP ATP INHIBIDOR FOSFOFRUCTOQUINASA VIA DE LAS PENTOSAS Tiene lugar en el citoplasma No es una vía de producción de ATP Sintetiza ribosa-5-fosfato para la síntesis de nucleótidos Sintetiza NADPH para la síntesis de ácidos grasos, esteroides, etc. Produce intermediarios de la vía glicolítica (gliceraldehído 3-fosfato y fructosa-6-fosfato). GLUCOSA 80 % Vía Glicolítica 20% Vía de las Pentosas CARACTERISTICAS DE LAS REACCIONES DE LA VIA DE LAS PENTOSAS La vía de la pentosas consta de dos fases: Una oxidativa y una no oxidativa La reacciones de la vía oxidativa son irreversibles Las reacciones de la vía no oxidativa son reversibles Según las necesidades de la célula es activa una u otra vía. REACCIONES DE LA FASE OXIDATIVA NADP+ NADPH + H+ Glucosa-6-fosfato deshidrogenasa Lactonasa 6-fosfogluconato 6-fosfogluconolactona Glucosa-6-fosfato NADP+ NADPH + H+ CO2 6-fosfogluconato deshidrogenasa 6-fosfogluconato Ribulosa-5-P isomerasa Ribulosa 5-fosfato Ribosa-5fosfato REACCIONES DE LA FASE NO OXIDATIVA Epimerasa Transcetolasa PPT Ribulosa-5-P Xilulosa-5-P Ribosa-5-P Gliceraldehído 3-P Sedoheptulosa-7P Transaldolasa Gliceraldehído 3-P Transcetolasa + Eritrosa-4-P Xilulosa-5-P Fructosa-6-P Eritrosa-4-P Sedoheptulosa-7P + Gliceraldehído 3-P Fructosa-6-P Esquema de la Vía de las Pentosas FASE OXIDATIVA E1 Glucosa-6-P E2 PGL E3 PGN FASE NO OXIDATIVA TC Ribosa-5-P SHP TA D-Ribosa-5-P RLP PPT FP TC + GAP Xilulosa-5-fosfato E4 EP + XP FP + GA P Relación con la glicólisis Tejidos biosintéticos, con alto requerimiento de NADPH, tienen activa la fase oxidativa. Para evitar la acumulación de ribosa 5P: por la fase no oxidativa se generan Fructosa 6P y Gliceraldehído 3P, estos pueden ser oxidados por la glicólisis. En tejidos donde se requiera solo de ribosa 5P: se obtiene a través de las reacciones de la fase no oxidativa utilizando intermediarios de la glicólisis (no actúa la fase oxidativa). Importancia de la vía de las pentosas en el eritrocito Vía de las pentosas Glutation reductasa Glutation peroxidasa Menor actividad de VP: menor disponibilidad de NADPH para reducir el glutatión oxidado, esto provoca: aumento de peróxido de hidrógeno, formación de metahemoglobina, oxidaciones en membranas, lisis celular. BIBLIOGRAFÍA VOET,VOET, PRAT, “Fundamentos de Bioquímica”, Ed. Panamericana, 4da. Ed. (2013). LEHNINGER, A.L., "Principios de Bioquímica", Ed. Omega, 4ª ed. (2008). BLANCO, A., "Química Biológica", Ed. El Ateneo, 9ª ed. (2012). MURRAY, GRANNER, MAYER y RODWELL, "Bioquímica de Harper", Ed. El Manual Moderno, 26ª ed. (2003). 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