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Patología Molecular FISH (Fluorescence In Situ Hybridization) La FISH es una tecnología que utiliza sondas de DNA marcadas con un fluoróforo para detectar o confirmar anomalías génicas o cromosómicas que generalmente están más allá de la capacidad de resolución de la citogenética de rutina. La señal emitida por la sonda se observa mediante un microscopio de fluorescencia y así la muestra de DNA se puede clasificar según la presencia o ausencia de la señal. El FISH sobre células en interfase se utiliza para determinar el número de copias de uno o varios cromosomas, así como para detectar algunas reorganizaciones específicas que son características de ciertos tipos de cáncer. Su ventaja principal es que no requiere cultivo celular, por lo que se puede realizar en 24 horas si es preciso. PCR (Polymerase Chain Reaction) La técnica de PCR se basa en la amplificación de material genético (ADN o ARN) mediante la utilización de polimerasas y ciclos de calor. El producto amplificado por PCR convencional se visualiza mediante técnicas de electroforesis (agarosa o acrilamida). Otras técnicas basadas en la reacción en cadena de la polimerasa son: PCR Cuantitativa o a Tiempo Real (RQ-PCR) La RQ-PCR utiliza además moléculas de fluorocromos para poder monitorizar paso a paso y de manera cuantificable el proceso de amplificación de un segmento específico de ADN. Entre otras muchas aplicaciones, mediante la RQ-PCR podemos analizar la presencia o ausencia de un determinado gen de fusión (originado como consecuencia de una translocación cromosómica), así como determinar el número exacto de copias de dicho gen presentes en la muestra de un paciente. La PCR cuantitativa es una técnica de gran sensibilidad ya que es capaz de detectar una célula maligna entre 100.000 células, lo que permite realizar estudios de enfermedad mínima residual (EMR) en pacientes con distintos tipos de leucemia. PCR Alelo Específica (ASO-PCR) La PCR Alelo Especifica (ASO-PCR) es un sistema de PCR que utiliza cebadores o “primers” específicos de forma que permite amplificar exclusivamente un alelo concreto y no el resto de alelos posibles. De este modo tendremos solamente producto amplificado en el caso de que exista una mutación concreta en el ADN del paciente. Utilizando esta variante de la PCR convencional conseguimos aumentar la sensibilidad, lo que permite detectar mutaciones que están poco representadas en la muestra problema. PCR marcada con fluorescencia y electroforesis capilar Esta PCR utiliza cebadores (“primers”) específicos marcados con fluorocromos para poder detectar la amplificación de un segmento específico de ADN utilizando un analizador automático. Estos analizadores, basados en electroforesis capilar y detección inducida por láser, permiten realizar análisis genéticos utilizando fluorescencia para detectar los fragmentos generados. Secuenciación automática La secuenciación es una técnica que permite descifrar la composición y el orden de los nucleótidos, es decir, la secuencia de una determinada molécula o fragmento de ADN. La secuenciación del ADN utilizando equipos automáticos se basa en la detección de fluorescencia en cadenas de ADN (marcadas en los extremos 3'-OH con dideoxinucleótidos biotinilados) que se separan mediante electroforesis capilar. El análisis de la secuencia del ADN permite identificar polimorfismos y mutaciones puntuales como inserciones, deleciones o sustituciones de una o varias bases nucleotídicas, asociadas a diferentes tipos de tumores.