Download Actividad Bioinformatics Alineamiento Multiple

BT4007 – Bioinformática – Postgrado - Dr. Víctor Treviño
Nombre de la actividad
Tema/subtemas
Objetivo de aprendizaje
Tiempo estimado
Actividad de Investigación
Alineamientos Múltiples
Alineamientos múltiple de secuencias
Detección de zonas conservadas y no conservadas
Ejecutar e interpretar alineamientos múltiples
1 Hora dentro del aula
1 Hora fuera del aula
Primera fase. Dentro del Aula. Individual o en Parejas
Obtenga la secuencia aa del gen GAPDH de humano, rata, Haemophilus
influenzae, caballo, salmon, y mosca de la fruta.
Efectue un alineamiento múltiple usando al menos 2 herramientas del EBI
una de las cuales debe ser ClustalW2.
Encuentre y describa 2 zonas conservadas en todas las especies (puede
usar Jalview)
Encuentre y describa 2 zonas menos conservadas (puede usar Jalview).
Elabore un reporte con un resumen de los resultados y la metodología
usada. Puede pegar algunas gráficas. Haga comentarios.
Instrucciones
Asegúrese de que cumple con los siguientes criterios:
1. Breve y consiso
2. Incluya la metodología (sitio, y consulta)
3. Individual o por Pareja
4. La entrega es al inicio de la siguiente clase
Segunda fase. Fuera del Aula.
Busque la misma información pero para su gen de interés (no tienen que
ser las mismas especies, pero trate de incluir mas de 5, justifique su uso).
Elabore un reporte con un resumen de los resultados y la metodología
usada. Pegue algunas gráficas. Haga comentarios.
Asegúrese de que cumple con los siguientes criterios:
1. Breve y consiso
2. Incluya la metodología (sitio, y consulta)
3. Reporte Individual
4. La entrega es al inicio de la siguiente semana
Normas de participación
Producto a entregar
Recursos materiales
Evaluación
Agreguen un comentario o reflexión de lo aprendido al final de su reporte.
Respetar las ideas de los demás.
Mostrar apertura y tolerancia en la discusión.
Reporte de investigación.
Internet.
Entrega del Resumen/Comentario.
Criterios:
Nivel de cumplimiento:
1. Extensión y cobertura
2. Claridad de las ideas.
___Excelente.
3. Metodología
___Aceptable.
4. Reflexión.
___Necesita mejorar.
5. Uso diverso de fuentes
Recomendaciones
Vea el material de apoyo de la clase