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Curso de Enzimología Facultad de Ciencias 2010 Inhibición por sustrato Sistema de xantina oxidasa/xantina Diseño y puesta a punto: Gerardo Ferrer y Beatriz Alvarez En algunos casos los sistemas enzimáticos son inhibidos por sus propios sustratos cuando se encuentran en concentraciones muy altas, esto trae una desviación del comportamiento de Michaelis-Menten de la velocidad de reacción respecto a la concentración de sustrato. El sistema xantina oxidasa/xantina es uno de estos casos, para estudiarlo necesitamos los siguientes reactivos: • Disolución amortiguadora de pirofosfato 100 mM, pH 8.3 • Disolución de xantina 0.1 mM en pirofosfato 100 mM, pH 8.3 (disolución A). • Disolución de xantina 5 mM en pirofosfato 100 mM, pH 8.3 (disolución B). • Disolución de diclorofenolindofenol (DCFIF) 0.4 mM. • Disolución de xantina oxidasa. Para seguir el avance de la reacción se utilizará la desaparición del color azul de DCFIF a 600 nm (ε600 = 20.5 mM-1 cm-1) en un espectrofotómetro durante al menos 2 minutos con lecturas cada 20 segundos o menos. Las reacciones se inician por la adición de 0.1 mL de la enzima a una disolución que contiene amortiguador, DCFIF (0.04 mM) y la concentración deseada de xantina. Todas las corridas cinéticas se hacen por duplicado. Los resultados de velocidad de reacción obtenidos a diferentes concentraciones de xantina (S) se procesarán para construir los siguientes gráficos: Michaelis: v = f([S]); Lineweaver-Burk: 1/v = f(1/[S]); Dixon: 1/v = f([S]); Hill: ln(v/(vmáx-v)) = f(ln[S]) 1 Antes de comenzar: 1. Completa la siguiente tabla con los volúmenes y concentraciones de xantina que quieres estudiar, te sugerimos comenzar con una concentración mínima de xantina 5 µM y no puedes llegar a más de 4.5 mM. exp Vol DCFIF Vol buffer Vol xantina Vol xantina Vol Xantina [Xantina]0 (µM) (dis A) (dis B) oxidasa 1 0.3 0.1 2 0.3 0.1 3 0.3 0.1 4 0.3 0.1 5 0.3 0.1 6 0.3 0.1 7 0.3 0.1 8 0.3 0.1 9 0.3 0.1 10 0.3 0.1 Todos los volúmenes en mL y el volumen final debe ser siempre 3 mL 2. ¿De cuál o cuáles gráficos esperas poder obtener los valores de KM, Vmáx y Ki? ¿Cómo? 3. ¿Se te ocurre alguna secuencia de reacciones que expliquen esta inhibición? ¿Cómo harías para confirmarla? Referencias: • Dixon, M. and Webb, E. C. (1979) Enzymes, Academic Press, New York. • Rubbo, H, Radi, R. And Prodanov, E. (1991) Substrate inhibition of xantine oxidase and its influence on superoxide production; Biochimica et Biophysica Acta; 1074; 386-391 2