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CAPÍTULO 1.1.7. BIOTECNOLOGÍA PARA EL DIAGNÓSTICO DE LAS ENFERMEDADES INFECCIOSAS Y EL DESARROLLO DE VACUNAS INTRODUCCIÓN Los métodos de biología molecular se aplican cada vez más al diagnóstico de las enfermedades infecciosas y al desarrollo de vacunas. Para que estos métodos se lleguen a utilizar ampliamente, es preciso que sean fáciles, seguros, sensibles, reproducibles y finalmente automatizados para facilitar la evaluación de gran cantidad de muestras. El propósito de este capítulo es proporcionar una información básica general para el personal no especializado. Dos entregas de la Revisión Técnica y Científica de la OIE tratan de biotecnología y el diagnóstico de enfermedades animales, y se pueden consultar para una revisión más detallada (103, 104). A continuación se describen brevemente los temas tratados en este capítulo. A. 1. 2. 3. 4. Detección de ácidos nucleicos Reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y PCR en tiempo real Diagnóstico mediante el polimorfismo de la longitud de los fragmentos de restricción y estrategias basadas en las relaciones entre los ADN Diagnóstico mediante sondas de ADN y la tecnología de las micromatrices de ADN Extracción del ácido nucleico B. 1. 2. 3. 4. Detección de proteínas Inmunohistoquímica Inmunoelectrotransferencia Enzimoinmunoensayo de captura antigénica (ELISA) Proteómica C. 1. 2. Detección de anticuerpos ELISA competitivo (C-ELISA) Producción de antígenos mediante la tecnología del ADN recombinante D. 1. 2. 3. 4. 5. Vacunas Vacunas bacterianas con delección génica Vacunas marcadas y pruebas diagnósticas complementarias Vacunas con vectores víricos Vacunas de ADN Otros avances en la tecnología de las vacunas A. DETECCIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS Reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y PCR en tiempo real La PCR aprovecha los mecanismos de replicación natural del ADN y tiene como resultado la producción in vitro de grandes cantidades de una secuencia deseada de ADN a partir de una mezcla compleja de secuencias heterogéneas (134). La PCR puede amplificar una región seleccionada de 50 a varios miles de pares de bases en billones de copias. Mullis et al. (93) describen una discusión detallada sobre la metodología y las aplicaciones de la PCR. La amplificación del ADN mediante la PCR consiste en una sucesión cíclica de etapas de incubación a diferentes temperaturas. Primero el ADN diana se desnaturaliza por calor para separar las dos cadenas complementarias Manual de la OIE sobre animales terrestres 2008 1 Capítulo 1.1.7. — Biotecnología en el diagnóstico de enfermedades infecciosas y el desarrollo de vacunas para conseguir moldes monocatenarios. Posteriormente los cebadores específicos (moléculas sintéticas cortas de ADN complementario para ambas cadenas y que flanquean las secuencias diana) se asocian (hibridan) con los moldes monocatenarios a baja temperatura y se extienden con ADN polimerasa a una temperatura intermedia. Una vez que la polimerasa ha sintetizado una nueva cadena de ADN, se separa el producto del molde calentando a una temperatura mayor. Estas etapas, referidas como ciclos, se repiten 20–40 veces, lo que conlleva la amplificación de las secuencias del ADN diana. La clave para la amplificación geométrica de las secuencias del ADN diana mediante la PCR es la selección de los pares de cebadores que, cuando se extienden, crean lugares de hibridación de los cebadores recíprocos adicionales para la extensión de los cebadores en los ciclos posteriores. Para detectar el ARN (p.ej. virus de ARN), primero se debe hacer una copia de ADNc del ARN utilizando la transcriptasa inversa (RT). Entonces el ADNc actúa como molde para la amplificación mediante la PCR. A esta técnica se la denomina RT-PCR. Cualquier producto generado con la PCR, tiene, por definición, un tamaño característico. Su identidad se confirma generalmente empleando sondas de ADN (véase más abajo) o se digiere por restricción, lo que puede ser utilizado para las pruebas de los RFLP (véase más arriba). Desde la llegada de las técnicas de secuenciación de ciclo automático, lo más habitual es que la identificación se realice secuenciando de forma directa el producto de la PCR. Por ejemplo, la secuenciación se ha utilizado en la tipificación de la virulencia del virus de la gripe aviar tipo A, en el que los motivos estructurales asociados a la virulencia en el sitio de desdoblamiento del gen de la hemaglutinina son indicadores fiables de patogenicidad elevada en los pollos (63). La sensibilidad de la PCR puede aumentar utilizando un segundo juego de cebadores para amplificar un subfragmento a partir del producto de la PCR de la primera reacción. A esta técnica se la denomina normalmente “PCR anidada” y ha sido empleada para detectar niveles bajos de Anaplasma marginale en bóvidos infectados de forma persistente (158). Sin embargo, el uso de la PCR anidada puede aumentar la proporción de resultados positivos falsos. La PCR es un procedimiento muy sensible para detectar agentes infecciosos en tejidos del hospedador y vectores, incluso cuando sólo se infecta una pequeña cantidad de células del hospedador. La PCR puede apuntar y amplificar una secuencia génica que se haya integrado en el ADN de las células hospedadoras infectadas. También puede apuntar y amplificar secuencias génicas víricas no integradas. Está claro que la PCR cumple una función en las pruebas de detección de contaminación en las vacunas. Sin embargo, no diferencia entre organismos viables y no viables o fragmentos incompletos del ADN genómico, lo que puede complicar la interpretación de los resultados y afecta a la aplicabilidad de la PCR en este papel. La PCR puede resultar muy útil en el diagnóstico de las infecciones crónico-persistentes, tales como las causadas por retrovirus (virus de la leucemia bovina, virus de la artritis/encefalitis caprina, etc.). Estas enfermedades presentan problemas serios en términos de diagnóstico y prevención puesto que los animales infectados son una fuente potencial constante de transmisión. Cuando se utiliza la PCR con fines diagnósticos, se requiere un extremado cuidado para evitar la contaminación de las muestras, porque la sensibilidad exquisita de la técnica puede conducir fácilmente a resultados positivos falsos. Los estudios multicentro han demostrado que en los laboratorios las muestras positivas se detectan sin excepción, pero frecuentemente se obtienen positivos falsos con muestras negativas conocidas, lo que indica la presencia continua de problemas de contaminación (139). Se han desarrollado sistemas para solventar este problema, por ejemplo el sistema dUTP-UNG (d-uracil trifosfato y uracil-N-glicosilasa). Este sistema utiliza una reacción enzimática para degradar específicamente los productos de la PCR procedentes de la amplificación de la PCR previa (en la cual se ha incorporado dUTP) sin degradar los ácidos nucleicos moldes nativos (25). De esta forma, por supuesto, no se excluye la contaminación de la muestra con virus extraños. Actualmente se dispone de una nueva generación de sistemas automatizados controlados con microprocesadores en los que las reacciones de la PCR se pueden preparar con tan sólo un tubo que se abre en cualquier momento dado. Esto reduce enormemente el riesgo de contaminación. También es importante controlar los potenciales resultados “negativos” causados por la presencia de sustancias que interfieren en la mezcla de reacción de la PCR o en la muestra del paciente, mediante la inclusión de un molde conocido que da lugar a un producto de la PCR (25). Estas precauciones permiten que la PCR se convierta en una opción realista para las pruebas diagnósticas. Para ampliar su utilidad en los diagnósticos veterinarios y en las identificaciones de patógenos, la PCR se ha modificado ampliamente en los últimos años. La PCR en la que se utilizan cebadores ampliamente conservados se ha diseñado para la identificación de tipos de patógenos. El mejor ejemplo es el uso de secuencias del gen 16s ARNr, un gen evolutivamente conservado en especies bacterianas (52). Utilizando cebadores de PCR que son complementarios a estas regiones de secuencias conservadas, se puede determinar la presencia de cualquier clase de bacteria en la muestra. Debe advetirse que un resultado positivo de la PCR necesita una caracterización adicional mediante hibridación con sondas específicas de especie, mediante análisis por digestión de enzima de restricción o mediante secuenciación. Del mismo modo, se ha diseñado una PCR de consenso para utilizar cebadores degenerados orientados a regiones de secuencias conservadas o motivos de un grupo de patógenos relacionados (169). El uso de cebadores degenerados dirigidos a las regiones de secuencia del gen de la polimerasa del ADN herpesviral ha llevado a la identificación de muchos herpesvirus no reconocidos previamente en varias especies animales (40, 76). Por otro lado, la PCR múltiple se ha diseñado para utilizar dos o más pares de cebadores dirigidos a las secuencias únicas específicas de patógeno dentro de una única Manual de la OIE sobre animales terrestres 2008 2 Capítulo 1.1.7. — Biotecnología en el diagnóstico de enfermedades infecciosas y el desarrollo de vacunas reacción para la detección simultánea de múltiples patógenos que son de interés (41). La PCR múltiple tiene la ventaja de poseer un alto grado de sensibilidad y de especificidad. Sin embargo, han aparecido informes de que las reacciones múltiples pueden reducir la sensibilidad en comparación con las reacciones únicas, debido a la competencia. Esto debería tenerse en cuenta cuando se ha de realizar un ensayo muy sensible. Actualmente los métodos clásicos de la PCR para el diagnóstico de patógenos, tanto bacterianos como víricos, se complementan y en algunos casos se reemplazan por ensayos de PCR en tiempo real. La PCR en tiempo real controla la acumulación del producto de la PCR durante la reacción de amplificación, así permite la identificación de los ciclos durante los cuales se produce la generación del producto de la PCR casi exponencialmente. En otras palabras, el ensayo puede utilizarse para cuantificar de forma segura el contenido de ADN o ARN en una muestra dada. En contraste con la PCR convencional, la PCR en tiempo real requiere menos manipulación, es más rápida que las técnicas de PCR convencional, tiene un formato en tubo cerrado, por lo que decrece el riesgo de contaminación cruzada, es altamente sensible y específica, por lo que retiene la eficacia cualitativa y proporciona información cuantitativa. En muchos casos, los ensayos de PCR en tiempo real han demostrado ser más sensibles que los métodos de referencia existentes (58, 175). El desarrollo reciente de ensayos y máquinas portátiles de PCR en tiempo real (128) aumenta las perspectivas de estas técnicas para ser utilizadas en el diagnóstico rápido (menos de 2 horas) de brotes de enfermedad en el campo. La validación de las técnicas de PCR se incluye en el capítulo 1.1.5. Validación y control de calidad de los métodos de la reacción en cadena de la polimerasa utilizados para el diagnóstico de las enfermedades infecciosas. En este capítulo también se plantean controles internos para garantizar los resultados de la PCR. 2. Diagnóstico mediante el polimorfismo de la longitud de los fragmentos de restricción y otros enfoques relacionados basados en el ADN Es posible que las pruebas serológicas que se utilizan habitualmente para identificar los microorganismos no diferencien entre aislamientos de patógenos estrechamente relacionados, sean virus, bacterias, hongos o parásitos. Un procedimiento basado en el ADN ofrecerá la mejor discriminación que con frecuencia se requiere, y un punto de partida apropiado pueden ser los análisis del polimorfismo de la longitud de los fragmentos de restricción (RFLP). El enfoque del RFLP se basa en el hecho de que los genomas, incluso los de los patógenos estrechamente relacionados, se definen por la variación de su secuencia. Por ejemplo, el orden lineal de los nucleótidos adyacentes que abarca la secuencia de reconocimiento de un enzima de restricción específico en un genoma puede estar ausente en el genoma de una cepa o aislamiento estrechamente relacionados. En la práctica el procedimiento del RFLP consiste en el aislamiento del patógeno diana, la extracción del ADN o ARN (con la posterior trascripción inversa a ADN) y a continuación la digestión del ácido nucleico con un enzima de restricción seleccionado de un grupo. Los fragmentos individuales del ADN digerido se separan después en un gel por electroforesis y se visualizan mediante la tinción con bromuro de etidio. Lo ideal es que cada cepa revele un patrón único, o “huella dactilar”. Se pueden considerar muchos enzimas de restricción diferentes al comienzo de cada nueva unidad de trabajo, de modo que se pueda realizar el análisis de muchas huellas dactilares moleculares a partir de las digestiones con diversos enzimas de restricción individuales, y la combinación del mejor conjunto de resultados permitirá una diferenciación detallada entre las cepas o los aislamientos. Un buen ejemplo de la aplicación de esta técnica es la diferenciación de los biotipos del virus de la rabia a partir de perros o murciélagos vampiros procedentes de Latinoamérica (83). Para el estudio de los patógenos, resulta de mayor utilidad una modificación de la técnica básica del RFLP por la que se incorpora la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) como etapa preliminar. El ensayo de la PCR (descrito con más detalle en la sección 1 del presente capitulo) se utiliza para amplificar una región específica del genoma (cuyas secuencias el investigador sabe que varían de un patógeno a otro), que posteriormente sirve como ADN molde para la técnica del RFLP. Esta nueva combinación (PCR-RFLP) ofrece una sensibilidad mucho mayor para la identificación de patógenos y es especialmente útil cuando el patógeno está presente en cantidades pequeñas o es difícil de cultivar, dos rasgos que caracterizan al parásito protozoario intestinal Crisptosporidium spp. Tanto el RFLP como, más especialmente, el PCR-RFLP son extremadamente útiles para la genotipificación de cepas de Criptosporidium, ya que permiten identificar las fuentes de la infección humana y proporcionar información acerca de su epidemiología y aparición (16, 145). De este modo puede definirse la implicación de cepas o tipos específicos en un brote de enfermedad, y debería ser posible seguir el rastro epidemiológico de los aislamientos dentro de un país o entre países. Existen otros muchos ejemplos en los que se ha demostrado que las técnicas RFLP/PCR-RFLP son útiles para discriminar entre genotipos; por ejemplo, el hongo Candida (32), el virus del síndrome respiratorio y reproductivo porcino (162) y la bacteria Helicobacter pylori (54). Manual de la OIE sobre animales terrestres 2008 3 Capítulo 1.1.7. — Biotecnología en el diagnóstico de enfermedades infecciosas y el desarrollo de vacunas El patógeno humano Candida krusei proporciona un buen ejemplo de la aplicación general de una variedad de técnicas moleculares. Dassanayake et al. (32) investigaron la diversidad genética de once aislamientos orales de C. krusei e identificaron cinco genotipos diferentes mediante electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE), nueve genotipos mediante RFLP empleando el enzima HinfI, mientras que el análisis de huellas dactilares de ADN basado en el ADN polimórfico amplificado al azar (RAPD-PCR) reveló tres, ocho u once genotipos dependiendo de los cebadores utilizados. La incorporación de la PFGE facilita la separación de fragmentos grandes de ADN (hasta tamaño de megabase) y puede ser un accesorio útil para el análisis básico por RFLP. Jager et al. (66) utilizaron una combinación del enzima de restricción de corte infrecuente NotI y la PFGE para caracterizar 80 aislamientos de Coxiella burnetii a partir de animales y humanos de Europa, EE.UU., África y Asia. Distinguieron 20 patrones de restricción diferentes y el análisis filogenético de los diferentes patrones RFLP reveló relaciones evolutivas entre los grupos que se correspondían con el origen geográfico de los aislamientos. En este estudio no se detectó correlación entre el grupo de restricción y la virulencia de un aislamiento, pero enfoques similares utilizados con otros varios patógenos sugieren tal conexión. Grigg y Boothroyd (53), por ejemplo, identificaron tres puntos de restricción en el locus B1 repetido 35 veces que permitió diferenciar las cepas del tipo I (virulenta para el ratón) de las de los tipos II y III (no virulentas para el ratón) de Toxoplasma gondii. Los RFLP tienen un valor evidente para los estudios epidemiológicos, pero una interpretación más crítica de los datos del RFLP supone la construcción de bases de datos para determinar si los perfiles del RFLP están relacionados con factores tales como la virulencia, la gama de hospedadores y la relevancia clínica. En la práctica, para clasificar el aislamiento es útil no basarse en un sitio de restricción sino en la utilización de sitios en varias localizaciones dentro del genoma. Un asunto de permanente interés en el diagnóstico veterinario es la valoración correcta de cualquier diferencia molecular encontrada entre los aislamientos de un patógeno porque la pérdida o adquisición del (de los) sitio(s) de restricción puede no estar asociada con diferencias en la capacidad del patógeno para causar enfermedad, es decir, una diferencia por RFLP puede no ser significativa desde el punto de vista funcional, excepto como rasgo diferenciador Los marcadores polimórficos del RAPD que definen cepas individuales, etc. pueden secuenciarse y ser utilizados como regiones amplificadas de secuencia caracterizada (SCAR). De este modo la conversión de un marcador polimórfico anónimo a una SCAR significa que se puede realizar un solo PCR para identificar de un modo más simple un genoma específico. Lewin et al. (75) emplearon este enfoque para identificar 19 genotipos con multilocus único entre 29 cepas del protozoo Leishmania donovani. Las técnicas para poder detectar y caracterizar el ADN de un patógeno continúan mejorando y desarrollándose. El procedimiento discriminatorio fundamental es la secuenciación del genoma. La secuenciación de una porción del genoma bien caracterizado, está jugando un papel muy importante en la caracterización del patógeno y en los estudios epidemiológicos. La secuenciación de los productos amplificados por PCR utilizando cebadores degenerados dirigidos a un gen común a los virus de la misma familia se ha convertido en una importante herramienta de diagnóstico, especialmente para la identificación de miembros de una misma familia previamente no reconocidos. Un buen ejemplo es la secuenciación de amplicones de PCR degenerados a partir del gen de la polimerasa del ADN herpesvírico (169). En unos pocos casos se ha secuenciado el genoma vírico completo. Por ejemplo, el brote del síndrome respiratorio agudo severo (SARS), y la secuenciación del genoma de 29.751 bases del coronavirus asociado (86) reveló de modo práctico que el virus estaba relacionado sólo moderadamente con otros coronavirus conocidos, entre los que se encuentran dos coronavirus humanos y no parecía tener una relación próxima con ninguno de los tres grupos de coronavirus previamente establecidos. Este grado de cuestionamiento a nivel del ácido nucleico no estará disponible para estudiar la mayoría de los patógenos. Hasta dentro de muchos años no se dispondrá del conocimiento a nivel del ácido nucleico para estudiar a la mayoría de los patógenos. Las técnicas tales como el RFLP, el PCR-RFLP, el RAPD-PCR y los análisis de las SCAR continuarán desempeñando un papel central en la identificación y discriminación de los aislamientos de la mayoría de los patógenos. 3. Diagnóstico mediante sondas de ADN y la tecnología de las micromatrices de ADN Las pruebas convencionales con sondas de ADN y el análisis de micromatrices son dos lados de la misma moneda. Para ambos procesos es fundamental la unión (hibridación) del ADN procedente de una muestra sospechosa de contener un patógeno (el “desconocido”), con un ADN muy bien caracterizado procedente de un patógeno de interés (el ADN “conocido”). En las pruebas convencionales con sondas de ADN, el ADN desconocido (o ARN), la diana, se inmoviliza en una superficie sólida, p.ej. un filtro. El ADN conocido, convertido en sonda mediante marcaje o etiquetado de alguna manera, se encuentra en la fase líquida y se aplica a la diana. En el diagnóstico de micromatrices es el ADN conocido (oligonucleótidos grandes o ADN complementario) el que actúa de diana y se inmoviliza en un porta, en tanto que el ADN desconocido, en la fase líquida, es el que se marca y actúa de sonda. Manual de la OIE sobre animales terrestres 2008 4 Capítulo 1.1.7. — Biotecnología en el diagnóstico de enfermedades infecciosas y el desarrollo de vacunas En las pruebas convencionales con sondas de ADN la diana pueden ser ácidos nucleicos extraídos a partir de un material clínico o de células en cultivo y o (a) se añaden a filtros (transferencia de gotas que quedan en forma de manchas, tipo “dot blot” o en ranura, en forma de línea, tipo “spot blot”) o (b), de manera menos conveniente en un contexto diagnóstico, se transfieren a un filtro después de una electroforesis en gel. La cantidad de patógeno en una muestra clínica podría ser demasiado reducida para ser detectada. Consecuentemente, se podría amplificar el ácido nucleico mediante PCR o PCR de trascripción inversa (RT-PCR), aplicándose el producto de la PCR al filtro. Con objeto de visualizar una sonda unida a su diana, la sonda se puede marcar con un nucleido radiactivo, o de forma más habitual y segura, con un “etiquetado” no radiactivo. Por ejemplo, se pueden incorporar en la sonda biotina o psoraleno–biotina, y unido a la sonda se detecta mediante la adición de estreptavidina ligada a un enzima para la generación posterior de color o luz (quimioluminiscencia). La micromatríz se denomina así porque puede constar de 20.000 o más ADNs conocidos diferentes, cada ADN se coloca en pequeñas muestras sobre portas formando una matriz. Cada mancha de muestra es de tan sólo 10 μm de diámetro. Para preparar las matrices se pueden utilizar ADNs complementarios de partes de genes seleccionados de los patógenos (17). Sin embargo, si se va a investigar un gran número de patógenos, entonces sería más fácil desde un punto de vista logístico utilizar oligonucleótidos grandes. La micromatriz que se utilizó para identificar al virus SARS al ser un coronavirus tenía oligonucleótidos formados por 70 nucleótidos (70-mer) (174). En el sondeo de la micromatriz esta es la muestra a partir de la que se prepara la sonda. Esencialmente, el ácido nucleico se extrae a partir de una muestra y se realiza una (RT-) PCR empleando oligonucleótidos cebadores al azar. De esta manera parte de todos los ácidos nucleicos de la muestra, tanto de origen hospedador como patógeno, se amplifican. Estos productos de PCR, representativos de cada ácido nucleico de la muestra, se marcan con un colorante fluorescente y se aplican a la micromatriz. En condiciones óptimas sólo el ADN procedente del patógeno se unirá al ADN del porta. Si se está interesado en detectar únicamente un patógeno particular o un grupo de patógenos relacionados entonces los oligonucleótidos específicos del patógeno se pueden utilizar para amplificarlos en la muestra con el fin de obtener la sonda. Se pueden diseñar micromatrices para detectar patógenos a distintos niveles de diferenciación. En el caso de oligonucleótidos ADN diana inicialmente se pueden preparar oligonucleótidos capaces de detectar y diferenciar patógenos a nivel de género. Se elegiría un número, quizás 10 o así, de oligonucleótidos con un grado elevado de conservación de secuencia (oligonucleótidos consenso) dentro de un género dado, de modo que una sonda hecha a partir de una muestra de campo que contenga un miembro de este género probablemente hibridaría con al menos alguno de los nucleótidos, mientras que no hibridaría (o lo haría en menor grado) con aquellos correspondientes a los géneros relacionados,( p.ej. para diferenciar los aislamientos de Apthovirus (causantes de la fiebre aftosa, FMDV) a partir de cepas de Enterovirus de la familia Picornaviridae. Después se podrían seleccionar otros juegos de oligonucleótidos, colocarlos en el mismo porta de la matriz, capaces de caracterizar un patógeno de forma más específica, (p.ej. para diferenciar los siete tipos de FMDV e incluso potencialmente afinar después a nivel de subtipo.) En el sondeo convencional del ADN la detección de un patógeno está limitada por la cantidad de sondas empleadas, mientras que en el análisis de micromatrices sólo se está limitado por la cantidad de ADNs diana en la matriz. Si una micromatriz tiene 1000 oligonucleótidos diferentes, entonces para conseguir el mismo poder de resolución que el sondeo convencional serían necesarias 1.000 sondas, 1.000 reacciones de sondeo separadas. La gran ventaja del análisis de micromatrices en la investigación de los patógenos es que cientos de patógenos se pueden buscar de manera simultánea al sondear un único porta de micromatriz. Claramente, el análisis de micromatrices presenta un enorme potencial cuando se investigan enfermedades de etiología desconocida, enfermedades en las que más de un patógeno puede estar presente y cuando se precisa la subtipificación. Para mejorar la sensibilidad en la detección de los patógenos se pueden complementar las micromatrices con amplificaciones por la PCR. Estas PCR se diseñan generalmente para amplificar uno o más genes conservados o secuencias múltiples, tales como la PCR en la que se utilizan cebadores ampliamente conservados, la PCR de consenso, y la PCR múltiple, como se mencionó en esta sección. Si se tiene un patógeno in mente, entonces la utilización de una micromatriz está menos justificada, puesto que la producción e hibridación es relativamente cara. En cambio, para estos casos más simples, se podrían emplear PCRs específicas de patógeno/subtipo, seguidas de la secuenciación o análisis de los fragmentos de restricción para conseguir la confirmación. Si la experiencia previa en biotecnología es indicativa del futuro, entonces es de esperar que los reactivos y el equipamiento de las micromatrices sean menos costosos, lo que conducirá a una mayor aplicación de esta tecnología en el diagnóstico de las enfermedades animales. Conseguirá que la investigación de los virus o la caracterización de las cepas bacterianas en términos de virulencia, sensibilidad antimicrobiana, u otros marcadores importantes. Uno de los mayores retos afrontados cuando se utilizan los métodos basados en la matríz, es el manejo y el análisis del amplio conjunto de datos que se generan. 4. Extracción del ácido nucleico Las principales variantes de los ensayos de diagnóstico moleculares descritos más adelante en esta sección dependen por completo de la disponibilidad de mezclas de ácido nucleico “limpias” para actuar como molde en las reacciones. Mientras que es relativamente fácil extraer ADN de cultivos bacterianos o de sangre, es Manual de la OIE sobre animales terrestres 2008 5 Capítulo 1.1.7. — Biotecnología en el diagnóstico de enfermedades infecciosas y el desarrollo de vacunas técnicamente más complicado preparar material adecuado a partir de muestras fecales o de material procedente de abortos. Esta fase es crítica porque si el material de pruebas no se ha purificado de contaminantes en la muestra clínica, se compromete la fase de prueba y pueden obtenerse resultados falsos (capítulo1.1.5 Validación y control de calidad de los métodos de la reacción en cadena de la polimerasa utilizados para el diagnóstico de las enfermedades infecciosas). Existe una variedad de métodos especializados para tipos concretos de muestras y tejidos, algunos de los cuales están actualmente disponibles en el mercado como sistemas manuales o automatizados para estaciones de trabajo robotizadas. Estas tienen la finalidad de mejorar la fiabilidad de la extracción del ácido nucleico a partir de diferentes muestras, pero se trata de una tarea que ha de perfeccionarse. B. DETECCIÓN DE PROTEÍNAS 1. Inmunohistoquímica Como complemento al aislamiento de los organismos causantes de las enfermedades, la inmunohistoquímica se está convirtiendo rápidamente en una herramienta estándar en los laboratorios de diagnóstico para la identificación de antígenos asociados con virus, bacterias y protozoos y la encefalopatía espongiforme transmisible (124). La detección in situ de antígenos en tejidos fijados ofrece una serie de ventajas sobre otras técnicas diagnósticas. Estas ventajas son: (a) la comodidad en la presentación de las muestras; (b) el manejo seguro de los potenciales patógenos humanos; (c) los estudios retrospectivos de muestras conservadas; (d) la rapidez; y (e) la detección de organismos no viables (55). La inmunohistoquímica también se utiliza para detectar proteínas priónicas anormales (PrPSc) en el tejido cerebral para confirmar enfermedades como el prurigo lumbar, la encefalopatía espongiforme bovina y otras encefalopatías espongiformes transmisibles y ha demostrado ser más sensible que el examen histopatológico para el diagnóstico de estas enfermedades (156). La demostración de PrPSc en biopsias de tejido linfoide, p.ej. en la membrana nictitante, también puede ser utilizada para el diagnóstico del prurigo lumbar (101). A medida que aumente la cantidad de anticuerpos monoclonales (MAb) para definir antígenos, aumentará el empleo de la inmunohistoquímica para la identificación de organismos y otros marcadores específicos de la autoinmunidad y la neoplasia. La etapa limitante en el proceso de inmunohistoquímica consiste en identificar una combinación MAb/antígeno que se una a los tejidos fijados con formalina. Este inconveniente se puede superar utilizando secciones congeladas o empleando técnicas recuperadoras del antígeno (p.ej. digestión con enzimas proteolíticos, microondas) antes de la inmunotinción. 2. Inmunoelectrotransferencia La inmunoelectrotransferencia combina la resolución elevada de la electroforesis en gel con la especificidad de la detección inmunoquímica y ofrece un medio para identificar los epítopos inmunodominantes reconocidos por los anticuerpos a partir de animales infectados o los MAb dirigidos contra el agente diana. El procedimiento de inmunotransferencia se puede dividir en seis etapas: a) Preparación de la muestra b) Resolución del antígeno mediante electroforesis en gel c) Transferencia de los polipéptidos separados a un soporte de membrana (membrana de nitrocelulosa) d) Bloqueo de los sitios de unión inespecíficos en la membrana e) Incubación con anticuerpo de detección f) Detección del anticuerpo de unión Es crítica la elección del anticuerpo de detección. Los sueros policlonales están compuestos de una variedad de anticuerpos que refleja el repertorio completo de la respuesta inmune frente a un antígeno complejo particular. Por tanto, detectarán una cantidad de polipéptidos distintos que proporciona un “perfil” característico de reactividad. Los MAb se unen sólo a un epítopo, por lo que son adecuados para identificar polipéptidos muy específicos. Después de la incubación con el anticuerpo de detección, cualquier anticuerpo que se una a las bandas de proteínas específicas se visualizará empleando antisueros anti-especie conjugados a enzimas de marcaje y un sustrato/cromógeno adecuado. La inmunoelectrotransferencia se lleva a cabo principalmente en los laboratorios de diagnóstico para identificar y/o caracterizar agentes infecciosos basándose en la especificidad del antígeno o empleando antígenos conocidos para buscar una respuesta serológica específica. Frecuentemente, los resultados positivos-falsos o negativos falsos de otros ensayos diagnósticos se pueden resolver mediante una inmunoelectrotransferencia (89). Como un ejemplo de detección de antígeno, la inmunotransferencia es el principal método de detección para la EEB y el prurigo lumbar; se ha utilizado en millones de muestras de cerebro en Europa y en otros sitios para la detección de la proteína del prión (138). Técnicas revisadas de inmunotransferencia (por ejemplo SAF- Manual de la OIE sobre animales terrestres 2008 6 Capítulo 1.1.7. — Biotecnología en el diagnóstico de enfermedades infecciosas y el desarrollo de vacunas Western blot) se utilizan como métodos de prueba confirmativos (8) y para diferenciar entre el prurigo lumbar y la EEB (146). Asimismo, se emplea con frecuencia para determinar la especificidad de los MAb individuales. Los polipéptidos purificados individuales (o proteínas de expresión recombinante) también se pueden transferir a membranas de nitrocelulosa mediante inmunoelectrotransferencia para examinar la reactividad de los sueros problema hacia proteínas individuales. Este perfil característico de reactividad se puede utilizar para ayudar a distinguir entre los animales vacunados y los infectados, tales como la prueba EITB, el método Western Blot para la fiebre aftosa, que es muy usado en Sudamérica (10). El factor primordial que afecta al éxito de la técnica de inmunoelectrotransferencia es la naturaleza de los epítopos que son reconocidos por los anticuerpos. Las técnicas en gel de máxima resolución implican alguna forma de desnaturalización del antígeno. Esto destruye los determinantes conformacionales y únicamente permite la detección de los epítopos lineales o no conformacionales. La mayoría de los antisueros policlonales contiene anticuerpos que reaccionan tanto con los epítopos lineales como con los conformacionales, pero los MAb están dirigidos a los epítopos individuales; así si ellos apuntan a los epítopos conformacionales, no reaccionarán con proteína desnaturalizada. Para detectar patógenos en muestras de tejido, que contienen una gran cantidad de proteína, se requiere la concentración selectiva del antígeno y métodos de detección muy sensibles. Se utilizan buenos ejemplos de estas técnicas para la detección de la proteína del prión del prurigo lumbar (PrPSc) (91). Después de la eliminación de la proteína del prión normal mediante la digestión de la proteinasa, el PrPSc se concentra por precipitación de fosfotungstato sódico o precipitación de alcohol, y se detecta el compuesto anticuerpo-antígeno en el filtro o en la placa del ELISA mediante el uso de un sustrato de luminiscencia química y la utilización de una cámara CCD o una placa de rayos X para eliminar la emisión de fondo (12, 133). 3. Enzimoinmunoensayo de captura antigénica (ELISA) El enzimoinmunoensayo de captura antigénica (ELISA) facilita la detección de antígenos de patógenos directamente a partir de un animal antes o durante el desarrollo de la enfermedad clínica. Comúnmente, el ELISA sigue un formato de ensayo tipo sándwich empleando anticuerpos de captura y de detección (ya sean anticuerpos policlonales o MAb). Primero el antígeno de la muestra problema se captura mediante un anticuerpo policlonal o MAb específico unido a un soporte en fase sólida y su presencia se detecta utilizando un segundo anticuerpo policlonal o MAb, que puede tener marcaje radioactivo o más generalmente, enzimático (conjugado). Si el anticuerpo de detección no está conjugado entonces se emplea un conjugado (reactivo para el anticuerpo detector) anti-especie. El anticuerpo de captura selecciona el antígeno diana a partir de otras proteínas competidoras presentes en las suspensiones de la muestra y asegura que está semi-concentrado para incrementar las posibilidades de su detección. Las características deseadas del MAb de captura son fuerte unión al patógeno, reconocimiento de un epítopo conservado y muy específico para el agente diana y la capacidad de adhesión a las placas ELISA sin que pierda reactividad. Además, con frecuencia se utiliza como parte de un sistema indicador un segundo MAb que reconoce un epítopo distinto del que es reconocido por el MAb de captura que se une a la placa ELISA. Sin embargo, puede resultar difícil identificar los MAb de reactividad intratípica completa por lo que es posible que se prefieran los antisueros policlonales para aumentar la probabilidad de reacción contra todas las variantes antigénicas. Como ejemplos de ELISA de captura antigénica están el sistema de detección de Anaplasma marginale en sangre de vacas preclínicas (160), la utilización del ELISA de captura antigénica con muestras de sangre de vaca para detectar el virus de la diarrea vírica bovina (88, 136) y la detección rápida de los antígenos de los virus de la peste bovina y la peste de los pequeños rumiantes en muestras clínicas (79). El antígeno respiratorio sincitial en secreciones nasales se capturó empleando un ELISA con MAb dirigidos contra epítopos de la cápsida vírica (102). Se han validado ampliamente varios Elisa de captura para la detección de la proteína del prión y se utilizan como métodos rápidos de análisis en todo el mundo (42, 44, 91). Los Elisa de captura también se utilizan ampliamente para pruebas de la enfermedad de debilitamiento crónico en ciervos (60), y las pruebas de prurigo lumbar en ovejas y cabras (43). Un método de captura relacionado con el antígeno, la prueba Priostrip, que es un método en el que se utilizan tiras reactivas, también se usa como una prueba de análisis rápida de la EEB (44). Actualmente algunos métodos de captura antigénica relacionados que utilizan perlas inmunomagnéticas se consideran métodos importantes y han tenido una buena aceptación para detectar ciertas infecciones bacterianas, entre ellas las debidas a Listeria, Salmonella y Escherichia coli. El principio de esta tecnología se apoya en la separación inmunomagnética, es decir, la utilización de pequeñas partículas super-paramagnéticas o perlas recubiertas de anticuerpos contra los antígenos de superficie de las células. Las bacterias intactas y sus determinantes antígenicos solubles pueden determinarse después de la extracción magnética de la muestra de prueba, utilizando un segundo anticuerpo en un formato de sandwich. Una unión libre de superficie sólida, los ensayos de captura antigénica en los que se utilizan perlas inmunomagnéticas, pueden acentuar la cinética de una reacción de anticuerpo-antígeno. Como resultado, se reduce tanto la unión no específica como el tiempo de incubación. La validación de las pruebas para detectar anticuerpos se aborda en el capítulo I.1.4 Principios de validación para las pruebas de diagnóstico de las enfermedades infecciosas. Manual de la OIE sobre animales terrestres 2008 7 Capítulo 1.1.7. — Biotecnología en el diagnóstico de enfermedades infecciosas y el desarrollo de vacunas 4. Inmunocromatografía La inmunocromatografía proporciona un método apropiado para la detección de antígenos en varios minutos sin un mecanismo especial (3, 84). La muestra se aplica sobre un extremo del filtro y se emplean las microperlas (como el oro coloidal) conjugadas con anticuerpo. El anticuerpo se une al complejo antígeno-microperla, se atrapa en el segundo anticuerpo que está en el filtro y se visualiza fácilmente en el lugar donde se fijó el segundo anticuerpo. 4. Proteómica El proteoma es el conjunto completo de proteínas que se expresan en una célula, un tejido o un organismo y la proteómica es el estudio de las proteínas, incluyendo su nivel de expresión, modificación post-traduccional e interacción con otras proteínas, a gran escala. Puesto que no todas las proteínas se expresan a la vez y en todo momento, pero son dependientes de factores fisiológicos y ambientales, la proteómica puede proporcionar una visión global excelente de los procesos característicos de la enfermedad a nivel de proteínas. Debido a que la aplicación de la proteómica en el desarrollo de nuevas drogas promete unas ganancias económicas enormes, las compañías de todo el mundo han invertido rápidamente sus recursos en este nuevo campo de investigación (22). Muchos métodos empleados en proteómica, como la electroforesis bidimensional en gel (2DGE) y la espectrometría de masas (MS) están establecidos desde hace años. Sin embargo, los avances recientes en las técnicas MS, junto con la secuenciación completa del genoma y el desarrollo de plataformas robóticas y bioinformáticas potentes, han revolucionado la identificación de las proteínas. El principio general de la proteómica es que las proteínas se separan, normalmente mediante 2DGE en geles de poliacrilamida, a continuación las manchas de las proteínas se recortan, se digieren con tripsina y los péptidos resultantes se analizan mediante MS. Las masas de estos péptidos son entonces comparadas con las masas predecibles de péptidos procedentes de los análisis informatizados de las bases de datos del genoma, con lo que se consigue la identificación del gen. También se puede utilizar la MS para deducir la secuencia de aminoácidos de los péptidos y caracterizar las modificaciones post-traduccionales tales como la glicosilación o la fosforilación. La 2DGE muestra algunas limitaciones, particularmente para la separación de proteínas hidrofóbicas, y actualmente se consideran más adecuadas para algunas aplicaciones otras técnicas de separación basadas en la cromatografía líquida. Sin embargo, la 2DGE es el método de elección para crear mapas cuantitativos de expresión génica y permite que se puedan analizar muchos miles de proteínas en un corto periodo de tiempo. Se pueden medir directamente alteraciones en el proteoma de los tejidos o fluidos corporales como el suero, la orina o el líquido cerebro-espinal de modo que los cambios que sucedan en el desarrollo de la enfermedad se pueden indicar con toda precisión. Este enfoque puede conseguir identificar moléculas que pueden ser diana de terapias nuevas y, al mismo tiempo, es una herramienta muy poderosa para el diagnóstico precoz de enfermedades. Las aplicaciones clínicas mejor establecidas de la proteómica se encuentran por ahora en la identificación de marcadores para el diagnóstico precoz de casos de cáncer, como el de vejiga de la orina (127). No obstante, también está en curso una investigación considerable en otras áreas tales como la de la enfermedad cardiaca (68), la enfermedad de Alzheimer (27) y la diabetes insulina-dependiente (1). La utilización de la proteómica para el diagnóstico de las enfermedades infecciosas está al comienzo de su desarrollo pero puede resultar ser de importancia notable. Por ejemplo, el diagnóstico definitivo de la enfermedad crónica provocada por el virus de la hepatitis B (HBV) todavía se basa en la biopsia hepática, pero el análisis proteómico de las muestras del suero muestra que la expresión de al menos siete proteínas séricas cambia significativamente en los pacientes crónicos con el HBV (57). De manera similar, el diagnóstico diferencial ante mórtem de la enfermedad de Creutzfeldt-Jakob (CJD) se puede beneficiar de la proteómica ya que los datos preliminares muestran que siete proteínas del líquido cerebro-espinal (CSF) se expresan de modo diferente entre los pacientes con la CJD variante o esporádica (28). Una aplicación de la proteómica de extremada utilidad para el diagnóstico de enfermedades infecciosas es la identificación de nuevos antígenos de diagnóstico para estudios de detección en sueros procedentes de individuos infectados y no infectados enfrentándolos a proteomas de agentes infecciosos sometidos a 2DGE e inmunotransferencia. Llevando a cabo este tipo de estrategia con los sueros humanos, se han identificado nueve nuevos antígenos con potencial aplicación inmunodiagnóstica en Helicobacter pylori (50), más de 80 antígenos en Borrelia burgdorferi que potencialmente podrían diferenciar entre pacientes con síntomas tempranos y tardíos de la enfermedad de Lyme (68) y siete antígenos de Toxoplasma gondii que quizás podrían diferenciar entre la toxoplasmosis aguda y latente (68). Dentro del campo veterinario, en la actualidad están en marcha proyectos de investigación basados en la proteómica e indudablemente producirán nuevas herramientas de diagnóstico de utilidad en el futuro. Se están consiguiendo mapas proteómicos de una variedad de patógenos de interés veterinario entre los que hay bacterias como Brucella melitensis (92) y Streptococcus agalactiae (65), protozoos como Toxoplasma gondii (29), Eimeria tenella (21) y Trypanosoma brucei (130) y nemátodos como Haemonchus contortus (179). Manual de la OIE sobre animales terrestres 2008 8 Capítulo 1.1.7. — Biotecnología en el diagnóstico de enfermedades infecciosas y el desarrollo de vacunas C. DETECCIÓN DE ANTICUERPOS 1. Enzimoinmunoensayo competitivo (C-ELISA) El ELISA competitivo (C-ELISA) es un inmunoensayo que puede utilizarse para detectar o cuantificar los anticuerpos o el antígeno, utilizando un método competitivo. El C-ELISA para la detección de anticuerpos específicos ha reemplazado principalmente al ELISA indirecto para la detección a gran escala y la vigilancia serológica. El C-ELISA ofrece ventajas significativas sobre el ensayo indirecto puesto que se pueden analizar muestras de muchas especies sin necesidad de utilizar conjugados específicos de especie marcados con un enzima para cada especie a probar. La purificación de muchos antígenos es extremadamente difícil o requiere mucho tiempo. Si se utilizara un ensayo indirecto, se obtendrían valores elevados de fondo debido a uniones inespecíficas. Sin embargo, se pueden emplear antígenos relativamente crudos en el C-ELISA siempre que el “anticuerpo de detección” tenga la especificidad deseada. El principio del ensayo competitivo para la detección de anticuerpos se basa en la competición entre el suero problema y el anticuerpo de detección. La unión específica del anticuerpo de detección se detecta utilizando un conjugado anti-especie apropiado. La reducción obtenida del color esperado se debe a la unión de los anticuerpos presentes en el suero problema, lo que impide la unión del anticuerpo de detección. El anticuerpo de detección puede ser policlonal o monoclonal dependiendo de la especificidad que se requiera. Los MAb dirigidos contra epítopos muy conservados darán ensayos de reactividad amplia mientras que los dirigidos contra epítopos muy específicos tendrán como resultado una prueba muy específica. Una de las primeras referencias sobre la utilización del C-ELISA fue su empleo en la detección de los anticuerpos anti-virus de la lengua azul (4). Se utilizó un MAb contra P7 un epítopo muy conservado del virus de la lengua azul (BTV) y esto permitió detectar anticuerpos frente a los 24 serotipos existentes del BTV. El epitopo no lo comparte ningún otro serogrupo de los Orbivirus estrechamente relacionados, por tanto, la prueba también es específica de BTV. La especificidad del ensayo puede, de este modo, ser adaptada en función de la especificidad del anticuerpo de detección. La sensibilidad del C-ELISA se mejora utilizando anticuerpos de detección conjugados con un enzima (77). El formato C-ELISA se ha utilizado con éxito para detectar en gran número de sueros de cerdo los anticuerpos de la fiebre porcina clásica (177), detectar anticuerpos frente al virus de la fiebre catarral maligna en ovejas, ciervos y bisontes infectados asintomáticos (77, 78) y anticuerpos frente a Babesia equi y B. caballi en caballos con infección persistente (71, 72). Se ha utilizado ampliamente un ELISA competitivo para brucelosis, basado en el lipopolisacárido liso inmunodominante de Brucella como una prueba de análisis para la brucelosis en bovinos (98), caprinos y ovinos (96), porcinos (97) y mamíferos marinos (99). Más recientemente, se ha empleado el CELISA en fase sólida para la vigilancia serológica durante el brote de FA de 2001 en el Reino Unido (107). Este ensayo ha facilitado el examen de unos 3 millones de sueros en menos de un año. 2. Producción de antígenos mediante la tecnología del ADN recombinante Los avances en genética y biología molecular de la década de 1970 iniciaron el desarrollo de la tecnología del ADN recombinante. Desde entonces el impacto de esta tecnología es tal que juega un papel vital tanto en la investigación científica como en el diagnóstico y tratamiento de enfermedades. La tecnología del ADN recombinante simplemente se refiere a la transferencia de un gen de un organismo a otro, literalmente, supone la recombinación del ADN procedente de diferentes fuentes. Entre los objetivos de la tecnología del ADN recombinante destacan la identificación, el aislamiento, la modificación y la re-expresión de genes en otros hospedadores u organismos. Estas etapas permiten al personal científico y clínico la identificación de nuevos genes y las proteínas que estos codifican, corregir defectos genéticos endógenos y producir grandes cantidades de productos génicos específicos tales como hormonas, antígenos para usar en vacunas y otras proteínas producidas por agentes biológicos de interés. De particular importancia es el grado de especificidad que se alcanza en las pruebas de diagnóstico por la utilización de proteínas recombinantes. Un ejemplo es el empleo de ESAT-6/CFO-10 (antígenos inmunogénicos secretados) presente en las micobacterias virulentas Mycobacterium bovis and M. tuberculosis pero no en la avirulenta BCG ni en la mayoría de micobacterias ambientales, para el diagnóstico de la tuberculosis en vacas y en el hombre (24, 161). Los péptidos solapados de los antígenos ESAT6 y CFP-10 de M. tuberculosis aumentan la especificidad cuando se utilizan en la prueba ELISPOT para la detección del gamma interferón en el diagnóstico de la infección por M. tuberculosis (61). Presenta el potencial de proporcionar un grado de especificidad en el diagnóstico no alcanzable con la proteína purificada derivada (PPD), el extracto bacteriano que actualmente se utiliza. Las proteínas nativas son quizás los antígenos ideales, proporcionando epítopos de secuencias específicas y estructurales de superficie. Muchas pruebas de diagnóstico actuales necesitan antígenos de prueba que tienen que ser producidos de forma continua a partir de cultivos celulares o recogiéndolos de animales infectados. Estas preparaciones antigénicas son costosas y con frecuencia tienen un periodo corto de validez, siendo necesaria la estandarización del antígeno en cada nuevo lote. En escasas ocasiones se dispone de proteínas naturales en una forma completamente pura, y a menudo se desarrollan anticuerpos contra polipéptidos contaminantes que pueden conducir a resultados positivos-falsos. La tecnología del ADN recombinante produce antígenos que Manual de la OIE sobre animales terrestres 2008 9 Capítulo 1.1.7. — Biotecnología en el diagnóstico de enfermedades infecciosas y el desarrollo de vacunas ofrecen muchas ventajas sobre los antígenos aislamientos a partir de otras fuentes biológicas. Algunas de estas ventajas son la alta pureza, la elevada actividad específica y puesto que la proteína se sintetiza en células crecidas en el laboratorio modificadas genéticamente, cada preparación del producto proteico es idéntica a la preparación previa, asegurándose la invariabilidad lote a lote. Cuando se utilizan antígenos recombinantes en combinación con un formato C-ELISA, puede no ser necesaria la purificación del antígeno recombinante a partir del lisado porque la especificidad del C-ELISA reside principalmente en el MAb utilizado. Un ejemplo de este procedimiento es la clonación de los genes de la envuelta del lentivirus de la artritis/encefalitis caprina en un vector de expresión vaccinia (80). Los péptidos sintéticos también pueden utilizarse como antígenos valiosos para diagnósticos veterinarios de laboratorio. Las pruebas de diagnóstico basadas en los péptidos se apoyan en la selección de fragmentos cortos que contienen los epítopos antigénicos (lineales) más potentes que son reconocidos por anticuerpos específicos inducidos por todas las proteínas víricas. En los últimos años, los péptidos sintéticos que imitan a los epítopos específicos de las proteínas de agentes infecciosos se han utilizado en sistemas de diagnóstico de varias enfermedades humanas y animales. Tanto las proteínas recombinantes como los péptidos sintéticos, utilizados como antígenos, son útiles para las pruebas de diagnóstico acompañantes en DIVA, diferenciando los animales infectados de los vacunados. Las vacunas marcadoras llevan al menos una proteína antigénica menos que la correspondiente al tipo de virus de campo, que permite el rastreo serológico de las cepas de campo en individuos vacunados (59). A continuación se indica un resumen del procedimiento para la producción de un antígeno mediante la tecnología del ADN recombinante. La identificación de un antígeno de significación científica o diagnóstica potencial se consigue mediante el estudio de la respuesta de anticuerpos del hospedador frente a las proteínas del organismo en cuestión. Los antígenos inmunodominantes, proteínas definidas del organismo contra las que el hospedador responde con el título diagnóstico potencial mayor, son de interés particular ya que son los principales estimuladores de la inmunidad celular y humoral contra la enfermedad concreta. Muchos estudios encaminados al descubrimiento de antígenos tratan de identificar antígenos inmunodominantes, de relevancia biológica para ser empleados en la generación de MAb y en el desarrollo de vacunas. Una vez que se ha identificado una proteína de interés, se genera el gen que codifica la proteína utilizando en ARN mensajero (ARNm) del organismo como molde para fabricar el ADNc. Este método de clonación del gen que codifica la proteína de interés requiere un conocimiento previo acerca de la secuencia génica, ya sea directamente del organismo en cuestión o a través de la utilización de secuencias génicas de especies estrechamente relacionadas con él. Un método alternativo, cuando no se dispone de la secuencia génica, consiste en la generación de librerías recombinantes procedentes del ADN genómico del organismo o del ADNc sintetizado a partir del ARNm. Se pueden clonar fragmentos de las librerías recombinantes en un sistema de expresión, que puede ser procariótico o eucariótico, y se puede examinar la librería génica para detectar la expresión de la proteína. Existe una amplia variedad de sistemas de expresión. La proteína se puede expresar en bacterias, normalmente E. coli (121), levaduras (26), células de insectos empleando baculovirus (147), o células eucariotas mediante la infección con vectores víricos apropiados (143) o mediante transfección permanente. Las diferencias en la glicosilación cuando se prepara en cultivos celulares de bacterias, insectos o mamíferos pueden modificar la estructura de la proteína y su reactividad con el anticuerpo. Puede ser necesario extraer el antígeno de la célula o puede ser secretado. Frecuentemente es necesaria la purificación aunque no siempre. Una tendencia al alza en la producción de antígenos para la utilización en ensayos consiste en el desarrollo de antígenos peptídicos sintéticos. Esto permite que los antígenos se prueben como reactivos de diagnóstico basados en la secuencia génica, sin que sea necesaria la expresión de la proteína completa, lo que acorta el proceso. Un ejemplo es la producción de antígenos peptídicos de dos antígenos inmunodominantes, de los que se ha publicado que son candidatos prometedores a ser reactivos de diagnóstico para detectar la infección por M. bovis en vacas (172). En los últimos años, el uso de plantas para un sistema de expresión de la proteína parece prometedor. Para la expresión de antígenos candidatos en plantas, los virus de las plantas ofrecen, entre otras ventajas, la rapidez de elaboración del producto, la flexibilidad y los altos niveles de expresión del gen (48). Ya han sido determinadas las secuencias de genomas de cientos de bacterias y miles de virus. El gen de antígeno puede clonarse fácilmente con la tecnología de la PCR, utilizando cebadores diseñados a partir de la secuencia del nucleótido de especies estrechamente relacionadas (126). El gen también puede manifestarse y su producto puede purificarse utilizando un péptido apéndice. Entonces puede determinarse la antigenicidad de los productos del gen. El análisis sistemático del gen del antígeno in silico, a partir de los datos de la secuencia del genoma, acelera el desarrollo de los kits de diagnóstico y las vacunas (159). D. VACUNAS 1. Vacunas bacterianas con delección génica Durante la década pasada, la tecnología del ADN recombinante ha hecho posible la elaboración de vacunas más seguras. Las razones para esta mejor protección no están todavía claras, pero una podría ser que las vacunas Manual de la OIE sobre animales terrestres 2008 10 Capítulo 1.1.7. — Biotecnología en el diagnóstico de enfermedades infecciosas y el desarrollo de vacunas vivas son capaces de expresar antígenos in vivo necesarios para la protección que las preparaciones de las vacunas muertas no contienen. Otra razón podría ser que las vacunas vivas son capaces de estimular las células presentadoras de antígeno (APC) de una manera en la que las preparaciones de vacunas muertas son incapaces. Lo más probable es que se trate de un combinación de ambas, la expresión de nuevos antígenos y la interacción con APCs. La generación de las vacunas bacterianas vivas atenuadas se basa principalmente en la generación y la selección de mutantes mediante pases en serie en hospedadores animales alternos, el cultivo prolongado in vitro, cambios en la temperatura de crecimiento o modificación química, que resultan en atenuaciones indefinidas basadas en la acumulación de numerosas mutaciones genéticas. En algunos casos, por razones desconocidas, estos mutantes revierten al fenotipo de campo y, por tanto, no se pueden utilizar como vacunas (144). En 1981 Hosieth & Stocker (62), utilizando la tecnología del transposón, desarrollaron cepas de Salmonella typhimurium con mutaciones genéticas definidas de auxotrofía para aminoácidos aromáticos (Aro) que eran incapaces de sobrevivir en el hospedador inmunocompetente. Estas cepas pueden conferir protección contra el desafío virulento en el modelo murino de salmonelosis y en varias especies domésticas, aunque por razones desconocidas, no todos los mutantes son capaces de proporcionar protección en las especies domésticas (141). En 1992, Jones et al. (67) desarrollaron un mutante de Salmonella viva atenuada empleando la escisión genómica precisa de dos genes implicados en la ruta de los aminoácidos aromáticos, que tuvo como resultado incluso una menor probabilidad de reversión de la cepa al fenotipo de campo. Este mutante demostró ser una vacuna con efectos secundarios clínicos relativamente leves y capaz de conferir protección en vacas contra el desafío virulento a la edad a la que el hospedador es más susceptible. Esta cepa de la vacuna también se ha utilizado como vector de transmisión de otros antígenos foráneos, lo cual acerca a la realidad el ideal de una vacuna de dosis única (170). El desarrollo en el campo de la biología molecular y un mayor conocimiento de la interacción hospedador-patógeno permitirá el diseño racional de vacunas más seguras y eficaces con marcadores que permitirán distinguir entre hospedadores vacunados e infectados. Aunque la mayoría de las explicaciones descritas aquí se centran en Salmonella, se han aplicado tecnologías similares a otras bacterias patógenas. Se ha utilizado la tecnología en la tuberculosis bovina; si el ganado está vacunado con BCG, el cóctel de péptidos ESAT-6/CFO-10 detecta los animales infectados, no vacunados, con el ensayo de gamma IF. 2. Vacunas marcadas y pruebas diagnósticas complementarias En salud animal, se puede vacunar a los animales con objeto de prevenir la enfermedad o bien intentar eliminar la infección a través de la aplicación estricta de medidas sanitarias tales como el sacrificio de los animales infectados y evitando el contacto con otros animales. Para ciertas enfermedades de las que no existe vacuna (p.ej. fiebre porcina africana) y particularmente para las infecciones zoonósicas (p.ej. infección de cerdos por el virus Nipah), la única solución disponible es el sacrificio sistemático de los animales infectados. El diagnóstico de la infección es de importancia extrema cualquiera que sean las medidas que se tomen para combatir la enfermedad. El diagnóstico puede ser directo, a través de la detección e identificación del agente infeccioso utilizando técnicas inmunológicas o moleculares, o indirecto, basado en la detección de anticuerpos específicos contra el agente infeccioso sospechoso. Los últimos métodos tienen como desventaja principal el que se deba esperar hasta que se sinteticen los anticuerpos por parte del animal después de la infección y generalmente no permiten distinguir entre la respuesta inmune humoral resultado de una infección o de una vacunación. Este problema se puede solventar adoptando nuevas estrategias en el desarrollo de las vacunas (105) utilizando tecnologías moleculares que permiten la producción de vacunas marcadas asociadas con pruebas diagnósticas complementarias. Actualmente existen dos tipos: las basadas en la detección de una respuesta serológica contra una proteína cuyo gen delectivo en la cepa de la vacuna (empleada como vacuna replicante o como vacuna inactivada derivada de tal cepa de vacuna vírica delectiva), o en la detección de la respuesta serológica frente a proteínas víricas no estructurales (vacunas inactivadas purificadas). En el caso de las vacunas delectivas el gen que codifica la proteína no esencial, la característica marcadora, está siempre unido con la prueba de detección mientras que en el caso de vacunas de subunidades (p.ej. la proteína E2 del virus de la peste porcina clásica expresada en baculovirus) otras proteínas víricas distintas pueden ser seleccionadas como marcadores de los ensayos. Con fines de armonización, debería elegirse una proteína consenso para la prueba (p.ej. la proteína gE del virus de la pseudorabia). En el primer tipo de vacunas marcadas, debería utilizarse siempre un marcador negativo puesto que un marcador positivo, por ejemplo a través de la inserción de un gen que codifica una proteína foránea, no es adecuado; este último tipo de vacuna sólo podría mostrar si el animal está vacunado pero no indicaría si también se infectó con el virus de campo. La vacuna marcada que se utilice con la intención de discriminar una respuesta serológica resultante de una vacunación de la de una infección tendría que estar siempre asociada con una prueba de diagnóstico complementaria que se pueda emplear durante una campaña profiláctica con el fin de eliminar el agente infeccioso. Las vacunas previas de uso veterinario se diseñaron principalmente para prevenir los signos clínicos en los animales después de la infección sin tener demasiado en cuenta el impacto epidemiológico de la vacunación en la excreción del virus de campo después de la infección y en su posible diseminación o circulación. Si se utilizan vacunas marcadas con objeto de eliminar un virus se debe tener claro el posible impacto en la epidemiología de la infección. Puede haber problemas con este enfoque, por ejemplo si se inhibe la multiplicación del virus de campo hasta el punto de que no se induzca la síntesis de anticuerpos específicos en todos los animales vacunados. Por tanto, la Manual de la OIE sobre animales terrestres 2008 11 Capítulo 1.1.7. — Biotecnología en el diagnóstico de enfermedades infecciosas y el desarrollo de vacunas mayoría de las vacunas marcadas disponibles sólo se pueden utilizar para la certificación de rebaños y no para conseguir la de animales individuales. a) Vacunas marcadas con delección de un gen: los ejemplos de la pseudorabia y la rinotraqueítis infecciosa bovina La pseudorabia en cerdos y la rinotraqueítis infecciosa bovina son dos infecciones causadas por herpesvirus que se vuelven latentes en el animal, incluso aunque ya esté vacunado (111, 115, 116). Se dispuso de la primera vacuna marcada para prevenir la infección de cerdos por pseudorabia (165) después de que Bartha desarrollara en Hungría (7) una cepa atenuada del virus que la causa, que presentaba una delección espontánea en la glicoproteína gE. Más tarde se han desarrollado vacunas análogas para la rinotraqueítis infecciosa bovina. Como se menciona más arriba, el herpesvirus responsable de la rinotraqueítis infecciosa bovina permanece latente después de la infección, haya sido o no vacunado el animal. No importa si la vacuna es del tipo inactivado o atenuado, de cualquier manera el animal se convierte en portador latente después de la infección con un virus de capo. Además, todas las cepas de vacuna atenuada establecen latencia después de la vacunación, incluida las cepas delectivas en la gE. Se debería tener in mente que las vacunas atenuadas producidas con cepas idénticas, delectivas o no, generalmente son más eficaces que las equivalentes inactivadas (18, 69, 70). En una zona en la que esté prohibida la vacunación, todos los animales sero-positivos en cuanto al virus de la rinotraqueítis infecciosa bovina se deben considerar como potencialmente infectados y portadores latentes del virus de campo. De manera similar, en una zona en la que se vacunen los animales con una vacuna convencional (no delecctiva), sea atenuada o inactivada, es imposible distinguir entre vacas vacunadas e infectadas de modo que si está preparado un programa de eliminación, también deben ser eliminados del rebaño todos los animales sero-positivos. Una solución es la utilización de una vacuna marcada o delectiva que permite la diferenciación del anticuerpo producido por la vacuna frente al producido por la infección. La proteína delectiva de la cepa vacunal debe tener las siguientes características: 1) Ser una proteína estructural, para que sea capaz de producir vacunas inactivadas; 2) No ser esencial con objeto de poder producir la vacuna; 3) No ser un inmunógeno protector esencial con el fin de que sea todavía una vacuna eficaz; 4) Inducir una respuesta humoral significativa y de larga duración si está presente para que se pueda utilizar (cuando se deleccione) como marcador; 5) Estar presente en todas las cepas del virus de campo; 6) Inducir una respuesta inmune humoral o celular por un patógeno en los animales ya vacunados. Si se emplea una vacuna marcada, siempre que un animal sea sero-positivo hacia la proteína delectiva, se debería considerar infectado y ser eliminado. La proteína gD de herpesvirus, que es un inmunógeno protector fundamental, no se puede suprimir pero en cambio puede ser utilizada para desarrollar vacunas de subunidades. El problema principal que se encuentra con el empleo de las vacunas marcadas contra la rinotraqueítis infecciosa bovina es su incapacidad para prevenir completamente la circulación del virus de campo cuando se utiliza dentro del marco de un programa de eliminación. No se dispone de vacunas que induzcan una inmunidad estéril para estas enfermedades. Como consecuencia el calendario de vacunación debe ser más riguroso que uno convencional diseñado meramente para impedir los signos clínicos en el rebaño. Se debe repetir la vacunación de acuerdo con un programa estricto para reducir la posibilidad de excreción del virus de campo y debe, además, estar asociada con medidas sanitarias completas (79). Dentro del marco de una campaña de eliminación vírica coordinada, la vacunación debe prevenir la excreción del virus de campo de los animales sin experiencia previa y evitar la re-excreción de los animales con infección latente. En Holanda se ha investigado bajo condiciones de campo la eficacia de una vacunación repetida utilizando una vacuna negativa gE inactivada que se administra por vía intramuscular. Este estudio ha demostrado la incidencia significativamente reducida de seroconversión contra el virus de campo en el grupo vacunado al compararlo con los animales de control inyectados con placebo. Además, la circulación del virus de campo, aunque no se restringió completamente, no obstante fue reducida significativamente (18) y bajo algunas circunstancias incluso se evitó (166). Manual de la OIE sobre animales terrestres 2008 12 Capítulo 1.1.7. — Biotecnología en el diagnóstico de enfermedades infecciosas y el desarrollo de vacunas b) Vacunación contra la peste porcina clásica con vacunas de subunidades En la Unión Europea se ha establecido un programa de eliminación de la peste porcina clásica. Actualmente, está prohibida la vacunación que utiliza las vacunas convencionales y se encuentra en vigor una política de sacrificio. Esta política está desafiada por la existencia de una relación antigénica fuerte con otros pestivirus, tales como el virus responsable de la diarrea vírica bovina (DVB/MD), que impide el diagnóstico serológico, por la circulación insidiosa de cepas hipovirulentas (14) y, por último pero no menos importante, por la presencia de un reservorio silvestre en el jabalí (Sus scrofa) en Europa continental (5). Las vacunas convencionales clásicas tuvieron una eficacia probada (123) e incluso evitaron la emergencia de portadores asintomáticos cuando eran de potencia suficiente (15, 74). Las vacunas vivas atenuadas eran más eficaces que sus equivalentes inactivadas a este respecto (31) y contribuyeron en gran medida a la eliminación de la enfermedad. Su única desventaja era la creación de una población de animales seropositivos, lo que no es aceptable si se pone en marcha un plan de sacrificio. Recientemente se han desarrollado vacunas de subunidades mediante la expresión de la proteína E2, un inmunógeno fundamental del virus de la fiebre porcina clásica, ya sea en un sistema baculovirus (van Rijn, 1999 129 /id}) o en virus vaccinia o pseudorabia (E1) (132, 168). La vacuna constituida por la proteína E2 expresada en baculovirus permite distinguir los animales infectados de los vacunados cuando se utiliza con pruebas diagnósticas complementarias fiables para detectar la presencia de anticuerpos específicos dirigidos contra otros inmunógenos fundamentales del virus de la fiebre porcina clásica no presentes en la vacuna de subunidades, tales como la proteína NS2, una proteína vírica conservada. Desafortunadamente, las vacunas inactivadas no son lo suficientemente eficaces desde el punto de vista epidemiológico (37) si se las compara con las vacunas convencionales anteriores (35, 163). Además, las pruebas de diagnóstico complementarias disponibles en la actualidad no son del todo fiables y, por tanto, limitan el uso de estas vacunas de subunidades en el campo. c) Vacunación contra la fiebre aftosa utilizando vacunas con un grado de purificación elevado Desde 1991 en la Unión Europea se ha prohibido la vacunación preventiva. Esta prohibición concluyó periodo de vacunación de 30 años y, por consiguiente, en la actualidad existen en Europa rebaños de bovinos completamente susceptibles (149). Esta situación es particularmente nociva cuando la enfermedad se reintroduce de manera accidental (39). El plan de contingencia que se ha desarrollado para ocuparse de los brotes inesperados se basa principalmente en la información y preparación de los socios colaboradores de la Unión Europea. Con vistas a superar los riesgos asociados con la susceptibilidad completa de los ganados europeos, se han establecido bancos de vacunas del antígeno vírico altamente purificado y concentrado (135) y existe la posibilidad de utilizarlas como vacunas marcadas en el caso de un brote de emergencia (34). Considerando que se utilizan vacunas muy purificadas, siempre que se encuentre un animal sero-positivo frente a las proteínas no estructurales (NSP) codificadas por el virus utilizando una prueba de diagnóstico ELISA (kit 33), es posible entonces que se deba a la infección por un virus de campo. La NSP se produce durante la replicación del virus en el animal infectado y en el cultivo celular. La NSP se debe extraer del antígeno del FMDV por purificación durante la producción de la vacuna y debe realizarse una prueba apropiada de los antígenos para demostrar la ausencia de seroconversión a NSP en los animales vacunados. Las NSP se sintetizan al mismo nivel que las proteínas estructurales durante la infección y por eso producen una buena respuesta inmune humoral. Los animales infectados se convierten en seropositivos a la NSP y los anticuerpos contra la NSP se detectan generalmente utilizando los kits de diagnóstico ELISA o el EITB. Desafortunadamente, las pruebas de diagnóstico complementarias disponibles en la actualidad sólo permiten la certificación de la ausencia de la fiebre aftosa a nivel de rebaño y no a nivel de animal individual. Cuando ocurre la multiplicación del virus y no están presentes en los viriones extracelulares utilizados para producir las vacunas purificadas e inactivadas. d) Gripe equina como un caso especial Se ha aplicado un enfoque similar al utilizado para la FA, en un contexto diferente, para la gripe equina (110). Cuando se llevan a cabo estudios acerca de la duración de la inmunidad protectora con las vacunas inactivadas de la gripe equina, es útil tener una herramienta de diagnóstico que permita la exclusión de los anticuerpos debidos a la infección intercurrente de los animales experimentales mediante un virus de campo de la influenza. Se ha desarrollado una prueba de diagnóstico (13) basada en la respuesta serológica a una proteína no estructural codificada por el virus. 3. Vacunas con vectores víricos Muchas especies víricas, entre ellas el adenovirus, el herpesvirus y el poxvirus, se han utilizado como sistemas de transmisión (vectores) para antígenos foráneos. Se puede utilizar el virus simplemente como un vector, por ejemplo el virus recombinante vaccinia-rabia, o como vector y vacuna contra la infección mediante el propio vector silvestre. Un ejemplo de un virus que actúa como vector y como vacuna por sí mismo, es el capripoxvirus Manual de la OIE sobre animales terrestres 2008 13 Capítulo 1.1.7. — Biotecnología en el diagnóstico de enfermedades infecciosas y el desarrollo de vacunas recombinante que expresa un antígeno del virus de la peste de los pequeños rumiantes (11). Un virus vector puede experimentar un ciclo completo de multiplicación que conduce a la producción de los virus de la progenie o un ciclo de multiplicación abortivo sin producción de progenie, como sucede en el caso del vector avipoxvirus en especies de mamíferos. Los vectores más habitualmente utilizados son los poxvirus y, por tanto, este capítulo se centrará en la utilización de los poxvirus como vectores vacunales (117). Varias características hacen que los poxvirus recombinantes sean adecuados para ser vacunas: i) La estabilidad de la vacuna liofilizada (28), su coste reducido, y la facilidad de producir y administrar; ii) La vacuna se puede administrar por varias vías (46) e incluso en el caso del virus vaccinia se ha demostrado que se puede administrar el virus per os (esta característica se ha utilizado para la vacunación de la fauna salvaje) (113); iii) La capacidad de inducir tanto respuesta de anticuerpos como de linfocitos T citotóxicos contra el antígeno foráneo de forma que se consigue una inmunización de larga duración después de una sola inoculación (142, 143); iv) La flexibilidad de empaquetado del genoma, que permite que cantidades importantes de él se pierdan o deleccionen y que se pueda insertar ADN foráneo en su lugar (al menos 25 kb), lo que hace posible la creación de vacunas multivalentes (118, 119, 142, 143); v) El uso de poxvirus recombinantes como vacunas permite la discriminación entre los animales infectados de forma natural y los vacunados ya que la vacuna recombinante exhibe un subconjunto definido de antígenos de los patógenos correspondientes. Dentro de cada género de la familia Poxviridae los miembros están relacionados antigénicamente (90). Esta relación antigénica ha planteado una cuestión importante en relación con la utilización de vectores derivados de poxvirus como vacunas vivas, ya que la inmunidad preexistente contra el vector podría reducir el éxito de una vacunación siguiente llevada a cabo con un vector poxvirus homólogo (30, 73). Para solventar este problema, se ha implementado la utilización de combinaciones diferentes de vectores y/o vías de inmunización (45, 125). a) Virus vaccinia como vector El primer vaccinia recombinante para uso de campo es la vacuna recombinante vaccinia-rabia (VRG) utilizada para la vacunación oral de zorros contra la rabia. Se desarrolló empleando la cepa Copenhagen y una vez que se probó en varias especies diana potenciales bajo condiciones de laboratorio (20, 112, 155), finalmente en 1987 se utilizó bajo condiciones de campo (114) y demostró ser segura y eficaz (20). Se ha empleado a gran escala en diversos países europeos que, como consecuencia, se han liberado de la rabia (19) al igual que en Norteamérica. Se puede incrementar la inocuidad del virus vaccinia mediante delecciones génicas múltiples. Se ha demostrado con la construcción de la cepa NYVAC del virus vaccinia (152). Se eligió la cepa Copenhagen del virus vaccinia como sustrato de vacuna y basándose en la secuencia completa del ADN (49), el conocimiento extenso de los genes relacionados con la virulencia y de los genes que determinan la competencia de replicación en el rango de hospedadores, se perdió la información genética no deseada del genoma vírico de una manera muy precisa. El virus resultante, denominado NYVAC, presenta 18 marcos abiertos de lectura delectiva comparado con la cepa parental. NYVAC está muy atenuado como se ha demostrado en muchos estudios con animales. La inoculación intracraneal del ratón lactante y del adulto joven demostró un rango de dosis muy favorable comparado con la cepa parental y otras cepas vaccinia. Lo más significativo es que no existe diseminación del virus en hospedadores inmunocomprometidos. NYVAC tiene reducida de forma drástica la capacidad de replicación en una variedad de células de cultivo de tejido humano y es incapaz de producir partículas infecciosas en el hombre. Varios ensayos en animales y en el hombre han demostrado la inocuidad de los vectores derivados de la cepa NYVAC (108, 151, 176). b) Vectores avipoxvirus Cuando se considera el desarrollo de vectores derivados de avipoxvirus para la producción de vacunas para aves, se recomienda la utilización de cepas atenuadas con objeto de reducir el probable riesgo y las consecuencias potenciales que surgen de la propagación ambiental a otras especies aviares. Se han probado extensamente derivados atenuados del virus de la viruela aviar, como el TROVAC, y canarypoxvirus, como el ALVAC, y se ha demostrado que son seguros en varias especies, entre ellas animales inmunocompromentidos y voluntarios humanos. Estos virus se pueden emplear bajo condiciones de seguridad de laboratorio de nivel 1, la categoría más baja para organismos recombinantes (109). Manual de la OIE sobre animales terrestres 2008 14 Capítulo 1.1.7. — Biotecnología en el diagnóstico de enfermedades infecciosas y el desarrollo de vacunas A pesar del hecho de que su multiplicación se encuentra reducida a especies aviares, se ha demostrado que las cepas atenuadas de avipoxvirus son vectores eficaces y extremadamente seguros para mamíferos. La inoculación en células de mamífero de recombinantes basadas en avipoxvirus, tiene como resultado la expresión del gen foráneo y la inoculación en especies de mamíferos induce inmunidad protectora sin que se produzcan los virus de la progenie (153, 154). Esta observación demuestra que tienen una ventaja significativa de seguridad para ser utilizada en el hombre y en los animales. Puesto que la inmunización se puede conseguir en ausencia de una replicación productiva, se elimina el riesgo de diseminación del vector entre los vacunados y, por tanto, la propagación del vector por contacto a individuos no vacunados o al ambiente en general. Además, el uso de este vector en especies que no son reservorio de avipoxvirus hace que la probabilidad de recombinación in vivo sea nula. Adicionalmente, estos vectores se pueden utilizar para vacunar individuos con inmunidad preexistente hacia el virus vaccinia. En la pasada década, se ha producido una cantidad abundante de virus recombinantes empleando la cepa canarypoxvirus atenuada ALVAC como cepa parental. Un número importante de ensayos, tanto en humanos como en animales, ha demostrado la eficacia protectora y la inocuidad de las vacunas utilizando este vector. 4. Vacunas de ADN La vacunación con ADN consiste en la introducción directa en las células del hospedador de un plásmido de ADN bacteriano que expresa una proteína antigénica bajo el control de un promotor de la célula eucariótica (129). Como consecuencia de esto, se expresa el antígeno foráneo dentro de la célula hospedadora y puede estimular la inducción de respuestas humoral e inmune mediada por células. Este enfoque de la vacunación ha sido efectivo contra una variedad amplia de virus, bacterias y parásitos y no sólo tiene muchos de los beneficios de las vacunas vivas, sino que también tiene varias ventajas frente a estrategias más convencionales de vacunación. Por ejemplo, las vacunas de ADN que codifican genes foráneos son baratas y fáciles de producir; obvian la necesidad de complejos con organismos portadores; están ausentes los riesgos asociados con vacunas vivas; y se impide el impacto de la inmunidad preexistente hacia el organismo o vector en la eficacia de la vacuna. Sin embargo, una desventaja de la vacunación con ADN es que, como el plásmido persiste durante mucho tiempo, existe la posibilidad de una integración cromosómica teniendo como resultado la transformación celular. La respuesta inmune de las vacunas de ADN se puede mejorar adicionalmente mediante la inoculación simultánea de inmunoestimuladores, tales como las secuencias motivo CpG (122), plásmidos que expresen citoquinas (178), plásmidos que expresen moléculas co-estimuladoras (85), o incluso adyuvantes convencionales (167). También se puede mejorar la inmunogenicidad utilizando como inductor primero una vacuna de ADN plasmídico que exprese una proteína inmunogénica y posteriormente el refuerzo siguiente con la proteína o con un vector vírico recombinante que exprese la proteína, estrategia de combinación llamada “inducciónpotenciación” (prime-boost) (171). Actualmente se están desarrollando diversas vacunas de ADN para uso veterinario en vacas, cerdos y aves de corral (100, 106, 167). El ADN innovador del Oeste del Nilo es una nueva vacuna para caballos que ayuda a la prevención de la viremia causada por el virus potencialmente mortal del Oeste del Nilo; esta vacuna representa un gran hito en la tecnología y la ciencia del ADN. La administración del ADN se realiza por vía intramuscular, intradérmica, o intranasal; la administración intradérmica está mediada por partículas empleándose una “pistola de genes”, en la que el ADN recubre microesferas de oro (82), o se puede efectuar utilizando bacterias intracelulares atenuadas, tales como Shigella flexneri o Salmonella typhimurium (38). Las vacunas bacterianas atenuadas vivas permiten la vacunación a través de las superficies mucosas y apuntar de forma específica al antígeno presentando células localizadas en los sitios inductivos del sistema inmune. Mientras este último enfoque tiene varias ventajas, existen varias cuestiones de seguridad que se necesitan tratar antes de aceptar este método de administración. Deberían tenerse presentes las desventajas de la vacunación de ADN: estas incluyen la posibilidad de una reintegración cromosómica con la consiguiente transformación celular ya que el plásmido persiste en el hospedador durante un largo tiempo, aunque este riesgo es bajo. Otra estrategia de vacunación con ADN se basa en la utilización de un vector de ADN que consiste en el ADNc del virus recombinante Semliki Forest (SFV) bajo el control de un promotor eucariótico y que expresa un gen foráneo (9). A diferencia de los vectores de ADN convencionales, el promotor no controla directamente la expresión del antígeno foráneo, sino que dirige la síntesis de un trascrito de ARN replicón del SFV recombinante. La traducción de esta molécula de ARN produce un complejo replicasa del SFV que permite la replicación del ARN en el citoplasma celular y tiene como resultado la producción a nivel elevado del ARNm que codifica el antígeno foráneo. Puesto que la expresión mediada por el vector SFV es transitoria y lítica, existe menos riesgo de posible integración cromosómica. Las aplicaciones de la tecnología de cromosomas bacterianos artificiales (BAC) ofrece posibilidades para la manipulación de grandes genomas de virus de ADN, tales como herpesvirus (2, 23). El uso de clones BAC de herpesvirus no sólo es una poderosa herramienta para el estudio de las funciones y la patogénesis de los genes víricos (173), sino que también tiene un gran potencial para el desarrollo de la vacuna herpesviral (94). Los estudios experimentales en los que se utilizan clones BAC como vacunas para las infecciones por herpesvirus Manual de la OIE sobre animales terrestres 2008 15 Capítulo 1.1.7. — Biotecnología en el diagnóstico de enfermedades infecciosas y el desarrollo de vacunas han resultado prometedores (120, 150, 157). Esta tecnología para la generación de vacunas nuevas de herpesvirus tendrá un gran impacto y aplicación en la medicina veterinaria. 5. Otros avances en la tecnología de las vacunas Las vacunas de subunidades, que contienen componentes proteicos o glicoproteicos purificados de un patógeno que se han identificado que portan epítopos críticos implicados en la inducción de una respuesta inmune protectora (6) presentan distintas ventajas en cuanto a la inocuidad y los avances recientes en su producción empleando la tecnología del ADN recombinante pueden facilitar su utilización más amplia (36). También se han diseñado vacunas peptídicas sintéticas (87), sin embargo hasta el momento no han demostrado ser muy efectivas en la inducción de protección frente a enfermedades infecciosas. Pueden existir muchas razones por las que los péptidos sintéticos no puedan inducir inmunidad protectora. Por ejemplo, incluso los llamados péptidos lineales muestran un grado de flexibilidad conformacional de modo que adoptan una estructura diferente de aquella de la molécula parental y, por tanto, inducen anticuerpos de avidez baja frente al patógeno en cuestión. Una desventaja potencial del uso de péptidos que representan sitios antigénicos únicos para estimular una respuesta de anticuerpos protectora, es la posibilidad de seleccionar mutaciones antigénicas en el patógeno. Se han desarrollado varias estrategias para inducir respuestas de los linfocitos T citotóxicos (CTL) empleando péptidos, tal como acoplar epítopos CTL a toxinas que son capaces de invadir células eucarióticas o construir partículas tipo virus que porten epitopos CTL foráneos (137, 140). Sin embargo, la utilidad de este enfoque en poblaciones híbridas se encuentra limitada por el polimorfismo de las moléculas del complejo principal de histocompatibilidad. A partir de partículas producidas procedentes del gen TYA del retrotransposón Ty de levaduras se han preparado otras vacunas con partículas tipo virus que implican proteínas de autoensamblaje que se pueden utilizar para transportar antígenos foráneos (47). Una vacuna compuesta por partículas tipo virus vacías producidas mediante la expresión de las cuatro proteínas estructurales principales del virus de la lengua azul en baculovirus, ha demostrado que protege contra el desafío con el virus de la lengua azul (131). Otro enfoque interesante consiste en el desarrollo de “vacunas comestibles”. Se pueden diseñar plantas que expresan una cantidad de proteínas foráneas y pueden expresar transgenes múltiples en un momento dado (148). La administración oral de las vacunas de subunidades expresadas en plantas sería de particular interés para proteger contra los patógenos intestinales. Una desventaja sería que los antígenos administrados por vía oral fueran susceptibles a degradación proteolítica. Además, la administración oral de los antígenos tiende a producir tolerancia en vez de inmunidad activa. Sin embargo, la tolerancia se puede solventar mediante la expresión de una proteína de fusión compuesta por el antígeno con la subunidad B de la enterotoxina termolábil (LT-B) de E. coli (56). La clonación del genoma vírico completo ha sido posible por la genética inversa, especialmente la del virus con ANR de polaridad negativa. Mediante la genética inversa puede clarificarse la función de varias NSP, así como la de la función oculta de las proteínas de virión. De esta manera se facilita la construcción del virus ARN por tecnología recombinante. Esta también permite la identificación de la estrategia de escape utilizada por el virus para evitar los mecanismos de defensa del hospedador, como el interferón (51, 164). La genética inversa también proporciona un enfoque novedoso para la atenuación de los virus mediante la supresión de los anti-IFN o de las funciones de las citoquinas de los virus (195). La genética inversa se puede aplicar a los virus ARN que tienen una estructura genómica relativamente simple, como los virus de la gripe aviar. Se ha observado que la presencia de residuos de aminoácidos en el sitio de escisión del gen de la hemoaglutinina ayuda al virus de la gripe aviar a replicarse dentro del animal. Por el contrario, los virus de la gripe aviar altamente patógena, que tienen este tipo de estructura genética, pueden atenuarse removiendo de ese sitio el residuo de aminoácido básico (81, 95). REFERENCIAS 1. AANSTOOT H.J., KANG S.M., KIM J., LINDSAY L.A., ROLL U., KNIP M., ATKINSON M., MOSE-LARSEN P., FEY S., LUDVIGSSON J., ET AL. (1996). 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