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CROMOSOMA 12 12 pter Pallister-Killan Region syndrome Doble Fusión t(5;12)(q33;p13)[PDGFRB/ETV6] Doble Fusión t(12;21)(p13;q22)[ETV6/RUNX1] Pintado Cromosómico Total 12 Break Apart 12p13[ETV6] EN 12 12 qter Lexel in Vitro www.lexelmedical.com Inicio Cromosoma 12 Sonda Sub-telomérica 12pter 12p13.33 156Kb SLC6A13 JARID1A Sondas Telómero-Específicas (STM): El telómero es el final de cada cromosoma eucariota. Dos de las principales funciones de un telómero son evitar la pérdida de DNA como consecuencia de la replicación y prevenir interacciones con los telómeros de otros cromosomas. Así, estas estructuras juegan un papel principal en el mantenimiento de la estabilidad cromosómica. Se ha propuesto que las aberraciones cromosómicas que involucran telómeros tienen consecuencias fenotípicas muy severas ya que contienen la mayor densidad génica del genoma. Es muy importante entonces detectar anomalías teloméricas para identificar los genes involucrados en estas patologías. LIVe ofrece un set completo de sondas sub-teloméricas que hibridan sobre regiones muy ricas en genes de los brazos p y q de cada cromosoma. Lexel in Vitro www.lexelmedical.com Inicio Cromosoma 12 Sonda Duplicación Pallister-Killan 156 Kb 12p13.33 Control 12qter Lexel in Vitro www.lexelmedical.com El síndrome Pallister-Killan es causado por un desorden cromosómico caracterizado por tetrasomía 12p como consecuencia de un isocromosoma. Este material extra es generalmente encontrado en mosaico y su presencia está casi exclusivamente restringida a fibroblastos, lo cual permite detectar tempranamente esta anomalía en muestras de líquido amniótico. LIVe diseñó el kit MD12p compuesto por una sonda específica para 12p33 y un control sobre 12qter. Este kit está especialmente optimizado para lograr resultados óptimos en muestras de isopado bucal o cualquier tipo de muestra celular sin procesar (células con citoplasma). Inicio Cromosoma 12 Lexel in Vitro www.lexelmedical.com PDGFR β 5q33 427 Kb ETV6 12p13 427 Kb Oncológica Doble Fusión t(5;12)(q33;p13)[PDGFRB/ETV6] La sonda Doble Fusión t(5;12)(q33;p13)[PDGFRB/ETV6] hibrida varios kilobases de las regiones 5q33 y 12p13 incluyendo los loci PDGFRβ y ETV6. Están diseñadas para generar, en caso de estar presente la translocación 5;12, dos señales de fusión amarillas (por proximidad de los fluorocromos rojo y verde) además de una señal roja y una verde proveniente de los alelos normales. Esta sonda es comúnmente utilizada en síndromes mieloproliferativos/ mielodisplásicos con eosinofilia. Al igual que el resto de las sondas LIVe, el kit incluye un Buffer de Hibridación modificado que permite obtener resultados con apenas 30 minutos de incubación a 45ºC y los reactivos necesarios para preparar la solución de montaje (antifade + DAPI). Este kit puede adquirirse en sus presentaciones de 5, 10 o 20 determinaciones. Inicio Cromosoma 12 Oncológica Doble Fusión t(12;21)(p13;q22)[ETV6/RUNX1] 1012 Kb ETV6 427 Kb Lexel in Vitro www.lexelmedical.com RUNX1 La sonda Doble Fusión t(12;21)(p13;q22)[ETV6/RUNX1] hibrida varios kilobases de las regiones 12p13 y 21q22 incluyendo los loci ETV6 y RUNX1 (también llamado AML1). Están diseñadas para generar, en caso de estar presente la translocación 12;21 dos señales de fusión amarillas (por proximidad de los fluorocromos rojo y verde) además de una señal roja y una verde proveniente de los alelos normales. Al igual que el resto de las sondas LIVe, el kit incluye un Buffer de Hibridación modificado que permite obtener resultados con apenas 30 minutos de incubación a 45ºC y los reactivos necesarios para preparar la solución de montaje (antifade + DAPI). Este kit puede adquirirse en sus presentaciones de 5, 10 o 20 determinaciones. 12p13 Inicio Cromosoma 12 383 Kb ETV6 178 Kb Oncológica Break Apart 12p13 [ETV6] Lexel in Vitro www.lexelmedical.com La sonda oncológica Break Apart 12p13 está diseñada con el fin de detectar cualquier ruptura en el gen ETV6. La sonda distal (fluorocromo rojo) hibrida sobre la mitad 5’ del gen ETV6 dejando un espacio de 138Kb hasta el comienzo de la sonda proximal (fluorocromo verde). No obstante, en el alelo normal esta distancia es suficiente para generar una señal de fusión amarilla (por proximidad de los fluorocromos rojo y verde). En los casos en los que el gen sufre una translocación, independientemente del derivado que genere, las señales roja y verde se separan y se observan individualmente. Al igual que el resto de las sondas LIVe, el kit incluye un Buffer de Hibridación modificado que permite obtener resultados con apenas 30 minutos de incubación a 45ºC y los reactivos necesarios para preparar la solución de montaje (antifade + DAPI). Este kit puede adquirirse en sus presentaciones de 5, 10 o 20 determinaciones. Inicio Cromosoma 12 12p11 160Kb Sonda Enumeración 12 SHGC-16687 D12S1307 Sondas de Enumeración (EN): Las sondas de Enumeración cromosómica son sondas de DNA específicas para regiones peri-centroméricas. Debido a que no involucran ningún tipo de secuencias satelitales su especificidad es muy alta aún en condiciones de baja astringencia. En interfases generan señales definidas y de menor tamaño que las clásicas sondas satelitales, disminuyendo notablemente la superposición de señales. Todas las sondas EN están disponibles en fluorocromo rojo o verde. Lexel in Vitro www.lexelmedical.com Inicio Cromosoma 12 Sonda Sub-telomérica 12qter Sondas Telómero-Específicas (STM): El telómero es el final de cada cromosoma eucariota. Dos de las principales funciones de un telómero son evitar la pérdida de DNA como consecuencia de la replicación y prevenir interacciones con los telómeros de otros cromosomas. Así, estas estructuras juegan un papel principal en el mantenimiento de la estabilidad cromosómica. Se ha propuesto que las aberraciones cromosómicas que involucran telómeros tienen consecuencias fenotípicas muy severas ya que contienen la mayor densidad génica del genoma. Es muy importante entonces detectar anomalías teloméricas para identificar los genes involucrados en estas patologías. LIVe ofrece un set completo de sondas sub-teloméricas que hibridan sobre regiones muy ricas en genes de los brazos p y q de cada cromosoma. ZNF26 174 Kb ZNF84 ZNF140 12q24.33 Lexel in Vitro www.lexelmedical.com Inicio Cromosoma 12 Sonda Pintado Cromosómico Total 12 PCT 12 Sonda de Pintado Cromosómico Total (PCT): Las sondas de pintado cromosómico total abarcan completamente el cromosoma blanco generando una señal de intensidad entre media-alta y alta. Estas sondas pueden ser mezcladas con cualquier otra sonda de LIVe sin que esto disminuya su intensidad o especificidad. Todas las sondas PCT están disponibles en fluorocromo rojo o verde. Al igual que el resto de las sondas LIVe, incluye un Buffer de Hibridación modificado que permite obtener resultados con apenas 30 minutos de incubación a 45ºC y los reactivos necesarios para preparar la solución de montaje (antifade + DAPI). Esta sonda puede adquirirse en sus presentaciones de 5, 10 o 20 determinaciones. Lexel in Vitro www.lexelmedical.com